作为科研人员的我们总少不了阅读大量文献,理解文献内容就成了科研生活常态,而我们平时复制 PDF 内容黏贴到网页翻译的时候可能会出现多余换行而导致翻译乱码,译文与中文阅读习惯不符的情况,翻译结果很差,需要手动删除换行。是不是这种场景很是熟悉呀~为了避免不必要的烦恼,一款宝藏软件惊喜上线~先不卖关子了,是时候让大家见识一下这款软件的庐山真面目了,它就是CopyTranslator。1. 打开网址后见下图网址链接:https://hypercube.top/copytranslator/2. 选择:DOWNLOAD3. 点击 download from GitHub点击后出现下图,然后下拉4. 选择百度云下载5. 软件下载后,进行解压安装,双击程序进行运行全部安装好后就是见证软件奇迹的时刻!下面我拿一个文章进行举例,各位看官请看好~首先我在谷歌翻译中对一段进行翻译。这熟悉的跳行断句操作简直是我们平时再熟悉不过的翻译问题了,有时候不得不感慨一下,看个文献真是非常不容易呢~不过,有了这款软件之后,就可以既解救双手又解救大脑啦!我们依然选择相同的一段进行翻译,作为对比:还是先进行双击打开软件的操作
今年三月底,前列腺癌宣传月在英国如火如荼地进行,旨在提高人们对前列腺癌的认识。在BMC Medicine,我们来看看前列腺癌研究和治疗方面的一些最新进展,同时我们也推出了新的前列腺癌聚焦文章集,由Sigrid Carlsson和Andrew Vickers担任客座编辑。图片1前列腺癌每年导致30多万人死亡,是全球第二大常见的男性癌症类型。前列腺癌的病因尚未完全确定,但已知的危险因素包括非洲-加勒比种族、年龄偏大和家族史。饮食与前列腺癌有关吗?饮食也被认为与前列腺癌风险有关。在《BMC医学》上发表的一篇综述文章中,作者Lin Pao-Hwa和他的同事们讨论了饮食在前列腺癌发病率和进展中的作用的最新证据。作者强调,尽管有些发现是不一致的,但健康饮食是预防前列腺癌的一个有前途的方法。检测和筛选前列腺癌的发病率在过去20年里急剧上升,这主要是由于筛查的增加。前列腺特异性抗原(PSA)筛查前列腺癌仍存在很大争议,常规检测的风险效益比尚未完全确定。在一篇评论文章中,Eric Kim和Gerald Andriole探讨了各国PSA筛查的指导性建议,强调了不同组织的建议差异很大。例如,欧洲泌尿外科协会
四分之一的黑人男性一生中会被诊断出患有前列腺癌。十二分之一的人会因此而死。这些令人震惊的事实发表在今天的BMC医学杂志上,来自英国前列腺癌的合著者Alison Cooper在这个博客中解释了更多。风险背后的研究按比例计算,英国死于前列腺癌的黑人男性比白人男性多。事实上,黑人男性被诊断为前列腺癌和死于前列腺癌的几率是前者的两倍。重要的是,我们要了解为什么会出现这种情况,这就是为什么我们要资助这一领域的两项关键研究。伦敦国王学院的克里斯汀·加卢斯蒂安博士正在调查60%的黑人男性缺乏一种名为DARC(有助于减缓癌症扩散)的蛋白质是否与患侵袭性前列腺癌的风险更高有关。帝国理工学院的迈拉·麦克卢尔博士正在采取一种不同的方法,并确定病毒感染是否可能在黑人男性前列腺癌的发展中起作用。虽然黑人和白人男性被诊断为前列腺癌的风险差异令人震惊,但事实上,很少有黑人男性意识到他们面临更高的风险,这更是雪上加霜。英国只有8%的黑人男性知道他们患前列腺癌的风险高于平均水平。更糟糕的是,23%的人认为他们的风险低于平均水平。提高认识这显然需要改变。去年,我们与英国国家医疗服务局(NHS England)合作开展了一
