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变性凝胶电泳实验

实验分类:

DNA 实验

最新修订时间:

简介

DNA序列测定的准确性很大程度取决于测序产物在变性聚丙烯酰胺凝胶上的分离度。一般说来,用于DNA测序的凝胶需要长40  cm,厚度均匀,含有4%~8%丙烯酰胺和7 mol/l 尿素。

来源:丁香实验

操作方法

基本方案

1. 制作每块凝胶时,首先要用肥皂及水小心严格地清洗两块30 cm×40 cm的前后玻璃平板,用去离子水冲洗后晾干,用喷射洗瓶喷10%乙酵或异丙醇使平板湿海。 2. 然后用Kimwipe纸或其他无绒纸巾将平板擦干。 3. 戴手套在通风橱工作,用浸湿了含5%二甲基二氯硅烷的氯仿溶液的Kimwipe纸在每片平板的其中一面加一层此溶液,并小心洗擦拭整面平板。 4. 待硅化层干后,用Kimwipe纸

缓冲液梯度测序胶

1. 按基本方案步骤1~5组装凝胶平板夹层。 2. 在2个100 ml 烧杯中,配制缓冲液梯度凝胶溶液:50 ml 用0.5×TBE配制,25 ml 用2.5×TBE配制,在50℃以下加热至固体完全溶解,冷却至室 温,加人20 μl TEMED和200 μl 10%SDS过硫酸氨于0.5 ×TBE / 凝胶溶液,轻轻混匀。加入10 μl TEMED及100 μl 10%过硫酸铵于2.

电解质梯度测序胶

1. 按基本方案步骤1~22灌制凝胶及进行预电泳,但上槽缓冲液为0.5×TBE,下槽为1×TBE。 2. 按基本方案步骤23~26步准备样品及加样。 3. 如需测≤400碱基的序列信息,加入3 mol/l 乙酸钠于下槽缓冲液至终浓度1 mol/l, 执行步骤5。 4. 如果需测大于400碱基的序列信息,先按步骤5进行,电泳2~3 h,然后加入3 mol/l 乙酸钠于下

含甲酰胺的测序胶

1. 按基本方案步骤1~5组装凝胶平板夹层。 2. 按所需浓度配制甲酰胺凝胶溶液,加热轻轻挽拌使之溶解,冷却至30℃以下。 3. 加入0.15 ml TEMED及1 ml 10%过硫酸铵,马上灌胶于凝胶平板夹层,观察聚合情况。 4. 在45~70 W 恒功率下电泳。 5. 按基本方案步骤19~33进行干胶及处理,但步骤18在5%乙酸 / 20%甲醇固定液中固定凝胶

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