今天就给大家推荐 1 份韩国人主办的杂志：《Cancer Research And Treatment》，官方简称 CANCER RES TREAT 。为行文方便，在下文中以 CRT 作为简称。ISSN:1598 - 2998。 一审周期在 1 个月左右，目前影响因子 3 +，正好达到某些院校硬性的毕业标准。1. 期刊基本信息介绍CRT 是韩国癌症协会的同行评审的开放获取出版物。每季度出版一次，每年一卷。它接受与实验和临床癌症研究相关的文章。凡是和肿瘤有关的研究几乎都收录，具体项目从官网摘录如下：致癌机制、肿瘤生物学、分子肿瘤学、癌症遗传学、肿瘤免疫学、肿瘤流行病学；肿瘤标志物和癌症预防、癌症病理学；癌症诊断，癌症筛查和治疗，包括化疗、手术、放射治疗、免疫治疗、基因治疗、多模式治疗和姑息治疗等治疗项目。接受的文章类型：Review ArticleSpecial ArticleOriginal ArticlesCase ReportsCorrespondences期刊编辑更青睐于论著，如果要投稿综述需要很优秀。因为每期只有一份综述。主流数据库均收录 CRT，包括 web of scien

① 中科院清华合作揭示 RNA 甲基化调控 R-loop 形成及转录终止机制m6A 修饰作为信使 RNA 上丰度最高的修饰类型，广泛参与哺乳动物的发育、免疫、干细胞更新、脂肪分化以及肿瘤生成和转移等生命过程。然而，目前尚不清楚 m6A 是否能作为 R-loop 中 RNA 组分的本源特征来调控 R-loop 水平，进而发挥各种生物学功能。中国科学院北京基因组研究所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文团队合作，通过斑点分子杂交和免疫荧光技术，发现敲低 m6A 甲基转移酶 METTL3 显著降低 R-loop 水平，且该调控作用依赖于 METTL3 甲基转移酶活性。随后，团队成员利用高效液相色谱联合质谱技术，发现相较于染色体结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 组分有更加富集的 m6A 修饰。另外，研究团队还发现发现 m6A 促进 R-loop 形成是转录终止阶段的关键步骤，可以防止 RNA 聚合酶的转录通读。原文检索：m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination ② Cell R

白白同学在经过连续几周的通宵奋战后，终于，把毕业论文初稿，写好了！！！天一亮，就忍不住将好消息奔走相告。经过毕业论文的写作，白白发现，英文写作真的好难啊！白白英国的导师一开始帮白白改语法错误就改到差点断绝师生关系。好在白白没有放弃，在写了两万多个词后，吐血总结了英文论文写作中的一些语法小知识点。今天我们先来谈谈英文里时态的使用。众所周知，在中文的表达习惯里，是没有时态这一说法的，把时间状语加在句子中恰当的位置就可以随意表达事件所发生的任何时间。但是，在英文表达中，表达不同的时间，还要在谓语动词中加上不同的时态后缀，想想就麻烦。在论文写作过程中，如果选错了时态，很容易就会造成审稿人对自己文章的误解，严重的话，直接因为逻辑不清晰而退稿。虽说英语时态有辣么多，但是论文毕竟不是考英语，需要用到的，其实就只有三种，即一般现在时、一般过去时和将来时。接下来，就根据论文写作中不同部分的特点和方法，梳理应该使用的时态。1. IntroductionIntroduction 部分一般是对研究背景的陈述，或陈述一些在被广为接受的真理或事实，此时应该使用一般现在时；当然，如果需要陈述或引用一些前人的研究结果

