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基本方案2 DM 患者gDNA三核苷酸重复的杂交分析

最新修订时间:

原理

gDNA杂交分析对于确定DM>250bp 的扩增特别有效。此法可用于排除 E3 至 E4 类扩增(表 9.4.1),后者通过 CTG-PCR 只有一条等位基因可见,并且 CTG-PCR 产物与(CTG)10 杂交不能检测到原突变或扩增(基本方案 1)。

材料与仪器

纯化的gDNA
EcoR I 限制性内切核酸酶 10 X 限制性内切核酸酶缓冲液 琼脂糖胶 1 X TBE 缓冲液 10 X 凝胶载样缓冲液 分子质量标记物 溴化乙锭 NaOH 中性化溶液 预杂交 杂交缓冲液 洗脱缓冲液
铸造托盘 厚梳齿 带正电尼龙膜 滤纸

步骤

1. 以 50U (如为D N A 自动抽提仪提取的D N A ,贝 Ij 可能需更多酶量并加4mm〇1/L亚精 胺)£ C0R I 消化纯化的g D N A (每泳道2〜5吨)。 2. 消化D N A 时,用不含漠化乙键的I X T B E 缓冲液配制〇.6%琼脂糖凝胶,将凝胶倒 人插好I.5m m 厚梳齿的20c m X 20c m 铸造托盘中。 3•消化好的D N A 中加入IO X 凝胶载样缓冲液( 终浓度为l x ) 卜样革 凝 將 宜由— 个点样孔应为合适的分子质量大小标记物。 ' 4•在不含漠化乙键的I X T B E 缓冲液中以35V 、 40m A 将凝胶电泳2〇〜22h,然后升至 最大45V 、 50m A 继续电泳5〜8h 直到二甲苯胺染料前端到达凝胶的底部。 5. 在 500m丨含l.C^g/m卜溴化乙锭的I X T B E 缓冲液中染胶2〇 〜3〇 min给染好的 拍照。 ^ 6. 凝胶在500ml 0.4mol/L Na O H 溶液中变性30min (对于其他种类的膜用甘他方安)
7. 在>500m l 0.4mol/L N a〇 H 溶液通过毛细管转移D N A 至带正电的尼龙膜。转移6h 至过夜。 8. 转移后,从凝胶上取下尼龙膜,置中性化溶液中轻柔振荡,孵育 15min。 9. 将膜轻放至滤纸上吸干。通过80°C 烘烤15min或交叉连接固定D N A 。 10. 在预杂交/杂交缓冲液中, 65°C 预杂交膜> lh。 11. 在预杂交/杂交缓冲液中, 65°C下,与 IO6C p m 柱纯化的 [«-32P] dCTP-pGB2.2杂 交过夜。 12. 杂交完成后,按照下述严格洗脱杂交膜: 洗 脱 缓 冲 液 洗 脱 两 次 ,每次l〇 min,室温; 洗脱缓冲液V —洗脱2 或 3 次,每次lOmin, 65〜70°C 。 13. 用滤纸将膜吸干,以塑料薄膜包裹。 14. 一80°C ,将杂交膜与带增光屏的X -A R 自显影胶片曝光过夜。

来源:丁香实验

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