5位院士为代表，超12篇CNS大作，5月新冠研究汇总——全方位围攻新冠病毒，值得收藏
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截至 2020 年 5 月 27 日中午，全球累计确诊新冠肺炎 555 万例，死亡 35 万例。各大科研机构在疫情期间齐心协力，本月以我国陈薇院士、高福院士、王福生院士、饶子和院士等院士团队为代表，在CNS等期刊发表超过 12 篇相关研究论文，取得了多项突破性进展。
今天学术君将从新冠病毒的传播、溯源、治疗的药物、疫苗研发以及病毒结构等不同方面为大家进行五月份研究成果汇总。
一． 传播
2020 年 5 月 7 日，耶鲁大学的研究人员在 Cell 发表研究论文 Coast-to-Coast Spread of SARS-CoV-2 during the Early Epidemic in the United States，揭示了 SARS-CoV-2 引入的来源以及在美国的传播方式。研究人员对 COVID-19 患者的 9 个病毒基因组进行测序，并利用基因组学分析方法结合患者的航空旅行信息，发现 SARS-CoV-2 在美国从东西海岸间的传播极有可能是美国本土传播的结果，而国际旅行的限制并没有显著影响病毒在美国的扩散 1。
二． 溯源
关于新冠病毒的溯源一直是大家关注与争议的话题，5 月 7 日，华南农业大学沈永义、肖立华等Nature 在线发表题为 Isolation of SARS-CoV-2-related coronavirus from Malayan pangolins 的研究论文。研究人员从马来亚穿山甲中分离到与 SARS-CoV-2 高度同源性冠状病毒，通过比较基因组分析表明，SARS-CoV-2 可能源自穿山甲冠状病毒样病毒与蝙蝠冠状病毒 - RaTG13 样病毒的重组 2。
5 月 14 日，中科院武汉病毒所石正丽团队与福建师范大学欧阳松应教授在 bioRxiv 上发表题为Evolutionary arms race between virus and host drives genetic diversity in bat SARS related coronavirus spike genes 的研究。结果表明，SARSr-CoV Spike蛋白和中华菊头蝠 ACE2 可能是随着时间的推移共同进化的，并经历来自彼此的选择压力，引发军备竞赛（Arms race）的协同进化关系，进一步证明中华菊头蝠是 SARSr-CoVs 冠状病毒的潜在自然宿主3。以上这两项研究都证实了 SARS-CoV-2 极有可能来自于自然发生的重组。
三． 治疗
5 月 8 日，一项来自香港大学的结果表明，使用干扰素 β1b + 利巴韦林 + 洛匹那韦 / 利托那韦（克力芝）的三联方案治疗，或许可以加快轻中度患者的康复，并且表示三联方案要尽早使用才能有更好的治疗效果。该研究题为 Triple combination of interferon beta-1b, lopinavir–ritonavir, and ribavirin in the treatment of patients admitted to hospital with COVID-19: an open-label, randomised, phase 2 trial，发表于顶尖期刊 Lancet 上 4。
除了老药新用以外，曾被期望为特效药的瑞德西韦的临床结果一直备受关注，5 月 22 日，题为 Remdesivir for the Treatment of Covid-19-Preliminary Report 的研究发表在 NEJM 上，表明在成年患者中，瑞德西韦组恢复时间中位数为 11 天，安慰剂组为 15 天，与安慰剂组相比，瑞德西韦组的患者康复时间更短，瑞德西韦组 14 天死亡率（7.1%）也低于安慰剂组（11.9%）。作者也指出，仅用抗病毒药治疗是不够的，未来的治疗策略应结合其他治疗方法或评估多种抗病毒药结合使用的效果，以继续改善 COVID-19 患者的预后 5。
关于 SARS-CoV-2 的抗体研究是最近的研究热点，五月份有几篇关于新冠抗体的重磅研究成果的发表，中和抗体连用的鸡尾酒疗法也引起了大家的关注，不同的抗体可以识别结合域上不同的抗原表位，在未来的临床应用中能够避免免疫逃逸的理想单克隆抗体对。
5 月 8 日，军事医学科学院生物工程研究所陈薇院士团队和西湖大学周强团队强强联合，在预印本平台 bioRxiv 上线题为：A potent neutralizing human antibody reveals the N-terminal domain of the Spike protein of SARS-CoV-2 as a site of vulnerability 的研究论文。陈薇院士团队从新冠康复病人的免疫细胞中筛选和鉴定具有强病毒中和能力的单克隆抗体 4A8，周强团队利用冷冻电镜解析了 S 蛋白与中和抗体 4A8 复合物的结构 6。
5 月 18 日，北京大学谢晓亮等研究团队在 Cell 发表题为 Potent neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 identified by high-throughput single-cell sequencing of convalescent patients’ B cells 的研究论文，报道了 SARS-CoV-2 中和抗体筛选的结果。作者用高通量单细胞 RNA 和 VDJ 测序快速鉴定 60 名康复患者的 8558 个抗原结合的 IgG1+ 抗体中鉴定出 14 个有强中和能力的单克隆抗体，其中最强的是 BD-368-2，对感染 SARS-CoV-2 的 hACE2 转基因小鼠也有较强的治疗和预防作用 7。
