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sashimi plot 图怎么看呢,图里的线线上的数字以及不同的线连接,这些都是啥意思呢,整不明白了

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高Gao高

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天一湖医者

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IncLevel1可被认作是exon inclusion level(ψ),是Exon Inclusion Isoform在总(Exon Inclusion Isoform + Exon Skipping Isoform)所占比例

  • I 是指mapping到exon inclusion isoform上的reads数,对应结果表格中的IC_SAMPLE_1
  • S 是指mapping到exon skipping isoform上的reads数,对应结果表格中的SC_SAMPLE_1
  • lI 是指effective length of the exon inclusion isoform,对应结果表格中的IncFormLen,主要用于对I标准化,用于计算ψ
  • lS 是指effective length of the exon skipping isoform,对应结果表格中的SkipFormLen,主要用于对S标准化,用于计算ψ
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