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派森诺基因云肠道菌群曼哈顿图

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一行行OWV9

派森诺基因云肠道菌群曼哈顿图

那个曼哈顿图是两两对比,上调组和对照组怎么设置呢,比如我想知道我的给药组和模型组相比有哪些属的丰富发生了差异,那我是不是要设置上调组是给药组然后模型组是对照组,还是说要反过来

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3 个回答

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huarenqiang5

有帮助

是的,将给药组设置为上调组,对照组设置为模型组。

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土井挞克树

有帮助

需要设置上调组是给药组然后模型组是对照组

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loveliufudan

有帮助

在派森诺基因云的肠道菌群曼哈顿图中,通常会将不同的样本分为两组进行比较,一组是对照组,另一组是处理组(如给药组、模型组等)。曼哈顿图上的柱状图表示肠道菌群的不同分类单元(如物种、属、门等)的显著性差异,而柱状图上的颜色和高度则表示它们的显著性程度和方向(上调或下调)。

对于您的问题,如果您想比较给药组和模型组之间不同属的丰富度变化情况,您可以将给药组作为上调组,将模型组作为对照组,这样得到的柱状图上高度较高的柱子就代表在给药组中相应的分类单元丰度较高,而高度较低的柱子则表示丰度较低。需要注意的是,在进行样本对比时,样本的数量和质量对结果影响很大,因此在选择对照组和上调组时需要仔细考虑。

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