合作专家 | 何菲硕士
生物工程 广西大学
审核专家 | 王蕾博士
生物化学分子生物 浙江大学
原理
基因组 DNA 容易受到内源性和外源性因素的损害,激光微辐射穿过细胞核迅速产生局部染色质相关 DNA 损伤,激光的微辐射可以诱导多种类型的 DNA 损伤,包括双链断裂(DSB)、单链断裂(SSB)和氧化碱基。
用途
分析活细胞中的修复蛋白募集,DNA 修复的影响因素。
材料与仪器
活细胞显微镜兼容培养皿或培养皿、贴壁细胞系、CO2 对照、5′-碘-2-脱氧尿苷(IdU)、Hoechst 33342、4% 甲醛、PBS、封闭溶液、Triton X-100、鼠标抗 γH2AX、小鼠 IgG(H + L)二抗、牛血清白蛋白(BSA)、吐温 20、细胞培养箱;另外, 本实验的共聚焦显微镜应配备至少两个激光器,355 nm 或 405 nm 激光器用于微照射,另一个(例如 488 或 560 nm)用于成像。显微镜应配备一个培养室,用于控制温度、CO2 和湿度。
步骤
1. 细胞培养:在开始微辐照实验前 2~3 天,在培养皿中接种细胞,细胞直接生长在 35 mm 圆形成像皿上。(通常,0.5~1 × 106 细胞足以用于大多数多因素研究)
2. 在照射之前需要使用光敏剂进行预处理, 例如卤代核苷酸类似物 [溴脱氧尿苷(BrdU),5′-碘-2-脱氧尿苷(IdU)] 或与被检查细胞的 DNA 小凹槽结合的染料(Hoechst 33258, Hoechst 33342), 以允许诱导 DSB 所需的能量吸收。用 10 μM 溴脱氧尿苷(BrdU)孵育细胞至少 24 小时或者用 10 μg/ml Hoechst33342 对细胞敏化 10 分钟,在加入 Hoechst 后约 60 分钟即可使用。
3. 向细胞中加入预热的 CO2 调节活细胞培养基, 其中补充有 10%FBS 和不含酚红的抗生素, 以尽量减少自发荧光。
4. 微辐射设置:选择用于 DNA 损伤诱导的辐射激光(355 nm 或 405 nm), 并以 ms 为单位设置曝光时间(对于 355 nm 激光,创建 SSB 的曝光时间(总共 150 ms), 或 DSB(总共 250 ms)DNA 损伤。这将分别导致大约 6~12 次(对于 DSB)或 5~8 次(对于 SSB)线/帧(如果使用其他形状)扫描,以诱导 DNA 损伤。通常, 对于 60×物镜,直线会在直线长度上产生宽度为 0.2~0.5 μm 的损伤。
5. 活细胞成像:在微照射之前和之后,以 2 秒的时间间隔记录一个中 Z 截面的共聚焦图像系列。
6. 所需蛋白质的免疫检测
(1)将细胞培养室从显微镜中取出,在 37 ℃ 的潮湿大气中孵育细胞, 其中含有 5% CO2, 时间为 5~10 分钟。孵化后,用 0.5 mL 的 PBS(137 mM NaCl、2.7 mM KCl、8 mM Na2HPO4 和 2 mM KH2PO4)清洗细胞, 并在室温下在 PBS 中用 0.5 mL 的 4% 甲醛 固定 10 分钟;
(2)用 PBS 清洗细胞一次,然后用 50 mM NH4Cl 清洗它们,以清除残留的甲醛;
(3)用 0.5% Triton X-100 在 PBS 中渗透 5 分钟;
(4)在封闭溶液(5% FBS、3% BSA、PBS 中 0.05% Triton X-100)将样品孵育 40~60 分钟;
(5)PBS 清洗细胞一次;
(6)加入一抗,例如在封闭缓冲液中稀释的小鼠抗 γH2 AX, 并在 4 ℃ 下孵育过夜;
(7)在 3×封闭溶液 中洗涤 5 分钟;
(8)加入二抗,例如驴抗小鼠 IgG(H+L)二抗, Alexa Fluor® 488 在 4% BSA/PBS 中稀释,并在室温下孵育 1 小时;
(9)在 3×封闭溶液中洗涤 5 分钟;
(10)加入新鲜 PBS 并储存在 4 ℃。
注意事项
1. 研究人员需要考虑激光参数-波长、脉冲长度、脉冲频率、显微镜/激光系统的可变「变焦」、曝光时间和能量 , 在很大程度上影响光束诱导的病变类型和数量, 从而决定细胞反应。
2. 应特别注意处理 Hoechst(一种 DNA 插入剂)和甲醛(皮肤接触和吸入具有中度毒性), 工作时应在通风良好的区域或烟气罩内进行。
常见问题
(1)细胞看起来不健康,可能是细胞的初始状态不好,也可能是激光的强度过强,过度 DNA 损伤会使细胞凋亡;
(2)细胞在图像采集过程中移动,细胞在图像采集过程中改变焦点;
(3)激光微照射时未观察到蛋白质募集,改变激光参数重新实验。
来源:丁香实验