dxy_ud3spak5
求问病毒刺激细胞引起某基因mRNA表达水平降低(刺激时间0 12 24 48h)的原因有哪些?我收的是板中存活细胞的RNA,有RNA降解吗?
土井挞克树
板中存活的RNA也是会有降解的,病毒刺激后会改变转录,导致表达降低
dxy_ud3spak5
那我提前到24h收样,获得的结果是否可靠呢?我是想证明病毒刺激导致那个蛋白表达下降,可以排除RNA降解的因素吗?谢谢
sswei
其可能原因有: 1) 与选择的检测时间有关。可能因mRNA的下降尚未反映在蛋白量的变化上或者未达到足以检测的水平,所以一般建议蛋白和功能检测时间要稍稍推后。 2) 与蛋白在细胞中的表达情况有关。mRNA的翻译过程非常复杂,细胞内基因的表达总要维持一个平衡,某些蛋白表达量到一定的程度之后,足以维持其细胞功能,将可能暂时“关闭”表达的功能,转录出来的部分mRNA可能不参与蛋白翻译的过程,故mRNA水平下调与蛋白水平下调并非完全成正相关的关系。
huarenqiang5
主要与以下几点有关:
1. 启动子强度
2. 内含子
3. IRES(内部核糖体进入位点)
loveliufudan
这种下降可能有以下原因:
病毒感染引起细胞凋亡:病毒感染可能导致细胞凋亡,从而减少某些基因的mRNA表达水平。
免疫反应:感染会激活免疫反应,可能会抑制某些基因的表达。
病毒基因产物:病毒感染可能会产生病毒基因产物,这些产物可能会抑制宿主基因表达。
RNA降解:RNA分解是RNA分子分解成较小分子的过程,这可能是RNA表达下降的一个原因。
如果你用的是板中存活细胞的RNA,则不应该有RNA降解的问题。因为RNA只有在细胞死亡后才会降解,而板中存活细胞的RNA应该是来自于仍然存活的细胞。但是,在处理RNA的过程中,如RNA提取、存储等,可能存在RNA降解的风险。因此,在处理RNA时应该注意避免RNA降解的情况。