材料与仪器
HeLa 细胞核提取物 Sephacryl S-300 HR 液氮 TM 缓冲液+0.1mol LKCl
XK26 40 柱
XK26 40 柱
步骤
材料与设备
HeLa 细胞核提取物(从 12L 细胞培养物制得,见 pp.9l~93)(5-ml 样品)
XK26/40 柱(PharmaciaBiotech,Inc.)
Sephacryl S-300 HR(PharmaciaBiotech,Inc,)
液氮
试剂
TM 缓冲液+0.1mol/LKCl
(配方,见"试剂的配制",pp.131~138)
操作程序
所有操作均在 4℃ 下进行。
1) 取 5-mlHeLa 细胞核提取物样品(从 12L 细胞培养物制得进行凝胶过滤层析, 留取 50ul 提取物供随后的测活分析用。
2) 对 XK26/40 柱,采用下列柱参数:
直径=2.6 cm
柱长=34 cm
体积=180 ml
流速=100 ml/h
缓冲液=TM 缓冲液+0.1mol/LKCl
3) 于 S-300 柱加 5-mlHeLa 细胞核提取物样品。分部收集 5-ml 组分。
注:凝胶过滤层析的关键一歩是样品进入填料床。样品必须以薄而均匀的圆盘状进入凝胶。在柱的底部填料是装填得最均匀也最致密的。因此,有些研究工作者喜欢在使用前将柱子倒置,然后从柱的顶端装柱时此端为柱的底部加样。另一种办法不是将柱子置,而是从柱的底部加样,使样品上行,这也是可行的。这两个方法都是将样品加在柱中填料最致密最均匀的一端。还应注意,为达到层析的高分辨率,组分的大小应取得小些,一般约为上样体积的一半。
4) 从 S-300 柱洗脱所得的各组分留取 50-ul 等分试样,供 DNA 酶 I 足迹分析实验用。转录因子 AP-1 会在 Ve/V0 值约为 1.3~1.35 处洗脱下来。其他许多转录因子如 Spl、NF-I/CTF 和 AP-2 等则会在 Ve/V0 值约为 1.35~1.40 处洗脱下来(典型的 S-300 柱的洗脱图,见图 2-2,p.95)。
5) 各组分如在 24 小时之内使用,可储存于 4℃; 若长期保存,则需液氮冷冻,并储存于-80℃ 下。
注:蛋白质溶液的冻融是蛋白质化学研究能否获得成功的重要环节之一。对此有多种方法可供选择。作者建议,蛋白质样品应尽快浸入液氮冷冻(干冰/乙醇也能满足要求。但作者不推荐直接将蛋白质样品放入--80℃ 冰箱。此外,最重要的是冷冻的蛋扫质样品应尽快解冻。蛋白质活性的丢失常常是由于解冻造成的,与冷冻过程相反,解冻的过程往往很馒。作者建议,将冷冻的蛋白质样品沒泡在室温的水中,以尽快解冻,另外,为了加快解冻过程,清除所有在容器周围可能形成的冰也很重要。
6) 用 DNA 酶 I 足迹法测定各组分中的 AP-1 的 DNA 结合活性(样品结果,见图 2-3,p.99)。
7) 含 AP-1 活性峰的 S-300 柱组分可直接上序列特异性 DNA 亲和层析柱(见实验 3)。
HeLa 细胞核提取物(从 12L 细胞培养物制得,见 pp.9l~93)(5-ml 样品)
XK26/40 柱(PharmaciaBiotech,Inc.)
Sephacryl S-300 HR(PharmaciaBiotech,Inc,)
液氮
试剂
TM 缓冲液+0.1mol/LKCl
(配方,见"试剂的配制",pp.131~138)
操作程序
所有操作均在 4℃ 下进行。
1) 取 5-mlHeLa 细胞核提取物样品(从 12L 细胞培养物制得进行凝胶过滤层析, 留取 50ul 提取物供随后的测活分析用。
2) 对 XK26/40 柱,采用下列柱参数:
直径=2.6 cm
柱长=34 cm
体积=180 ml
流速=100 ml/h
缓冲液=TM 缓冲液+0.1mol/LKCl
3) 于 S-300 柱加 5-mlHeLa 细胞核提取物样品。分部收集 5-ml 组分。
注:凝胶过滤层析的关键一歩是样品进入填料床。样品必须以薄而均匀的圆盘状进入凝胶。在柱的底部填料是装填得最均匀也最致密的。因此,有些研究工作者喜欢在使用前将柱子倒置,然后从柱的顶端装柱时此端为柱的底部加样。另一种办法不是将柱子置,而是从柱的底部加样,使样品上行,这也是可行的。这两个方法都是将样品加在柱中填料最致密最均匀的一端。还应注意,为达到层析的高分辨率,组分的大小应取得小些,一般约为上样体积的一半。
4) 从 S-300 柱洗脱所得的各组分留取 50-ul 等分试样,供 DNA 酶 I 足迹分析实验用。转录因子 AP-1 会在 Ve/V0 值约为 1.3~1.35 处洗脱下来。其他许多转录因子如 Spl、NF-I/CTF 和 AP-2 等则会在 Ve/V0 值约为 1.35~1.40 处洗脱下来(典型的 S-300 柱的洗脱图,见图 2-2,p.95)。
5) 各组分如在 24 小时之内使用,可储存于 4℃; 若长期保存,则需液氮冷冻,并储存于-80℃ 下。
注:蛋白质溶液的冻融是蛋白质化学研究能否获得成功的重要环节之一。对此有多种方法可供选择。作者建议,蛋白质样品应尽快浸入液氮冷冻(干冰/乙醇也能满足要求。但作者不推荐直接将蛋白质样品放入--80℃ 冰箱。此外,最重要的是冷冻的蛋扫质样品应尽快解冻。蛋白质活性的丢失常常是由于解冻造成的,与冷冻过程相反,解冻的过程往往很馒。作者建议,将冷冻的蛋白质样品沒泡在室温的水中,以尽快解冻,另外,为了加快解冻过程,清除所有在容器周围可能形成的冰也很重要。
6) 用 DNA 酶 I 足迹法测定各组分中的 AP-1 的 DNA 结合活性(样品结果,见图 2-3,p.99)。
7) 含 AP-1 活性峰的 S-300 柱组分可直接上序列特异性 DNA 亲和层析柱(见实验 3)。
来源:丁香实验