想知道如何让 Pubmed 自动加载出期刊的影响因子、领域排名吗？想将文献生成二维码方便手机查看或分享吗？今天给大家介绍一个 Pubmed 的小插件 scholarscope。我们以火狐浏览器为例进行介绍：1. 打开浏览器，点击右上角菜单选项，在下拉菜单中选择「附加组件」。2. 进入下一级对话框，输入 scholarscope 进行搜索：3. 得到搜索结果：4. 选中后点击安装，后重启浏览器就可以看到浏览器右上角多了这个小显微镜图标。让我们来使用一下看看效果。5. 点击图标，会出现 Pubmed 的快捷链接窗口，可以点击「访问 Pubmed」，也可以在蓝色搜索框里直接输入。以 colonic neoplasms 为例。6. 搜索出来的结果如下图，在期刊后竟然出现了很多色彩的小方块。表明了该期刊的分区和影响因子。注：1 - 4 区分别用深红、红、黄和绿色来表示。灰色的 not found 表示该期刊不属于 SCI。7. 相对于未安装 scholarscope 之前，我们可以对比一下变化，一目了然，色彩模块十分醒目，同时增加了新功能，如图：①可导出 endnote 文件；②对该文献贴标签（

请问用 tcga 做 wgcna 分析，原始数据输入 tpm 和 fpkm 格式都行吗？如果下的 raw_count 有 r 包转换吗？首先，TCGA 目前的确是以 count 格式的矩阵下载为主至于能不能找到 RPKM 这样的矩阵，肯定是可以的，但是我教大家的主要是 count 值，因为对 RNA-seq 数据的差异分析以这个 count 为 input。然后问题就是，用 tcga 做 wgcna 分析，是不是原始数据输入一定要是 tpm 和 fpkm 格式？(PS，类似的基因表达量的归一化还有很多，详细见：https://hbctraining.github.io/DGE_workshop/lessons/ 02_DGE_count_normalization.html)那么问题就是，用 tcga 做 wgcna 分析，是不是原始数据输入一定要是 tpm 和 fpkm 格式？其实呢，我最开始的教程，的确是 fpkm，所以大家会以为必须要这样的输入格式，详细教程见：一文看懂 WGCNA 分析 (2019 更新版)实际上，WGCNA 首先会对全部基因的表达量计算两两之间的相关性，这个时

方法一：使用 Vector NT 软件 invitrogen 公司的这款软件绝对是分子生物学虫子们的福音，要想对质粒图谱了解更直观，安装这款软件是非常必要的。这款软件的软件包里面会包括 invitrogen 公司的所有质粒图谱信息和其他比较常见和经典的质粒图谱。 方法二：查找质粒图谱的网站 1.Vector Database（addgene） 这个网站很页面很人性化，直入主题，以前叫做 lablife，现在网站做了整合，比如查找 pRS 类质粒图谱（注意，是一类质粒图谱，没关系，照样能找到），直接在搜索框输入 pRS，可以看到，之类质粒一共有三十多个。找到自己需要的质粒名称，点击进入，就可以看到质粒图谱。 2.Vector DB 此网站页面比较简陋，但分类比较直观，总结和分类都比较完整。基本包括了所有表达系统的质粒信息。 3.NCBI 重点介绍如何用 NCBI 查找质粒图谱信息。search 下拉框中选中 Nucleotide，搜索栏输入质粒名称，search 后，得到搜索结果，点击右边的 send to，选中 file，genebank 等选

在做病毒包装实验中，有科研工作者常遇到：用同样一个病毒载体系统进行病毒包装实验，为什么有人做的很好，次次成功。有人却是时常做不出来，稳定性很差，不是滴度低就是根本不出毒? 腺病毒 or 慢病毒？ 慢病毒可以插入细胞基因组，稳定表达，持续时间长。 包装周期短（一般要两个月），感染效率相对于腺病毒要低很多。不能扩增，一次包装的病毒用完后如果再需要只能重新包装，成本高。一次包装所得到的的病毒滴度也相对较低（10 的 8 次方 pfu/ml），不大适合直接用于动物实验。 腺病毒感染效率高，很多细胞都能达到近 99%。纯化后的腺病毒可以直接进行动物活体注射。可以在体外扩增，每次使用完后，可以自己用包装细胞进行扩增，节约成本。一次包装所得到的滴度较高（纯化后为 10 的 11 次方 pfu/ml，未纯化的为 10 的 10 次方 pfu/ml）。不整合到基因组，无法稳定表达。 表达时间相对于慢病毒较短（两三周这样）。包装腺病毒的周期会比慢病毒长一些（一般要两个半月），因为腺病毒包装过程相对较繁琐。 总体来说，对于很多实验来说，选择腺病毒优势更大，并且很多情

