全谱分析和定量分析分别能鉴定到多少蛋白？

一般情况下,常规样本全谱分析能鉴定到1000～3000个蛋白,定量蛋白质组学能鉴定到2000～6000个蛋白。

蛋白全谱分析鉴定的蛋白数与物种、样本中蛋白质含量及复杂程度、蛋白组分分离程度、数据库的完整度都有很大的关系。一般情况下，一次全谱分析可以鉴定3000-5000种蛋白；但一般胶条可以鉴定几种到几百种蛋白质。一张2-DGE能鉴定到的蛋白质总数最多2000种蛋白。而iTRAQ是伴随LC-MS/MS技术发展起来的蛋白质组定量技术，不用做双向电泳，同时可以克服2-DGE无法鉴定低丰度和修饰蛋白干扰的情况，一针即可鉴定2000种左右的蛋白(1.5hr)

鉴定蛋白数量主要取决于分析样品的复杂程度、数据库完善度、蛋白含量和蛋白质组分离程度等。如植物来源的样本中蛋白质种类和数量通常比动物来源的样本多，动物组织样本中蛋白质种类和数量比其血液样本多。通常情况下，全谱分析可以鉴定到1000~3000种蛋白。蛋白质组学的定量分析，可以鉴定12627种蛋白质，平均而言在每种组织类型中都检测到超过7500种蛋白质，其中有6357种蛋白为受检组织类型所共有。

全谱分析和定量分析它们分别能鉴定到的蛋白数，跟样品的复杂度和样品制备方法有较大关系。一般情况下，常规样本全谱分析能鉴定到1000～3000个蛋白，定量蛋白质组学能鉴定到2000～6000个蛋白。

全谱分析关注于鉴定和发现尽可能多的蛋白质，而定量分析侧重于定量测定目标蛋白质在不同实验条件下的表达量变化。因此，它们所能鉴定到的蛋白质数量因实验目的和条件而异。

全谱分析旨在广泛地鉴定蛋白质组中的蛋白质。在理想的实验条件下，全谱分析可以鉴定到数千甚至数万个蛋白质。然而，实际实验中可能会受到样品制备、质谱仪器性能、数据库搜索策略和数据处理等因素的影响，导致鉴定到的蛋白质数量有所减少。全谱分析通常可以获得生物样本中大部分蛋白质的信息，但可能无法涵盖全部蛋白质。

定量分析关注于目标蛋白质的定量测定。由于实验目的和条件不同，定量分析所鉴定到的蛋白质数量差异较大。定量分析通常关注于一组感兴趣的蛋白质，如差异表达蛋白、信号通路中的关键蛋白等。因此，定量分析鉴定到的蛋白质数量通常较少，可能在数十到数百个之间。