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简介
研究细胞内RNA与蛋白结合情况
原理
1. 用抗体或表位标记物捕获细胞核内或细胞质中内源性的RNA结合蛋白。 2. 防止非特异性的RNA的结合。 3. 免疫沉淀把RNA结合蛋白及其结合的RNA一起分离出来。 4.结合的RNA序列通过microarray(RIP-Chip),定量RT-PCR或高通量测序(RIP-Seq)方法来鉴定。
应用
细胞研究
来源:丁香实验
操作方法
(一).细胞裂解液获取A.单层细胞或者贴壁细胞处理1. 冷PBS清洗培养皿或培养瓶中的细胞两次2. 加入冷PBS后用细胞刮将细胞刮下来,收集至enpendoff管3. 1500rpm,4℃离心5min,弃上清,收集细胞4. 用与细胞等体积的RIP裂解液重悬细胞,吹打均匀后于冰上静置5min5. 每管分装200ul细胞裂解液,贮存于-80℃B.悬浮细胞处理:先收集细胞再计数,然后清洗裂解C.组织样品
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