作为实验动物中的最为炙手可热的一员，小鼠在人们认识生命现象了解相应机理过程中发挥了无可替代的作用，在基础医学研究领域内更是拥有无与伦比的地位。那么，这群拉丁名为 Musmusculus 的小动物是如何从最初的 home mouse 演变为 laboratory mouse，成为实验动物界的制霸呢？故事需要追溯到 100 多年前。1900 年，尘封 30 多年的 Mendel 遗传定律被来自欧洲几个科学家 deVries， Correns，Tschermark 重新发现，使得生命科学家们纷纷开始在不同物种中验证 Mendal 遗传定律，mouse 作为哺乳动物一员「当仁不让」地成为研究对象之一。同年，退休教师 Miss AbbieE.C. Lathrop 回到了 Massachusetts ，并在 Granby 创办了小农场。几年的家禽饲养亏本失利后，Miss Lathrop 试水 fancy mouse 市场。起先，Lathrop 小姐的「生意」规模很小，继获得一对 Japanese waltzing mouse 之后，小耗子们开始发挥小型啮齿类哺乳动物的生殖优势，开始脱缰野狗般白云悠

有这么一位大牛科学家，他在《 Nature》上发表了 180 篇论文， 在《Science》上发表了 53 篇论文。想不想认识一下这位大牛呢？ 他就是 Robert M May Robert M May，1936 年 1 月生于澳大利亚，悉尼大学物理学博士。1972-1975 年进入美国普林斯顿高等研究院，开启生物科学领域研究。1975 年成为世界著名的生态学者。 他为人类作出哪些贡献？ 1. 出版专著 《模型生态系统中的复杂性与稳定性》 这本书于 1973 出版。在该著作中，他一反当时人们普遍的认识，提出越是复杂的系统，各个物种越难趋于稳定，其种群大小的波动越大。这里的稳定性主要是指种群稳定性。 2. 开创生物学中混沌动力学新领域 他首次表明，一阶非线性差分方程的动力学行为可能是非常复杂的，从稳定点到周期振荡再到混沌，均有可能。1976 年他在 Nature 发表的论文（以及以后的系列工作）开创了生物学中混沌动力学这个新领域。 3. 生物多样性领域的领导者 他与 Anderson 合作，系统地研究了病毒和细菌如何影响寄主种群以

关于如何读科研论文，或许不同的人有不同的方法，我们来看看 Science 上来自不同领域，处于不同职业阶段的十几位科学家，他们介绍的自己阅读文献的方法。 Jesse Shanahan：卫斯理大学天文系硕士 我会先读摘要。然后浏览前言，略读全文，查看图表。我会尝试找出最重要的一两张图，并且确定我真正地看懂了它们。接下来，我会阅读结论/总结。只有当这些都做完了，我才返回去看技术细节去搞清楚我可能存在的疑问。 Cecilia Tubiana：马克斯·普朗克太阳系研究所的科学家 我首先阅读摘要和结论了解全文的大意。论文的结论让我知道摘要中概括的目的是否达成，以及描述的工作是否和我的相关研究有关并能激起我的兴趣。我经常会看图片，以便形成对文章的第一印象，但我通常还是会从头到尾把论文看完，以便真正理解作者想要展示的思路。 如果你想高效阅读，你必须清楚你最想从这篇文章里得到的信息是什么，并把注意力集中在这里。你还可以拿自己的结果和作者的比较，或者带入自己的想法，或者尝试把作者的思路和方法等扩展到新发表的数据。 了解这篇文章被引用情况，可以让你看到和你从事