电脑内存不够是一件很烦恼的事儿,PS 等软件动不动就几个 G,不仅占用电脑内存,拖慢电脑速度!而且,各种安装包还无法安装时才是最令人绝望的!!!不过还好,现在一些软件都可以找到在线版使用,给我们这些内存不够的小伙伴们,简直就是天降福利~今天分别给大家安利四款在线软件,相信有了这四种在线工具,处理图片应该是不成问题的啦~在线 PS:photopea网址:www.photopea.com网址打开之后出现如下界面,然后下拉一点点就是我们平时熟悉的 PS 界面啦:「New Project」新建一个文件,只要你会 PS,这里面的使用方式就不会难倒你啦~下面我们就用权律二小朋友来举个例子作为在线 PS 存储文件:图片直接拖至即可,就和 PS 的操作一样一样的~然后我们随意改动了一下大小,之后对文件进行了保存。选择「edit」中「save project as」即可:可以将文件保存成 PSD 格式也可以修改成图片,按照自己的需求便可~在线抠图:removebg网址:https://www.remove.bg/打开网址后的界面如下:然后选择「select a photo」。我们在此还是以权律二小朋友的
想必大家对聚类热图 Heatmap 并不陌生,聚类热图是我们展示基因芯片或测序结果比较常用的方式,可以直观地反映样品间的相似程度。根据基因在各个样本中的表达量绘制的聚类热图,用颜色深浅来代表基因表达量高低。目前绘制热图的工具很多,像 MATLAB 、MeV (Multiple ExperimentViewer)、GraphPad Prism、R 语言的 Heatmap 等等。今天介绍两种简单的工具 ——Excel 和 Heatmap Illustrator,助你绘制想要的热图。图中每一列代表一个样本,每一行代表一个基因在不同样本中的表达程度一、利用 Excel「条件格式」——「色阶」功能制作热图1. 首先在 Excel 中输入自己的原始数据,像下图。2. 选中所有数据,在顶端目录中选择「条件格式」中的「色阶」的「其他规则」。3. 基于样式选择「三色刻度」,之前的样本是数字,所以对应的类型栏中都改为「数字」,由于原始数据都在 0 - 10 之间,可以将「最小值」,「中间值」和「最大值」设置为 0,5,10。颜色设置可以随意选,但是建议深浅适宜。4. 于是得到这样。5. 选中数据,鼠标右键
今天推荐的这本神仙杂志就是:JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY看标题大家估计都在犯嘀咕吧,能有这种好事?是的~下面跟随学霸君一起再仔细了解一下吧!杂志信息期刊官网:onlinelibrary.wiley.com/journal/ 10.1002 /(ISSN)1097 - 4644投稿地址:mc.manuscriptcentral.com/jcb-wiley图片来源:杂志官网截图影响因子说到影响因子,不要被这个折线图的起起伏伏给吓到~定睛一看,这本杂志的影响因子还是比较稳定的,近 10 年来一直在 3 分上下徘徊。虽然 2017 和 2018 两年从 3.446 逐步下滑至 2.959,但是多数人还是比较看好未来上涨的!该杂志的年发文数为 483。根据数位作者分享的投稿经验来看,该杂志的接受速度:很快!平均 1 个月。而且根据相关网站统计数据,平均录用比例更是高达惊人的 95%!相信对大多数同学来说,是本很友好的杂志了~当然也有人表示自己因为查重过高卡在了一审挺久,个别特殊情况另当别论。
实验菌整理了很多资料,带大家一起去盘点所有的国产 SCI!经过这么些年的不断发展,国产 SCI 已经不容小觑了,全球所有的 SCI 杂志有近 9000 本,而 2019 年国产 SCI 期刊共 189 本,生物医学类国产 SCI 期刊共计 64 本!5 分以上的期刊一共有 8 本,具体如下:3-5 分的期刊一共有 14 本,具体如下:2-3 分的期刊一共有 9 本,具体如下:1-2 分的期刊一共有 20 本,具体如下:1 分以下的期刊一共有 13 本,具体如下:国产 SCI 现状分析1、高分 SCI 期刊较少,但是现有的高分 SCI 具有一定国际影响力。这类高分 SCI 大多采用「借船出海」的模式,与国际上的著名出版商合作出版,比如 Nature Publish Group,Oxford University Press,Wiley,Springer。比如 CR、CMI 和 APS 近年来影响因子稳步增高,在一定程度上就得益于 Nature Publish Group 这一出版平台。Cell Research(15.393)CMI(7.551)PC(6.228)2、「纯本土化出版」的期
