求问如何明确目的蛋白的哪个功能结构域起作用？

可以做肽链分解或者肽链合成来验证

针对审稿人的提问，可以考虑以下实验来回答问题：

Co-IP 实验：使用特异性抗体对目的蛋白进行共免疫沉淀实验，然后进行质谱分析或 Western blot 检测，以确定与目的蛋白结合的蛋白质和相互作用的结构域。

蛋白质结构分析：通过利用蛋白质晶体学、核磁共振等技术，得到目的蛋白的三维结构，进一步确定其结构域和与其他蛋白质相互作用的部位。

分子生物学实验：例如利用 CRISPR/Cas9 技术敲除或过表达目的蛋白的某个结构域，观察对目的通路的影响，进一步确定该结构域在目的通路调控中的作用。

体内/体外磷酸化实验：磷酸化是许多信号通路中常见的调控方式，通过利用体外酶反应或体内磷酸化实验，可以确定目的蛋白的磷酸化状态以及该磷酸化是否参与目的通路的调控。

转录因子活性实验：使用 luciferase 报告基因系统等技术，检测目的蛋白的结构域对转录因子活性的影响，以及其是否参与目的通路的调控。

以上是一些常用的实验方法，具体应根据目的蛋白的特性和研究问题的需求进行选择和优化，最终得出目的蛋白结构域及其参与目的通路调控的结论。