期刊收到你的稿件后，编辑和审稿人最先看的就是论文标题，再根据标题预想论文内容。此外，读者检索文献，标题也会出现在搜索结果的重要位置。所以，标题和重要性丝毫不亚于论文本身。其实，论文标题的撰写可以遵循一定的程序或格式，本文给大家介绍的 5 个步骤，或许可以给你带来深度启发。1. 先来回答这几个问题我的论文是关于什么的？答：我的论文研究「X 疗法」能否改善痴呆病患的认知功能。使用了什么设计及技术？答：随机试验。谁研究了什么？答：我研究了国内 6 个城市的 40 个案例。结果是什么？答：病患的认知功能有改善。2. 用你的答案列出关键词X therapy（X 疗法）Randomized trial（随机试验）Dementia（痴呆）6 Chinese cities（国内 6 个城市）40 cases（40 个案例）Improved cognitive function（认知功能改善）3. 用列出的关键词造句This study is a randomized trial that investigates whether X therapy improved cognitive functio

SCI Translate 12 是用于医学生物学文献翻译的软件，单词翻译、段落翻译、全文翻译，中英文对照阅读，人工智能 AI 翻译引擎——高度接近人工翻译的准确度！！ 还可以一键提取当前文献的参考文献格式，一键分享到微信，一键下载相关 SCI 论文全文。SCItranslate 12.0 有四种翻译功能：【全文翻译】按照 PDF 的原始排版模式进行翻译，翻译成中文后可以另存为 PDF。【正文翻译】通过算法，从 PDF 文件中提取出正文（Introduction 和 Reference 之间的内容），按照段落翻译，虽然没有排版了，但翻译更准确了。中文翻译结果也可以另存为 PDF。【段落翻译】翻译用户手工选中的段落，翻译准确度最高，接近人类手工翻译。【单词翻译】有词义、常用词组、词形变化、发音、同义词、反义词等。界面截图如下：1. 单词翻译：包括词义、时态变化、读音、同义词、反义词、常用词组2. 段落翻译（付费用户有四色学习功能）3. 全文翻译，保留 PDF 文件原本的排版格式，中英文对照阅读4. 正文翻译：不保留版式，但翻译更准确5. 重点词汇：6. 引文格式：写标书的时候，看到这篇文

近年来越来越多的人对生物信息学感兴趣，因为它甚至不需要任何实验就可以发 SCI，仅依靠生物信息的相关筛选和统计分析便可发文，一般纯生信或补充点相关实验大多是发 1 - 5 分文章。纯生信的杂志并不是很多，今天为大家整理了 12 本喜欢收录纯生信文章的 SCI 期刊，有需要的拿来作参考～1、Bioinformatics推荐指数：3 星2、BMC Bioinformatics推荐指数：4 星3、BMC Genomics推荐指数：3 星4、BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS推荐指数：2 星5、Computational Biology and Chemistry推荐指数：4 星6、BMC SYSTEMS BIOLOGY推荐指数：4 星7、Gene推荐指数：4 星8、Journal of Cellular and Molecular Medicine推荐指数：4 星9、Molecular Oncology推荐指数：3 星10、Molecular Biology Reports推荐指数：4 星11、MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS推荐指数

1. 时间：2019 - 10 - 112. 样品：人体脐带组织3. 仪器：主机 TL2010S 中通量组织研磨仪（北京鼎昊源科技有限公司生产）配件 2 ml 研磨管，12×2 ml 适配器（1 对），直径 5 mm 不锈钢研磨珠4. 步骤：① 将脐带组织分成等量的小块，分别装入 2 ml 研磨管中；② 在研磨管中分别加入 2 颗直径 5 mm 的不锈钢研磨珠；③ 在研磨管中分别加入 300μm 裂解液，盖紧管盖，置入 2 ml 适配器中，将适配器固定在 TL2010S 研磨仪的摇臂上；④ 在 TL2010S 操作面板上设置实验参数：Speed（振荡速度）：2000 次/分钟Cycle（循环次数）：1 次RunTime（研磨时间）：50s启动研磨仪，一键自动研磨；⑤ 研磨完全停止后，卸下适配器，取出研磨管，脐带组织已研磨成细腻的匀浆状；⑥ 离心之后取上清液提取 DNA，进行后续实验。研磨总结：针对于脐带、胎盘等韧性较大的动物组织，在摸索最佳实验条件时，可以参照以下参数：研磨时加入适量溶液（裂解液或缓冲液）；选用直径 5 mm 或 6 mm 的研磨珠，2 ml 的研磨管中加入 2 颗；转

