人类基因组中发现的序列周期性
巴黎高等师范学院的Charles Hebert和Hugues Roest Crollius在《基因组生物学》杂志上发表的一篇文章中指出,人类基因组中存在一种新的核苷酸频率周期性,这可能会对核小体的定位和基因调控产生影响。
在他们的研究中,Hebert和Roest Crollius将人类基因相对于转录起始位点进行排列,并观察到YY二核苷酸的模式(其中Y为C或T),与转录起始位点在相位上间隔10个碱基对。重要的是,对核小体定位数据的分析表明,核小体与二核苷酸有关。该模式是丰富的基因与结合位点的EP300核小体建模蛋白。作者推测,重复模式可能有助于以一种容易被EP300修饰的方式定位核小体,从而使它们更容易被RNA聚合酶取代,尽管该模型目前尚处于推测阶段,需要在未来的工作中得到证实。
然而,这项工作在人类基因组中提出了一种令人兴奋的新模式,并对定位核小体如何影响基因转录具有意义。
核小体旋转设置与组织特异性人类基因启动子的转录调控有关。