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科研学霸天团，48小时有问必答
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问
提取RNA用的真菌培养过长时间会有什么影响吗？
loveliufudan
长时间的培养可能会对RNA的质量产生影响，导致RNA降解、破裂、变性或者受到其他形式的损伤，从而影响RNA的纯度和完整性。对于曲霉菌这类真菌，其RNA在培养过程中也可能会被分泌酶或细胞外酶降解，进一步影响RNA的质量。因此，如果要提取RNA，最好是在菌细胞处于最佳生长状态时进行，一般是在菌落刚刚形成或在对数生长期进行提取。对于您目前培养了10天的曲霉菌，可以先进行RNA提取，但需要注意RNA的纯度
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问
熔链曲线图谱数据分析
毛利小五郎的徒弟
可以使用image做熔链曲线图谱，把数据输入后选择图谱类型，然后进行输出
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问
提RNA的细胞样品这样放在冰上照了半小时紫外线还能用吗？
asswei
所有的操作均在15-30°C下进行，所用的试剂均放置于15-30°C。组织在加入氯仿之前是可以在-60—-70°C放置一个月 。RNA沉淀在75%乙醇中在2-8°C下至少可以放置一周，在–5— -20°C至少可能放置一年。提RNA的细胞样品这样放在冰上照了半小时紫外线还能用。
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问
circRNA的多种ID
毛利小五郎的徒弟
是不同的表达方式，可以在基因组中查相应的基因名称
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问
拟南芥叶片细胞的空间转录组图谱有助于攻克哪些植物叶片中高度相似细胞类型的分子特征解析难题？
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问
求药物化学（非编码RNA方面）的综述期刊
loveliufudan
Molecular Therapy - Nucleic Acids: 该期刊收录以核酸为主题的研究，包括非编码RNA的研究，周期一般为2-3个月左右。Frontiers in Genetics: 该期刊收录基因和基因组学的研究，包括非编码RNA的研究，周期一般为3-4个月左右。Briefings in Functional Genomics: 该期刊收录基因功能研究的文章，周期一般为3-4个月左右
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问
流感病毒TCID50测定
z流沙z
可以考虑用2%FBS的培养基稀释后加入细胞中，培养72h左右，减少血清对病毒的影响
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问
药物化学（关于非编码RNA的）综述期刊推荐；希望命中率高周期在4-5月；sci收录
loveliufudan
Medicinal Research Reviews: 这是一本涵盖药物化学、生物化学、分子生物学和药理学等领域的综述期刊。它被收录在SCI和JCR中，周期约为4-5个月左右。Journal of Medicinal Chemistry: 这是一本涵盖药物化学和药理学等领域的期刊，它的主要内容是有机和药物化学方面的研究和综述。它被收录在SCI和JCR中，周期约为4-5个月左右。Bioorganic
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问
trizol提取RNA空白为啥有沉淀
z流沙z
如果空白是指没有样品的话，那就是试剂或者管子带有杂质了
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求教：应该选择单组率的meta分析还是直接合并？
毛利小五郎的徒弟
不可以直接合并，想要合并需要原始数据，没有建议单组率meta
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做关于miRNA的实验，inhibitor和mimics没有设置NC组，是否能行
loveliufudan
在实验设计中，通常建议包含一个阴性对照组（NC组）来确定实验中的结果是否受到转染试剂的非特异性影响。因此，如果您使用了miRNA的mimics和inhibitor，最好还是包含一个阴性对照组来确认实验结果的准确性。对于miRNA实验，通常使用阴性对照组来测试转染试剂的非特异性影响。阴性对照组可以包括不转染（只加转染试剂）、转染质粒或使用miRNA的非特异性mimics或inhibitor等。由于您
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问
求助核质分离检测RNA定位的分析方法
毛利小五郎的徒弟
要获得如下表格1、导出PCR结果CT值到Excel2.结果导入GraphPad画图3.新建数据，选择Grouped，3个重复4.把Excel计算好的结果数值复制过来5.选择二维分组柱状图得到结果
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总RNA浓度测量
毛利小五郎的徒弟
会偏大的，可以先进行测量再添加。
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干扰片段里可以包含保守结构域吗？
毛利小五郎的徒弟
可以有保守区域，但是不要过多，少量保守区域不影响
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请问大家，在提取软骨组织RNA时必须要加乙醚吗？有没有什么替代试剂？
loveliufudan
除了乙醚外，还有其他试剂可以用于去除脂质、蛋白质和其他杂质，例如酚/氯仿、三氯乙酸、异丙醇、硝基酚等。其中，酚/氯仿是一种常用的替代试剂，可以替代乙醚，用于软骨组织RNA的提取和纯化。酚/氯仿的使用方法和乙醚类似，但是其溶解力比乙醚弱，需要加入同等体积的等相酚/氯仿混合液进行萃取。总的来说，如果您担心乙醚的毒性和挥发性，可以考虑使用酚/氯仿等替代试剂进行软骨组织RNA的提取。但需要注意，不同的试剂
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有没有人用过invivogen的抗真菌药fungin
来一起探讨
用抗真菌药在治疗细胞的时候，不要一次将药物加入细胞培养基中，要先换一半液，培养一段时间后，再次将培养基全部换成含有药物的培养基，减少对细胞的损伤。
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小鼠下丘脑RNA提取可以做吗？
loveliufudan
可以的。下丘脑是大脑的一部分，其中包含许多重要的神经元和神经递质，因此从小鼠下丘脑中提取RNA可以用于分析基因表达和信号通路的研究。RNA提取的方法可以根据实验室的具体需求而定，例如使用商业RNA提取试剂盒或自制试剂盒，根据实验室的设备和技术水平选择合适的方法。需要注意的是，在取样、提取和储存RNA过程中，应避免RNA降解和污染，以保证实验的准确性和可靠性。
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伊红染色测定精子畸形率中的去组织碎片是什么意思？
loveliufudan
在伊红染色前，需要将附睾组织去除，只留下精子。这个过程中，有可能会有组织碎片残留在精子混悬液中。这些组织碎片会影响对精子形态的观察和计数。因此，在用明移液枪吹打精子混悬液时，可以轻轻吹打，以去除残留的组织碎片，这就是所谓的去组织碎片。
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求助‖真菌鉴定，除了ITS还可以用什么呢
asswei
真菌检查的方法包括直接镜检、真菌培养、血清学试验、组织病理检查等，最常用的就是真菌的直接镜检。真菌的直接镜检需要使用酒精清洁创面，可以收取表面的皮屑、毛发、甲板或者体液组织等。将收取的标本放在玻璃片上，加5%-10%的氢氧化钾液，盖上盖玻片，溶解一会儿，一般5分钟后可以在显微镜下低倍镜下寻找有无菌丝或者孢子，寻找到菌丝或者孢子后可以转为高倍镜进行观察。其他还有通过筛子检验，比重检验法，染色检验法，
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请教trizol法提取外泌体RNA该如何弄。
loveliufudan
以下是Trizol法提取外泌体RNA的步骤：收集外泌体：用离心或超声波等方法收集培养基或生理液中的外泌体。建议在收集前，预先处理样品，如去除细胞残留物、碎片等。加入Trizol：向外泌体悬液中加入 Trizol 试剂，建议加入试剂体积是悬液体积的 10% 到 20%。轻轻摇晃管子使 Trizol 均匀分散。加入氯仿：加入氯仿等有机溶剂，摇晃离心管混合均匀。离心管在室温下放置5-10分钟，让混合物充
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