BMC分子生物学在2016年发表了一系列有趣的文章，主题从染色质结构的新发现到替代的mRNA物种。以下是《华尔街日报》最受欢迎的文章样本。在科幻小说世界里，让生物发生基因突变的能力一直是幻想，也许最著名的例子就是《x战警》系列，在这部电影里，基因突变可以赋予超人力量。虽然科学家们还没有解开心灵遥感所需的遗传密码，但自1974年以来，就已经存在有针对性的基因编辑，以探索和探索遗传功能。操纵蛋白质含量和活动是一个主要的工具在理解细胞内分子组件的功能和关系,但真正的遗传操作产生一个稳定的转基因细胞系或真实遗传生物需要更先进分子操纵及以上技术hinder-some现代科学家的时间和劳动密集型的,要求一个科学家屏幕虽然一代又一代的生物,以及具有先进的分子技术知识。这是一种直接而有效的方法，可以在没有选择的情况下筛选CRISPR/ cas9介导的基因敲除遗传学家工具箱中的最新工具利用了聚集的、有规则间隔的短回文重复(CRISPR)/Cas系统，这是一种内源性适应性免疫系统，通常被细菌和古菌用来对抗外来DNA的“感染”。这种新方法极大地改变了分子生物学领域，并将使科学家们在基因实验方面突飞猛进。来自

瑞典卡罗琳医学院 10 月 7 日 17 点半宣布，将 2019 年诺贝尔生理学或医学奖授予威廉·凯林（William G. Kaelin）、彼得·拉特克利夫（Peter J. Ratcliffe）和格雷格·塞门扎（Gregg L. Semenza），以表彰他们发现细胞如何感知和适应不同氧气环境。其中最关键的因子之一就是 HIF（缺氧诱导因子）。它是什么出身？它有什么「背景」，可以获得今年的诺贝尔奖，成为今后几年医学界的弄潮儿？图片来源：诺贝尔奖推特诺贝尔奖有一个规律，大概按照「2 年基础，1 年技术」来颁发奖项。今年的奖项也许无法像 PD- 1 一样显著的改变临床现状，很多人理解不了为什么这项研究会获奖，但这项研究极具基础研究意义。氧气是一切生命活动最关键的部分，虽然无氧必定让人死亡，可似乎只要给点氧气人就能生存，细胞就能活。从恶性增殖的肿瘤到多能干细胞，都能极尽一切的能力利用氧，他们到底是怎么感知氧气的变化，并做出相应改变的呢？下面就让笔者来做出最学术的回答。一、HIF 通路——诺奖的主角首先，在低氧情况下，依赖氧分压的细胞色素氧化酶，如高中生物教材里常见的的 NADPH 氧化酶、

① 华中科技大学 Nature 子刊揭示精母细胞中逆转录转座子沉默的分子机制哺乳动物转座子（TEs）是一类可以在基因组自主移动的 DNA 片段，在短期内，TEs 激活也可威胁基因组完整性，进而导致肿瘤发生、病理性发育以及不育的发生。因此研究雄性生殖细胞中转座子的沉默机制对治疗男性不育有重要的临床价值。来自华中科技大学同济医学院生殖健康研究所袁水桥教授利用条件性基因敲除策略，在小鼠生殖细胞中特异性的敲除了 Uhrf1 基因，发现敲除小鼠完全不育，睾丸显著性变小，附睾中完全没有精子。进一步表型分析发现，敲除小鼠的生精细胞发育停滞在减数分裂前期（Prophase I）的粗线期精母细胞阶段，表明 UHRF1 调控精母细胞减数分裂进程。该研究揭示了精母细胞减数分裂过程中逆转录转座子沉默的分子机制，创新性的提出了 UHRF1 作为分子纽带，通过调控 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 piRNA 通路来抑制精母细胞中逆转录转座子的异常激活。该研究对临床上治疗和诊断由基因突变引起的男性非梗阻性无精子症有重要的指导意义。原文检索：UHRF1 suppresses retrotransposons and c

