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于小鱼鱼1998
常用的生信分析软件有很多,但是常用的几个软件包括Qiime、Mothur、R和Python。
loveliufudan
在生物信息学中,有许多软件可用于预测蛋白质的相互作用位点。以下是一些常用的生物信息学工具和软件:
1. I-TASSER:I-TASSER(Iterative Threading ASSEmbly Refinement)是一种用于蛋白质结构预测和功能注释的软件。它可以预测蛋白质相互作用位点,并提供相互作用模型和结构预测。
2. HADDOCK:HADDOCK(High Ambiguity Driven biomolecular DOCKing)是一种用于蛋白质-蛋白质相互作用模型构建和分析的软件。它利用信息驱动的方法,预测蛋白质的相互作用位点和结合模式。
3. ClusPro:ClusPro是一种用于蛋白质-蛋白质和蛋白质-配体相互作用的预测和建模工具。它使用蛋白质结构预测和蛋白质蛋白质对接技术,帮助识别相互作用位点和预测蛋白质复合物的结构。
4. PatchDock:PatchDock是一种用于蛋白质蛋白质对接的软件,它可以预测蛋白质的相互作用位点和复合物结构。
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STRING是一个广泛使用的蛋白一蛋白相互作用数据库和预测工具。