今天推荐的这本好刊的年发文量着实是多 ——1600+ !BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY影响因子稳定从现有的数据来看,去年的发文量高达 1613 !惊喜不,刺激不?而且它的影响因子的变化趋势也很喜人!这十年来一路从 1.41 涨到 3.45!未来的增长也很被看好~可以说这本杂志的表现及其稳定!杂志详细信息杂志官网:http://www.journals.elsevier.com/biomedicine-and-pharmacotherapy/图片来源于杂志官网审稿速度快根据 Elsevier 官网的数据:平均 7 周;众多投稿的作者反馈也是不到 2 个月。而接受比例也接近 6 成,57.37%!作者一:审稿速度快,1 个月内有审稿消息,两个审稿人意见一正一反,后来坚持自己观点并反驳了其中一个审稿人的意见后得到编辑认同,二修改了几个小的语法错误,补充了个通路图就直接接收了,接收后 1 周就网络见刊,前后总共就 2 个月时间,速度很快。另外没花一分钱版面费,编辑也十分认真,十分好,推荐。作者二:这个杂志确实效率,投稿两周修回,两周时间补实验修回去,二审两周
「天下武功,唯快不破」,这是星爷电影《功夫》中火云邪神告诉我们的一个道理。而对于常年奔波实验一线、兼屌丝与油腻气息于一身的科研汪,快速选择色谱柱开发出检测方法不仅可以使我们「治秃有望」,亦可成为撩取小师妹芳心的工具。所谓知己知彼,快速选择色谱柱建立在对它深入了解的基础上,我们今天就来聊聊那个「它」。色谱柱的结构色谱柱由接头、螺帽、柱管、填料、垫圈及过滤片等组成,其中填料为色谱柱的核心部分,科研工作者在填料上发挥奇思妙想,开发出市面上种类繁多的色谱柱,每种色谱柱又有其独特的选择性及应用。色谱结构常用的色谱柱填料基质为硅胶,硅胶作为基质有如下优点:无毒无味,化学性质稳定。具有高机械强度和高的比表面积。可利用表面健合反应来广泛满足正相、反相、离子交换和体积排阻色谱的需求。硅胶填料通式根据 R3 基团的不同,可将色谱柱分为不同的类型。键合是指将固定相共价结合在载体颗粒上,键合相色谱可分为正相色谱和反相色谱。键合方式分为单官能键合、二官能键合及三官能键合:A:三官能团键合,键合相稳定、pH 耐受范围高B:二官能团键合:增加载样量及方法稳定性C:单官能团键合:柱效高,平衡块,但稳定性相对较差由于键
作为一个只做湿实验的生物汪,拿到公司给的 RNA-Seq 分析结果时是开心的,然而感觉离 published figure 差一点点,作为精益求精的汪必需要亲自上手。求教了一下会生信的同学,他说:「R 就可以作图。」「我不会,我也不想学啊!」他又说:「Excel 就可以作图,散点图即可。」哇,既然是散点图,那 GraphPad Prism 就可以做啊!于是我开始了新一轮的用 GraphPad Prism 做火山图的探索(想练手的可以去 GEO 数据库里下载别人发表的数据来一起探索,我就用自己的数据来做示范)。作图前,我们先有点预期,了解一下火山图该有的模样(大致如下,我们就拿它当模板吧)既然要做图就要有参数。瞅一眼横纵坐标,心中了然,要做图需要两个参数:差倍数及 P 值(或 FDR,或 Padj 值)。在 RNA-Seq 的数据表格中拎出这两组参数(另外,请把 genename 也一道拎出来,后续有用)1. 作图前的数据预处理在做火山图前,需要将所获得的基因表达的表格中对应的 P 值及差倍变化(FC,fold change)换算成」-log10P」和「log2FC」。然后将基因名(sy