5 月 13 日，高福院士研究团队在 Science 上发表题为 A noncompeting pair of human neutralizing antibodies block COVID-19 virus binding to its receptor ACE2 的研究论文。从一名新冠肺炎康复患者的体内分离出了两种具有不同抗原表位的单克隆抗体：B38 和 H4，进一步通过细胞实验和小鼠实验表明这两种单抗可以有效阻断新冠病毒与其受体 ACE2 的结合 8。
5 月 26 日，中国科学院微生物研究所严景华团队、高福团队、王奇慧团队联合中科院武汉病毒所袁志明研究员、解放军总医院王福生院士等在 Nature 在线发表题为 A human neutralizing antibody targets the receptor binding site of SARS-CoV-2 的研究论文，首次在非人灵长类动物（恒河猴）试验模型中报告了能有效治疗和预防新冠病毒感染的特异性、全人源单克隆抗体。
5 月 26 日，清华大学结构生物学高精尖创新中心张林琦、王新泉团队在 Nature 发表文章 Human neutralizing antibodies elicited by SARS-CoV-2 infection，作者从 8 名 SARS-CoV-2 感染者的单个 B 细胞中分离并鉴定了 206 株 RBD 特异性单克隆抗体，并鉴定出具有抗 SARS-CoV-2 中和活性的抗体，这种中和活性与它们与 ACE2 竞争 RBD 结合的能力有关9。
此外，复旦大学基础医学院应天雷团队在抗新冠抗体药物研发方面也取得了重要的进展，该团队发现了一系列抗新冠全人源纳米抗体，可靶向新冠病毒受体结合区上的五类不同表位。该成果于 5 月 14 日在 Cell Host & Microbe 上发表，题为 Identification of Human Single-Domain Antibodies against SARS-CoV-210。
四． 疫苗
目前，世界上在研的新冠疫苗有病毒载体疫苗、灭活疫苗、减毒疫苗、mRNA 疫苗、DNA 疫苗、亚单位疫苗等，全世界多家单位也正在紧急的研发和临床试验研究中。
5 月 6 日，中国医科院医学实验动物研究所秦川团队等多家单位合作，在 Science 发表 Report：Development of an inactivated vaccine candidate for SARS-CoV-2。研究人员开发了一种纯化的灭活新冠病毒候选疫苗，并进行了中试生产，该疫苗在小鼠、大鼠和非人灵长类动物中均可诱导新冠病毒特异性中和抗体产生。该疫苗目前已经入临床研究 11。
5 月 21 日，陈薇院士团队、江苏省疾控中心朱凤才教授团队在 Lancet 上线题为：Safety, tolerability, and immunogenicity of a recombinant adenovirus type-5 vectored COVID-19 vaccine: a dose-escalation, open-label, non-randomised, first-in-human trial 的疫苗临床研究论文。研究表明，腺病毒 Ad5 为载体的冠状病毒疫苗在接种后 28 天是具有良好的耐受性和免疫原性。健康成人对 SARS-CoV-2 的体液应答在接种后第 28 天达到高峰，并在接种后第 14 天观察到快速的特异性 T 细胞应答。这项研究还将在 6 个月内进行持续性评估，仍需要进一步的试验来确定免疫反应能否有效预防 SARS-CoV-2 感染 12。
5 月 15 日，上海交通大学蔡宇伽团队在预印本平台 bioRxiv 发表研究 A single dose SARS-CoV-2 simulating particle vaccine induces potent neutralizing activities，公布了 mRNA 新冠候选疫苗 ShaCoVacc 的动物数据。为了在不引起感染的情况下产生类似天然的免疫原，研究者将编码 mRNA 刺突蛋白（Spike）注入病毒模拟颗粒（VSPs）内部来实现 ShaCoVacc 的设计，该病毒模拟颗粒由慢病毒颗粒衍生而来；研究者还对病毒模拟颗粒表面的刺突蛋白进行了修饰。与传统疫苗相比，mRNA 并不会感染或者整合到基因组中，因此不会带来感染以及突变的风险，有更好的安全性 13。
五．病毒结构
结构生物学家们对病毒结构的解析为药物研发提供了重要理论依据，5 月 1 日，中科院上海药物所徐华强研究员等合作在 Science 杂志上发表文章 Structural Basis for Inhibition of the RNA-Dependent RNA Polymerase from SARS-CoV-2 by Remdesivir，SARS-CoV-2 的复制需要依赖病毒 RNA 的 RNA 聚合酶（RdRp），这是瑞德西韦的作用靶点，该研究解析了 RdRp 与瑞德西韦复合物结构 14。
5 月 22 日，饶子和院士等在 Cell 杂志上发表文章 Structural basis for RNA replication by the SARS-CoV-2 polymerase，揭示了 SARS-CoV-2 RNA 聚合酶在 RNA 复合物中的结构，观察了 nsp8 的构象变化及其与现有 RNA 的相互作用，阐明了抗病毒候选药物瑞德西韦掺入和延迟链终止机制，并且提出了引物酶复合体向聚合酶复合体的过渡模型 15。而在 5 月 21 日，Nature 也发表研究 Structure of replicating SARS-CoV-2 polymerase，得出与饶子和院士团队研究相似的结果。
结语