在过程优化里，最常用到的方法有三个：单因素试验、正交试验和响应面分析。其中，单因素试验是在假设因素间不存在交互作用的前提下，每次只改变一个因素且保证其他因素维持在恒定水平的条件下，研究不同试验水平对响应值的影响。然而，大多数过程影响因素相当复杂，而且因素间通常又存在交互作用，并且当试验因素很多时，需要进行多次试验和较长的试验周期才能完成各因素的逐个优化。正交试验可同时考虑多个因素，注重科学合理安排试验，以寻找最佳的因素水平组合。它的试验次数明显少于同因素同水平的单因素试验，可通过方差分析得到影响试验结果的主次因素，以及考虑因素间的交互作用等等。但当考虑因素之间的交互作用时，其试验次数会大大增加，工作量巨大。这个时候，响应面分析应运而生响应面分析法，即响应曲面设计方法（Response Surface Methodology，RSM），是通过设计合理的有限次数试验，建立一个包括各显著因素的一次项、平方项和任何两个因素之间的一级交互作用项的数学模型，精确研究各因素与响应值之间的关系，快速有效地确定多因素系统的最佳条件。该方法具有试验次数少、周期短、精度高等优点，是一种有效地优化基础试验条件

第一个DNA甲基转移酶抑制剂(5-阿扎西替丁)在1964年首次合成，其作为抗癌剂的潜力很早就被认识到。20世纪80年代，在临床对这些制剂的最初研究中，将地西他滨作为经典的抗癌药物，其剂量为临床最大耐受剂量，每疗程1500 - 2500 mg/m(2)，但收效甚微。只有当低剂量(那些没有细胞毒性,导致epigenetically沉默沉默基因的活化)取得任何重大进展,经过近40年5-azacytidine (Vidaza)最后获得FDA的批准在2004/2005专门治疗骨髓增生异常综合征(MDS)的亚型。2006年，FDA还批准5-aza-2-脱氧胞苷(德西他滨，Dacogen)用于治疗MDS患者。关于低剂量治疗方案的数据和FDA的批准已经为完善这种低剂量治疗方案的使用铺平了道路，不仅用于血液恶性肿瘤，还可能用于实体肿瘤。当前主要问题之一有关这些药物的使用特别是在低剂量的设置方案,同时低剂量与代理Decitabine等有效治疗MDS AML和能引起完全缓解(CR)、维持缓解是很困难的(a),因为人类Decitabine的血浆半衰期约为20分钟,(b)的剂量可能不足以摧毁所有的癌症干细胞。低

近日，波士顿迎来了来自世界各地的9000多名代表参加2016年ENDO大会。在这里，BMC医学小组强调了会议上讨论的一些最具创新性的发展。许多内分泌学家认为，ENDO年会是一个“必须参加”的活动。然而，考虑到内分泌系统对人体的广泛影响，它也吸引了从事骨骼健康、癌症、生活方式和环境影响等方面研究的基础科学家和临床研究人员。今年的第98届内分泌学会年会比以往更特别，因为它是在学会的百年庆典上举行的。在过去的一个世纪里，内分泌学领域取得了很大的进步，有很多重要的发现获得了诺贝尔奖(包括胰岛素的发现)。然而，关于这个复杂的系统以及临床实践，还有很多需要了解的地方;因此，会议还集中讨论了一些令人兴奋的新发展和技术。糖尿病治疗的未来:干细胞、新胰岛素和仿生胰腺在过去的几年里，干细胞的研究和治疗取得了迅速的进展，包括对干细胞教育家的研究，这些研究显示了干细胞在治疗1型和2型糖尿病方面的潜力。在ENDO的全体会议上，道格拉斯·梅尔顿(Douglas Melton)介绍了最近在开发产生胰岛素的人类胰腺细胞方面的工作。他的团队在过去的十年中一直致力于开发一种安全的方法来获得这种细胞，这种方法使用的是一种单