今天想介绍的一本杂志是:CELL RESEARCH这本杂志不得不说是中国期刊的荣耀啊,非常具有冲击 CNS 地位的潜力!相信不少同学或多或少都拜读过上面的文章吧~实验菌今天就带大家一起去再次认识一下这本熟悉的老朋友杂志信息《cell research》是中科院主管的一份月刊。官网地址:www.nature.com/cr/index.html图片来源:CELL RESEARCH 杂志封面影响因子从 2007 年开始,影响因子像打了鸡血一样蹭蹭蹭的疯涨,从 4.2 一路来到了 15.3!虽然去年小小的跌了 0.2,但是随着杂志不再是依靠 review 来拉分数,大多数人还是很看好未来的增长空间的。关于 CR 的影响因子,一直有质疑声表示其虚高。这边实验菌援引了几位投稿作者的评论,影响因子真的没有虚高:作者一:018 年中投 Science 送审一个月后竞争原因拒稿,转投 Cell Research 当天送审,补了两个 qPCR 直接接收,一个月以后 online issue highlight,cover storyCR 的审稿流程非常正规国际化,发表的工作也有很多是从 CNS 上竞争失利
发表过 sci 的小伙伴们应该都有过感慨,版面费好贵啊,动辄上千美元。OA 期刊的版面费会更高,细细想来,这是一个相互的过程,如果不收取一定程度的版面费(当然不排除灌水期刊),那么全世界的读者会花费更多的钱来下载阅读全文。即使是这样,在日常的文献检索过程中,我们还是会需要付费才能下载阅读大部分期刊。对于学生党来说,想想就肉疼啊~之前给大家介绍过 pubmed 的一款插件叫 scholarscope(传送门),大家用得是不是很爽~今天继续给大家安利另外一款插件叫 tampermonkey(油猴),非常的强大,有了此猴儿,妈妈再也不用担心我们不能免费下载阅读期刊文献了,而且覆盖面几乎为 100%!按照之前的习惯,今天我还是以火狐浏览器为例来给大家介绍这款插件。1. 打开浏览器,点击右上角菜单选项,在下拉菜单中选择「附加组件」。2. 进入下一级对话框,输入 tampermonkey 进行搜索。3. 得到搜索结果:一个戴眼镜的黑猴头 - 世界最广泛的脚本管理器。4. 选中后点击安装,后重启浏览器就可以看到浏览器右上角多了这个猴头图标。接下来让我们领略一下该神器的神奇。5. 安装好后浏览器右上角
在2019年INSAR的主题演讲之前,我们与凯瑟琳·罗德教授讨论了她的研究。今年的国际自闭症研究学会(INSAR)年会将于5月1日至4日举行。会议开幕时将发表一个主题演讲,题为“编码和非编码区域的新变化:我们可以从凯瑟琳·罗德教授关于病因途径的数据中学到什么”。罗德教授是卡内基梅隆大学(Carnegie Mellon University)的副教务长兼统计学和计算生物学教授。除了获得2013年珍妮特·L·诺伍德奖、1997年科普斯·斯内德科奖和总统奖外,她迄今已发表了275多篇论文。谢谢你抽出时间和我们说话。你的研究主要是基于统计遗传学。你能解释一下你的专业领域在哪里,以及统计遗传学如何应用于自闭症研究吗?凯瑟琳·罗德教授:作为一个统计学家,我自然相信统计推理几乎可以应用于任何数量问题。关于孤独症的研究有很多开放的定量问题。我的专业领域是统计建模、高维推理和机器学习。虽然可以为许多问题找到现成的工具,但我相信仔细建模是获得几乎所有统计问题的最优解的第一步。在我看来,解决方案是最优的,如果它满足三个约束条件:1)模型接近生物过程的关键特征;2)它提供了关于正在调查的问题的有力推论;和3)
