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用于基因测序的标本应该如何保存?选择哪种保存液?-80还是液氮?
一个小哭包
1. 植物组织:植物组织一般要求重量大于 4g。首先我们要准备好液氮预冷的无酶管,并做好取样器械的消毒和去RNA酶处理,尽量选取新鲜幼嫩、生长旺盛部位的样本进行迅速采集,然后用RNase-free水对样品表面进行快速的清洗,吸干表面液体之后放入无酶管中液氮速冻(时间不要太短哦),待彻底冷冻后,转移至-80℃冰箱保存。2. 动物组织:送样的重量一般要求在 2g以上。若在实验室中取样,做好器械的消毒和去RNA酶处理的前期工作后,迅速进行取样。取下的样品用RNase-free水迅速进行冲洗,吸干表面水分,放入预先放置在液氮中预冷的无酶管中,速冻一段时间,转入-80℃冰箱保存;对于野外采样,无法携带液氮等情况时,可以使用RNA保护剂。用RNase-free水对样品表面进行快速清洗,然后迅速切割成规定的大小(约黄豆粒),将样品完全浸没在RNA保护剂中,可以置于4℃中过夜(使保护剂渗透进组织中),转移至-80℃冰箱保存。
3.细胞样品:转录组测序中,细胞一定要达到足够的数量,以保证抽提的RNA的量。所以对于培养的细胞系,首先要确定细胞数量(建议5×10^6以上)。首先对收集好的细胞用1×PBS清洗几遍,贴壁培养的先用少量胰酶消化一下(切记不要消化过度),离心,弃PBS,加入适量的Trizol裂解液并反复吹打混匀,直至形成清亮透明的液体,转移至无酶管中,放-80℃冰箱保存。
4.血液样品:液氮速冻后,放-80℃冰箱保存。每个环节尽可能的快速完成,避免RNA的降解。
血浆样品,要使用抗凝采血管采集,采集后颠倒混合,放于4℃静置分层或离心分离出血浆,分装,置于液氮速冻,放-80℃冰箱保存。
血清样品,使用不加抗凝剂的采血管采集全血,于4℃静置分层或离心分离出血清,分装,置于液氮速冻,放-80℃冰箱保存。
5.微生物样品:如果是液体培养的微生物,可取适量的菌液离心去上清,之后将沉淀收集起来放入液氮速冻一段时间,或加入Trizol进行裂解(革兰氏阳性菌需要先研磨),之后样品转移至-80℃冰箱保存。
如果是固体培养基上的真菌,取足量的菌丝体放入无酶管中进行液氮速冻,或加入适量的Trizol进行裂解,之后转移至-80℃冰箱保存。
6.互作样品:尽量选取病灶部位进行取样,取样前确认取样的部分没有污染或者杂样。可通过qPCR,显微镜观察或者生理生化表型等方法确定侵入种的占比,选择合适的侵染时期进行研究。
bamboopiggy
要做RNA-seq的标本,泡在trizol或者是rna稳定保存液中,放-80保存就可以
未来9
测序的样品分为五大类:植物、动物、血液、微生物和互作类型,不同的类型对于取样方法和要求不尽一致.
但一般经过不同处理后放-80℃冰箱保存。
天一湖医者
用于基因测序须将标本于液氮冻存。