简介
原理
TRAP 检测法检测端粒酶活性的基本原理是通过具有活性的端粒酶催化,将端粒重复序列(GGTTAG)加到一个寡核苷酸底物 TS 的 3'末端,然后通过 PCR 扩增 30~33 个循环,通过在反应中的 TS 引物上引入放射性同位素 y-32P-ATP 标记,对 PCR 产物采用聚丙烯酰胺电泳检测,最后采用放射性自显影检测并分析扩增结果。
另外也可以不对引物进行放射性同位素标记,而是采用非放射性的 SYBRGreen 染料对 PCR 产物进行染色鉴定,分析并量化出端粒酶的活性。
材料与仪器
器材:
① 组织研磨器
② 紫外分光光度仪
③ PCR 仪
④ 垂直电泳槽
⑤ 紫外凝胶成像系统
⑥ 待测细胞或组织样品细胞。
试剂:
① 聚丙烯酰胺凝胶试剂
② Taq DNA 聚合酶;
③ dNTP Mix。
④ SYBR Green 染料
⑤ TRAP 检测法引物(包括 TS引物,RP引物,K1引物,TSK1引物);
⑥ 1x CHAPS 缓冲液(10 mmol/L Tris-HCI,pH7.5,1 mmol/L MgCl2,1 mmol/L EGTA,0.1 mmol/L 苯甲脒,5 mmol/L β-巯基乙醇,0.5% CHAPS,10% 丙三醇)
⑦ 10x TRAP 反应缓冲液(200 mmol/L Tris-HCI(pH8.3),15 mmol/L MgCl2,630 mmol/L KCI,0.5% Tween-20,10 mmol/L EGTA)
步骤
TRAP 检测法检测端粒酶活性的基本过程可分为如下几步:
B TRAP 反应设置,在每个反应中加入模板 2 μl,10x TRAP 反应缓冲液 5 μl,50x dNTP Mix 1 μl,TS引物 1 μl,TRAP 检测法引物(含 RP引物,K1引物,TSK1引物)1 μl,Taq DNA 聚合酶(5 U/μl)0.4 μl,ddH2O 39.6 μl。
C PCR 扩增,PCR 反应条件为:30 ℃ 孵育 30 min,然后进行两步 30 个循环,包括 94 ℃ 变性 30 s,59 ℃ 退火/延伸混合 30 s。反应实际是一个共同缓冲液,双酶系统的反应,在第一个酶系统的反应中,端粒酶将一定数量的端粒重复序列(GGTTAG)转到了寡核苷酸底物 TS 的 3'末端,而在第二个酶系统的反应中,TS 和 RP引物则可以扩增出一个以 6 碱基递增的产物梯度,如从 50 个核酸开始的:50,56,62,68•••••片段。
D 反应产物电泳及显色反应,将 PCR 反应产物上样到 10% 聚丙烯酰胺凝胶中,1x TBE 缓冲液电泳,1:10000 SYBR Green 对凝胶进行染色 15 min 后拍摄照片。
注意事项
1 1x CHAPS 缓冲液裂解细胞应在冰上进行,组织样品比较难于裂解,可能需要用到电动匀浆器,注意应在冰上研磨,避免温度过高,离心应采用冷冻离心机以防止端粒酶遇热降解。
来源:丁香实验