据世界卫生组织报道,截至 2018 年底,全球估计有 3790 万艾滋病毒感染者,与艾滋病相关的死亡人数达到 77 万人。其中非洲地区受到的影响最大,2018 年有 2570 万艾滋病毒感染者,占到全球艾滋病毒新发感染总数的近三分之二。图片来源:世界卫生组织官网艾滋病在中国1985 年 6 月,北京协和医院首次报告我国境内第一例艾滋病病人,此人为来中国旅游的美籍阿根廷人,发病后 5 天死亡,其并发症状为卡氏肺囊虫肺炎感染。之后的艾滋病病例报告也均是来华外国人和海外华人。1989 年 8 月,负责云南省艾滋病监测工作的工作人员在瑞丽市戒毒所采得吸毒人员血清 50 份,其中检测发现 HIV 阳性者 26 份。此后,在云南吸毒人群中共发现 HIV 感染者 146 例,这标志着艾滋病已由从国外输入发展到国内传播。截至 2018 年 9 月 30 日, 全国报告现存活 HIV 感染者/AIDS 病人 85.0 万例, 报告死亡 26.2 万例。图片来源:中国科学院微生物研究所HIV 病毒学研究HIV 病毒根据血清学反应和病毒核酸序列可分为两型:HIV- 1 型和 HIV- 2 型。在 HIV-
实验菌今天想和大家聊聊一本去年颇受关注的新期刊:Communications Biology2017 年 9 月 6 日公布并于 2018 年正式推出,经过了 1 年的发展,值此影响因子即将公布之际,不免让人好奇它发展的怎么样了,是否值得投递?杂志信息实验菌想先谈谈 Communications Biology 的杂志定位。2017 年 9 月 6 日,Nature 新增一系列三本跨学科领域的开放获取期刊,即 Communications Biology、Communications Chemistry 和 Communications Physics。图片来源:Nature 官网截图Nature 的期刊会优先审查工作的突破性或创新性,然后是广泛性 (方法) 和热点性 (话题)。这三个至少要有两个才可能送审,因为后两者是提高影响因子的宝。而这三本期刊实际上最主要的目的是弥补:专业性工作具有较高的突破性或创新性,但所涉及的面不够广泛或者话题不是热点话题的工作。根据 Nature 公布的相关信息,从 Nature 系列杂志拒稿的文章,可以选择转投到 CB 杂志上;而从 CB 杂志上拒稿的文
发表在《血癌杂志》上的一项新研究提供了多发性骨髓瘤和慢性淋巴细胞白血病之间的遗传相关性的证据,使人们能够洞察这些血癌的共同遗传基础。我们经常谈论从我们的家庭传下来的特征——无论是我们父亲的发际线,我们祖母的鼻子,还是我们叔叔的音乐天赋。这些特征可能受我们的环境或遗传组成的影响。我们可以量化我们的基因构成对某些性状的“遗传力”的影响。这种遗传力是用一个量表来衡量的,0表示“遗传没有影响”,1表示“完全是遗传造成的”。除了身体特征和技能,我们还遗传了某些疾病的倾向,包括癌症。观察研究表明,血癌可在家族中聚集(图1),特别是多发性骨髓瘤(MM)和慢性淋巴细胞白血病(CLL)的聚集,这表明这些疾病具有共同的遗传易感性。然而,这些研究无法描述遗传和环境对疾病风险的贡献。最近,我们的实验室在MM和CLL之间进行了一项基因相关性研究,这使得我们能够量化疾病共同遗传倾向的遗传成分。如果一种疾病的遗传力可以被认为是基因组内导致疾病风险的遗传变异的指纹,那么我们用来量化遗传相关性的技术已经试图测量MM和CLL两个“指纹”之间的相似性。我们发现MM和CLL之间存在正的遗传相关性,支持了观察研究,并提供了共享
今天给大家安利一本影响因子还不错(7 分以上)的国产期刊:Protein & cell期刊基本信息Protein & cell 中文名称《蛋白质与细胞》,据 2019 年公布的 2018 年度 SCI 期刊引证报告,Protein & cell-2018 年度影响因子为 7.575。该刊 2010 年创刊,2012 年 11 月进入科学引文索引(Science Citation Index)。国内统一刊号:CN 11-5886/Q,国际标准刊号:ISSN 1674-800X。图片来源:杂志官网Protein & cell 是由饶子和院士担任主编,副主编包括中国科学院北京生科院院长康乐院士、微生物所高福院士、中国科学院生物物理所所长许瑞明研究员、牛津大学教授 Bob Sim、清华大学教授胡小玉等等。期刊官网:http://www.protein-cell.org/期刊投稿网址:https://mc.manuscriptcentral.com/protein-cell影响因子及投稿接收类型Protein & cell 的最新影响因子(JCR2018)
