graphpad 作图教程 | 不会 R 语言,也能做出漂亮的小提琴图!
丁香通
我们都知道,小提琴图能显示数据的集中与离散程度,数据越集中图形越胖。另外,其箱线图可用来展示中位数和四分位数。
一般来说呢,R 语言绘制小提琴图更佳,但是 R 语言学习代价太高,科研小白难以掌握,所以我们该如何绘制小提琴图呢?
具体的操作步骤:
先说明一下哈,本次教程使用的是 graphpad prism 8.0 ,界面美观系统,功能强大。
1. 进入软件→ New table&graph → Column → Data table → Enter or import data a new table → Options → Enter replicated values → stacked into columns → Create
2. 在 Data 1 中输入数据
3. Graphs → Data1 → Graph family → Column → Box and violin(具体选哪一个看个人需要)
4. 初步设置和美化:双击小提琴图→ Format Graph → Show all points
5. 双击小提琴图→ Format Graph → Symbols(设置点颜色+形状+大小)
6. 双击小提琴图→ Format Graph → Violin plot (设置填充颜色+边界厚度+颜色)
注:关于边界厚度,我在示例中的选择是随机的,为了图片演示的需要,实际选择的时候还是要根据图的具体情况,最重要的是审稿人的要求。
7. Fill pattern 选择「填充模式」
8. Format Graph → 四分位数及中位数 → 颜色,线条模式,线条厚度
9. 双击坐标轴,可以进一步调整坐标轴的刻度,最大最小值等
10. 添加差异线+文本:Draw→ Lines with text → 连接线的正中间可以添加 ns 文本、差异标记#、##、###
差异线可以自由调整位置:
如果想更换图形,可在原基础上直接选定:
tiff 图片最大 dpi 可达 1200;最大宽度提升至 25 英寸,简直是福音呀~
如果还想对图片进行进一步修饰加工,必要时还可以借助 PS 等软件,会收到意想不到的效果哦!