溴化乙锭染色法
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原理
如果将微生物细胞裂解,使其拟核(即染色体 DNA)被抽提出来,通过溴化乙淀(ethidium bromide,简称 EB)染色并进行琼脂糖凝胶电泳,便可观察到释放到细胞外的染色体 DNA。EB 是一种扁平分子染料。可特异性插入 DNA 碱基对之间,在紫外线照射下,使 DNA 呈现荧光,因而可观察到凝胶中的染色体 DNA,由于在提取过程中大分子染色体 DNA 的随机断裂,所以经凝胶电泳后形成的是一条不整齐的浓的荧光带。
用 EB 染色法进行的体外观察染色体 DNA 也分两步进行:
1. 将细胞裂解后抽提染色体 DNA;
2. 通过含有 EB 的琼脂糖凝胶电泳在紫外光下观察染色体 DNA 荧光带。
材料与仪器
TE 缓冲液 10% SDS 蛋白酶 K(20 mg ml) 5 mol L NaCl CTAB NaCI 酚 氯仿 异戊酵(25:24:1) 异丙酵 70% 乙醇 溴酚蓝加样缓冲液 TAE 电泳缓冲液
台式高速离心机 5 ml 塑料离心管 真空干燥器
步骤
1. 取 4.5 ml 大肠杆菌过夜培养液于 5 ml 塑料离心管中,12000 r/min 离心 1~2 min,弃上清。
2. 将细胞沉淀悬浮于 1.7 ml TE 缓冲液中,加入 10% SDS 90 μl 和 20 mg/ml 的蛋白酶 K 9 μl 混匀,37℃ 保湿 1 h。
3. 加入 5 mol/L NaCl 300 μl,充分混匀,再加入 240 μl CTAB/NaCl,混匀,置 65℃ 水浴 10 min。
4. 加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)混匀,12000 r/min 离心 5 min。
5. 将上清水相转入另一洁净的塑料离心管中,加 0.6 倍体积的异丙醇使 DNA 沉淀下来。
6. 快速离心数秒钟,弃上清,用 70% 的乙醇淋洗 DNA 2 次,将 DNA 沉淀经真空干燥后溶于 300 μl TE 缓冲液中。
用此法获得的染色体 DNA 可用于限制性酶切等分子生物学操作。
7. 取少量(约 3~5 μl)提取的 DNA 样品(其余置于-20℃ 保存),加入 3 μl 溴酚蓝加样缓冲液,混匀后上样进行琼脂糖凝胶电泳 1 ~ 2 h。琼脂糖中加有 EB,在电泳过程中,EB 将插入 DNA 分子中。
8. 戴上一次性塑料手套(EB 是强诱变剂)将凝胶取出置于紫外分析仪上观察染色体 DNA 荧光带。
注意事项
必须通过一块普通玻璃或戴上防护眼镜进行现察,以免损伤眼晴。
来源:丁香实验