前几日,突然收到导师的消息:「我看 XX 领域涌现了很多新成果,你把近 10 年来的文献集中一下,写篇综述吧,我看能发 SCI。」我一激动,什么?能发 SCI?好,交给我了!恕在下直言,综述其实是笔者眼中比较好写的类型,只要点子新,文献新。如果还有知名导师作为通讯,发给常投稿的期刊,发篇 SCI 不成问题。但综述最需要解决的问题其实是降重的问题。毕竟综述就是以引用文献为主,重复率之高,实则惨不忍睹。下面就来看看笔者琢磨出来的「降重十八掌」。一、同义词替换这是降重中最有效、最简单的部分,也是容易出错的部分。我们作为非英语母语的国家,很多词语看似同义,实则语境大不相同。笔者有个大牛同学,最常用是牛津出版社出版的某本同义词近义词词典。笔者就没那么厉害了,喜欢用外文同义词网站。一是方便,和百度差不多,把关键词输进去就好。二是收词及其广泛,笔者感觉比词典还多。网站链接:https://www.thesaurus.com/截图来自:thesaurus网站这个网站输进去一个单词之后,会根据词义进行同义词分类,而不是仅仅给出一堆同义词。这样我们可以根据语义进行筛选。同义词替换两大策略:替换动词和名词,
日前根据科睿唯安 Clarivate Analytics 公布的信息统计称:全世界总共约有 13000 本 SCI 期刊被收录,仅中国大陆的 SCI 期刊就达到近 300 本。面对如此数量繁多、汗牛充栋的学术期刊,想找到一本称心如意、两心相悦的期刊着实不容易。上次学霸君介绍了一本中国版 nature(崛起!这本 2 分起家的国产期刊 ,也很牛!)今天学霸君介绍一篇中国版的 PNAS,国产 SCI 的排头兵和扛把子National Science Review《国家科学评论》想必大家对 CNS 耳熟能详,但或许对百年经典期刊 PNAS 比较陌生,PNAS(Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)是《美国科学院院报》缩写,是美国国家科学院的院刊,亦是公认的世界四大名刊(Cell,Nature,Science,PNAS)之一。自 1914 年创刊至今,PNAS 提供具有高水平的前沿研究报告(Proceedings/News)、学术评论 (Review)、学术论文 (Arti
不少年轻导师都有这样的困惑:本来过得开开心心的硕士、博士,平日里工作积极,早请示晚汇报,晨昏定省、节假日问候从不落下,可是每个月都有那么几天,情绪特别低落,心事重重,异常焦虑,效率明显下降,魂不守舍,导师关心询问而学生却顾左右而言他。于是一些导师莫名担心起来:这个学生是不是每个月都有的那么几天到了?其实,以我多年的养殖经验来看,学生出现这种症状,八成不是大姨妈或大姨父拜访,而是因为导师忘记发补助了,或是该有的补助没有兑现。如果导师仔细研究下学生焦虑时期的朋友圈,大概会看到这样的文案:好喜欢 MAC 新出的新款,色号特别喜欢,可是已无手可剁。配图是口红宣传图,旁边往往还有张低头失落的宠物图。类似的玩法还有什么新出的包包、香水、双十一大狂欢等等。总之,潜台词只有一句话:我没钱,我很穷。这样的朋友圈,除了哭穷给父母、男朋友看之外,如果你也能看到,那么身为导师就该想一想了 —— 补助、助研还有承诺的补贴是不是到位了?因此,为了爱护学生,维护学生和导师之间的和谐关系,保障各项研究工作高效完成,中国关爱学生联盟联合中国关爱女博士联盟悄悄制定了《关于导师发放补助的指导意见》。需要注意的是,这份指导意