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Northern杂交

相关实验:Northern 杂交

最新修订时间:

原理

转移并固定到膜上的 RNA 样品可以与特异的探针杂交,从而用来对所感兴趣的 RNA 进行定位。视实验人员和条件的差异,可以从多种方法中选择任意一种来标记和检测探针。用抑制非特异吸收探针的封闭试剂处理膜之后,在适于探针和固定的靶 RNA 杂交的条件下将膜同探针孵育,而后广泛洗膜以去除非特异结合的探针,最终在膜上产生 一个紧密结合探针的影像分布。分析了杂交结果之后,探针可以从膜上洗去,膜可重复使用于下一个实验。

材料与仪器

DNA 或 RNA 探针
预杂交液 SSC
滤纸 沸水浴 水浴

步骤

一、材料

1. 缓冲液和溶液

预杂交液(0.5 mol/L pH 7.2),7% (m/V) SDS,1 mmol/L EDTA ( pH 7.0))

SSC ( 0.5X,1X,和 2X ) 含 0.1% (m/V) SDS

SSC ( 0.1X 和 0.5X)含 0.1% (m/V) SDS

2. 核酸和寡核苷酸

DNA 或 RNA 探针(> 2X108 cpm/μg)

固定于膜上的 RNA

3. 专用设备

滤纸(Whamian 3 MM 或相当效果的滤纸)

沸水浴

预热到 68℃ 的水浴

预设到杂交温度的水浴

二、方法

1. 在 10~20 ml 预杂交液中 68℃ 温育膜 2 h。

2. 若使用双链探针,在 100℃ 下加热 32P 标记的双链 DNA 5 min,使之变性,然后迅速移至冰水中冷却。

3. 把变性的或单链放射性标记的探针直接加到预杂交液中,在合适的温度下继续温育 12~16 h。

4. 杂交后,将膜从塑料袋中取出,在室温下迅速转移到含有 100~200 ml 1X SSC,0.1% SDS 的塑料盒内,将盒盖好,置于水平振荡器上,温和振荡 10 min。

5. 将膜转移至另一含有 100~200 ml 预热至 68℃、含 0.1% SDS 的 0.5X SSC 的塑料盒中。68℃ 下温和振荡 10 min。

6. 重复步骤 5,再洗涤至少 2 次,使 68℃ 下共洗涤 3 次。

7. 在印迹纸上晾干膜,然后让膜于 -70℃ 下在含增感屏的暗盒内对 X 线片(Kodak XAR-5 或相应的胶片)放射自显影 24~48 h。此外,也可通过磷图像系统扫描得到膜上的图像。

来源:丁香实验

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