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那种锌的感觉——真菌对污染物的适应

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我们发现,黄体链球菌能够在重金属严重污染的土壤中生存和茁壮成长。体外筛选表明,黄体霉培养出了适应高浓度锌(Zn)、镉(Cd)和铜(Cu)的分离株。

我的博士研究集中在对耐锌黄体菌分离株的调查上,因为已经证明这些分离株能够保护其寄主植物免受金属胁迫。这一特性使它们成为植物稳定应用的有趣候选材料。

所以这里已经有了第一个答案,为什么研究对外来生物的适应是有用的:微生物,包括真菌,可以用于环境友好的生物修复目的。虽然主要研究促进植物生长的根状细菌,真菌也可以是相当有用的。真菌在大多数植物的营养获取中起着非常重要的作用。

此外,我还认为研究生物体如何适应外来生物是很重要的,因为它可以阐明进化适应机制。许多关于适应的遗传基础的重要问题仍然没有得到解答。

您能简要介绍一下您对黄尾藻中锌转运体的研究吗?

简而言之,我的博士学位的目的是阐明黄氏菌的锌耐受机制。本小组先前的数据表明,转运蛋白在耐受性中起着至关重要的作用。

因此,我的工作重点是研究黄体霉中锌转运体的特性。我已经在luteus基因组中发现了7个CDF(阳离子扩散促进因子)和4个ZIP (Zrt-, Irt-样蛋白)转运体。真核细胞中锌的转运主要由CDF和ZIP转运蛋白家族控制。

其中一个转运蛋白SlZnT2非常有趣,研究表明,Zn耐受性与SlZnT2的高转录水平相对应。这种基因表达的差异现在得到了进一步的研究。我们使用基因组行走和qPCR(定量聚合酶链反应)分析SlZnT2启动子序列和基因拷贝数。

是什么让你从事真菌方面的工作?在你的研究中,你最喜欢什么?

说实话,在我刚开始学生物学的时候,我从来没有考虑过和真菌打交道。幸运的是,我们有一位热情的教授,Jan Colpaert,他教我们真菌在陆地生态系统中的重要性。

我们惊奇地发现,特殊的真菌能够与植物形成共生关系。教授向我们介绍了他对外生菌根真菌的研究,我能说的是,他的热情感染了我们!后来,我得到了一个实习的机会,我的硕士论文是关于这一有趣的菌类的,我非常喜欢它,所以我继续读博士。

我最喜欢我的研究的是它不是一项单调的工作。我学习和阅读了很多不同的主题(生态学,菌根,分子生物学,遗传学,…),在实验室里我使用了很多不同的技术,有时我也帮助实践课程,这是非常有益的。所以总的来说,我作为一个博士生的工作是多方面的,我喜欢它。

在我攻读博士学位之初,我真的很不耐烦,我想马上开始并取得成果。因此,实验室的工作有时感觉过于重复,甚至有点无聊。似乎过了很久我才拿到我的数据。然而,当我最终获得了我的数据,它们看起来不错时,所有的努力都是值得的。获得数据并知道自己在研究中取得进展的感觉真的很好。现在,我经常有很多实验同时进行,我很高兴重复的工作,因为它帮助我放松和清理我的大脑。

最后但并非最不重要的,我也喜欢小事情。例如,当我们收集的一个分离物受到大量污染或在培养皿中停止生长时,我能够“拯救”该分离物。傻傻的事,却能把我的笑容挂在脸上。上周,我去看了一看我和叶氏松的幼苗。它们长出了漂亮的菌根,我得给它们拍张照片。

在接下来的几年里,你希望你的研究能把你带到哪里?

在未来的几年里,我希望能够对黄氏酵母中更多的Zn转运体进行研究,并展示它们在Zn耐受中的作用。希望这将使我能够阐明耐锌性状背后的分子机制,并帮助我开始开发植物稳定技术。我坚信这是一个可行的选择,因为已经证明这些适应锌的黄氏杆菌分离株可以保护其寄主松树免受锌胁迫。

此外,我也希望成为一名研究人员,学习更多的知识,学习新的技术,并与该领域的其他研究人员进行进一步的讨论。

你对刚开始从事研究的年轻科学家有什么建议?

首先,我认为学习对自己有吸引力的东西是非常重要的。参与具有挑战性的研究。但是,别忘了时不时退一步,健康的工作和生活平衡也很重要。

如果可能的话,也找一个漂亮的圆周率。有人愿意教你,引导你,帮助你,让你安心。有人花时间讨论你的工作,给你反馈意见,问你很多问题,这将大大促进你作为一个研究者的发展,这超出你的预期。

此外,要保持求知欲和开放的心态。如果你的结果与你的假设相冲突,不要让这让你失望!虽然科学文献主要是积极的结果,消极的结果是生活的一部分,应该发表。为障碍做好准备。当你阅读文章时,你会看到所有这些漂亮的数据和数字,这看起来很简单。但请放心,您将体验到的所有优化和试错也是其他人所经历的。

而且在很多情况下,一种在一个物种身上有效的技术并不适用于你的物种。那样的话,不要气馁!把它看作是一次学习经验,你掌握了一项新的技术技能。通常,彻底理解一种技术的诀窍是遇到它的问题,然后进行大量的故障排除。

最后,我也强烈鼓励新的研究人员提出问题。问很多问题,不要被更资深的研究人员吓倒。毕竟,他们也曾经是学生。

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