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taq酶扩增片段以后,切胶回收,回收产物纯度挺高,连接t载体一直连接不上,按照t载体的说明书设定添加载体和目的片段的比例,4度过夜、16度过夜、室温一小时,都试过,蓝白斑筛选,挑的白斑,测序回来blast结果都是载体。想知道是哪里出了问题。
毛利小五郎的徒弟
可能是酶切的末端不匹配的原因,检测一下酶切末端
sswei
可能是载体酶切不完全所造成的,建议目的片段加100ng,连接片段与载体摩尔比,一般3~8:1,提高片段的量,先按8:1试试,另外拿酶切空载作对照实验,便于比较分析
loveliufudan
有几个可能的原因可能导致这种情况:
1. 载体或目的片段的质量:请确保您使用的T载体和目的片段都经过正确的质量控制,如凝胶电泳或其他质量检测方法。低质量的载体或目的片段可能会影响连接反应的效果。
2. 酶消化的效果:连接反应中使用的酶,如限制性内切酶和连接酶,可能存在不理想的消化或连接效率。确保您使用的酶具有高活性并且按照厂商说明书进行适当的消化和连接。
3. 连接反应条件:连接反应的条件可能需要优化。除了温度和时间的设置外,还要确保使用适当的缓冲液、酶浓度和反应体系中其他关键成分的浓度。尝试优化这些条件,可能会改善连接的效果。
4. 高背景的问题:在连接反应中,背景可能会出现未连接的载体分子,从而导致回收的白斑中大部分都是载体。这可能与实验条件、连接反应的效率或其他因素有关。您可以尝试优化连接反应条件,如减少载体浓度或增加目的片段的量,以减少未连接的载体分子。