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新冠病毒已突变有更强致病力?论文作者今日回应:用词不当,都是误会! ​

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我们在前文探讨新型冠状病毒如何从疑似中间宿主穿山甲感染人类的时候,提到过病毒重组或突变是可能的路径之一(感兴趣可戳:深度解读 | 穿山甲?龟?蛇?新冠病毒中间宿主溯源迷雾重重!)。

一般而言,病毒基因序列碱基突变速率约在每年 1000 个碱基中 1 个碱基,只有关键位点的碱基突变才能导向表型改变的变异(这里注意突变和变异概念的区别)

病毒变异和溯源可确定不同时间节点新型冠状病毒的代际关系,从而寻找潜在疫源地。同时,突变位点或重组方式的阐明,可能有助于我们揭开新型冠状病毒的传染性远高于 SARS、MERS 冠状病毒的迷雾。

3 月 3 日,北京大学生命科学学院生物信息中心研究员陆剑、中国科学院上海巴斯德研究所研究员崔杰联合团队在 National Science Review 在线发表了题为《On the origin and continuing evolution of SARS-CoV- 2》的研究论文,探讨了新型冠状病毒的起源和进化。

图源:National Science Review 官网


研究团队通过对 103 株新型冠状病毒的基因组进行进化分析,发现新型冠状病毒已产生了 149 个突变位点,并通过位于 ORF8 基因的氨基酸编码位点分析出 L 和 S 两个新型冠状病毒分枝谱系,目前肆虐的新型冠状病毒两个分枝同时存在。

单倍型网络图揭示了不同新型冠状病毒单倍型间的遗传距离及演化关系,根节点和叶子节点提示了新型冠状病毒的变异演化方向

图源:National Science Review 官网


国家生物信息中心研究数据同样表明 ORF8 基因 28144 位点随着疫情发展其群体发生变异频率从 0% 逐渐增加到 29%。

研究团队认为 L 分枝占比约 70%,与来自蝙蝠的冠状病毒在进化树上更接近;S 分枝占比约 30%,具有较强的侵略性和传染性。

随后,由于侵略性这个词引发媒体过渡解读和不明真相的大众关注和恐慌,论文通讯作者提交了补充性声明,称原论文中的用词「侵略性」具有一定误导性,应该用更精确的术语「更高频率」代替。


其实,病毒发生变异十分常见

现在流行的新型冠状病毒不同毒株序列或多或少有所不同。国家生物信息中心 2019 新型冠状病毒信息库发布了基于与 2019 -nCoV (MN908947.3) 新型冠状病毒基因序列的比较分析鉴定的变异数据统计,也证实了新型冠状病毒变异的常态性。

图源:国家生物信息中心 2019 新型冠状病毒信息库


3 月 2 日,浙江大学李玉东团队在预印本 bioRxiv 上在线发表了题为《Comparative genomic analysis revealed specific mutation pattern between human coronavirus SARS-CoV- 2 and Bat-SARSr-CoV RaTG13》的研究论文。

图源:bioRxiv


研究团队通过基因组比较分析,揭示了新型冠状病毒与蝙蝠冠状病毒 RaTG13 之间的特殊突变路径(注意是突变,不是变异,篇幅原因不再展开)

图源:bioRxiv 官网


同样是 3 月 2 日,中疾控、医科院、加州大学洛杉矶分校、匹兹堡大学、湖南大学联合团队在预印本 bioRxiv 在线发表了题为《Mutations, Recombination and Insertion in the Evolution of 2019 -nCoV》的研究论文,探讨了新型冠状病毒演化过程中的那些突变、重组和插入。


图源:bioRxiv


研究团队收集并分析了 120 株新型冠状病毒基因组序列,通过构建系统发育树发现,不同新型冠状病毒毒株间基因序列的差异非常有限(3 万个碱基中突变碱基在个位数)

图源:bioRxiv 官网


一般而言,病毒在不同宿主中传播(蝙蝠→穿山甲→人)因生存环境(体温、免疫系统)发生剧烈变化而诱发变异。而人际之间个位数核苷酸突变,并不归属于变异。只有关键位点核苷酸或蛋白发生变化,才可能导致病毒致病性增加。


结语

世界大流行的背景下,溯源和监测病毒变异需要多国联合协同提供更多地域新型冠状病毒基因序列。截止到 3 月 5 日,提交检测的 303 株新型冠状病毒被划分为 188 个单倍型。

病毒数较多的单倍型群体数量较大,在人群中传播较快

图源:国家生物信息中心


让我们把和我们相关的病毒株和国家根节点和叶子节点放大,看出来了吧。

图源:国家生物信息中心


新型冠状病毒突变是否会引发致病机制和传播路径的改变,对抗病毒药物和疫苗的研制是否存在影响是值得关注的问题。目前来看的,新型冠状病毒的突变非常有限,并没有影响病毒致病力、传播路径甚至药物和疫苗的研发。

让我们一起调整心态,期盼春天如约而至。
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