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氯化锂沉淀法去除质粒DNA制备物中的小片段核酸

相关实验:氯化锂沉淀法去除质粒 DNA 制备物中的小片段核酸

最新修订时间:

原理

氯化锂沉淀法去除质粒制备物中小片段核酸(包括 DNA 和 RNA ) 的原理是基于两种核酸在氯化锂溶液中的溶解度有所不同。氯化锂是强脱水剂,可降低 RNA 的溶解性 ( Hearst and Vinograd 1961a, b),并剥离染色质上的蛋白质(Kondo 1979)。因此,质粒粗提物中的高分子质量 RNA 和蛋白质可在高浓度氯化锂溶液中形成沉淀,从而可通过低速离心加以分离(实例请见Kondo et al. 1991)。

材料与仪器

DNA 样品
乙醇 异丙醇 LiCl 乙酸钠 TE
Sorvsll SS-34 转子或性能相同的替代转子

步骤

一、材料

1. 缓冲液和溶剂

乙醇,异丙醇,LiCl ( 4 mol/L),乙酸钠(3mol/L, pH 5.2),TE ( pH 8.0),含有浓度为 20 μg/ml RNase A 的 TE ( pH 8.0)。

2. 核酸和寡核苷酸

DNA 样品,CsCl 密度梯度离心纯化。

3. 离心机和转子

Sorvsll SS-34 转子或性能相同的替代转子

二、方法

1. 测定质粒制备物体积,加入 0.1 体积的 3 mol/L 乙酸钠(pH 5.2 ) 和 2 倍体积的乙醇,置混合物于 4℃ 30 min。

2. 于 4℃ 以大于 10000 g ( > 9000 r/min, 用 Sorvsll SS-34 转子 ) 的转速离心 15 min 回收核酸沉淀,尽可能多地倾去上清液。而后打开管盖置于工作台上数分钟以蒸发乙醇。

3. 用含有 RNase A ( 浓度 ≥ 100 μg/ml ) 的 1 ml TE ( pH 8.0) 溶解湿的核酸沉淀。

4. 加入 3 ml 4 mol/L LiCl 溶液,置于冰上 30 min。

5. 于 4℃ 以 12000 g ( 10000 r/min,用 Sorvsll SS-34 转子)离心 15 min, 从沉淀的核酸中分离 DNA 质粒。

6. 将上清液转至一新的离心管,加入 6 ml 异丙醇,室温放置 30 min 以沉淀质粒 DNA。

7. 于 4℃ 以 12000 g ( 10000 r/min, 用 Sorvsll SS-34 转子)离心 15 min, 回收沉淀的质粒 DNA。

8. 小心倾去上清液,加入 5~10 ml 70% 乙醇,简单振荡离心管,而后于 4℃ 以 12000 g 离心 10 min。

9. 小心倾去上清液,打开管盖置于工作台上数分钟直至乙醇蒸发殆尽。

10. 用 TE ( pH 8.0 ) 溶解湿的 DNA 沉淀。

来源:丁香实验

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