在5月出版的基因组医学:基因沉默、血清代谢谱分析、癌症中的基因调控网络推断等
在5月出版的《基因组医学》杂志上发表了三篇研究文章,强调了后基因组技术在解决致癌和改进治疗设计方面的潜力。
首先,Peter Scacheri和他的同事提供了一个关于结肠癌细胞基因表观沉默是如何实现的洞察。这项研究首次证明,非CpG岛丰富的启动子的沉默,与CpG岛丰富的启动子一样,依赖于细胞素的高甲基化和H3K4me3标记的丢失。
奥利弗·巴斯及其同事的第二项研究具有重要的临床意义,因为它分析了结直肠癌不同阶段患者的血清代谢谱是否能预测其转移状态。研究人员发现事实确实如此,这为准确评估疾病的分期提供了一种新方法。因此,这项研究的发现可能有助于提供一种更个性化的治疗方法。
第三项研究,综合比较分析了9种最先进的基因调控网络推理方法,报告了不同方法在准确性上的巨大差异。将性能最佳的方法应用于卵巢癌数据集,Mark Ragan和合作者能够预测已报道的和新的调节相互作用,这可能是潜在的药物靶点。这项研究发表在澳大利亚,是癌症生物信息学专题系列的一部分。
同时,在本论文中,我们提出了一个新的计算预测框架Consensus,来评估不确定的基因变异,有助于改善数据可视化和临床决策。
委托撰写的文章包括Nadav Ahituv及其同事的一篇综述,讨论下一代测序如何使人们更好地理解调节因子变异在治疗药物不同反应中的作用,Philippos Patsalis和Elisavet Papageorgiou对非整倍体非侵入性产前诊断的最新进展进行了综述。这期杂志还包括《自然遗传学》(Nature Genetics)最近发表的三篇关于紫外线敏感综合征的研究报告,以及丹尼尔•麦克阿瑟(Daniel MacArthur)关于2012年基因组疾病会议的会议报告。