一个学期又过去了，你的论文进展怎么样呢？或许老油条们会短暂的告别每周一汇报每月一总结的日子了，那么你想让老板觉得你一个学期进步了吗？如果不想再傻傻的做柱状图了，那就看过来吧！1. Before-after 图形亲爱的师弟师妹们，当你养了大半个学期的小白鼠，喂了 2 个月的药，在记录体重的时候，你忍心只做个傻白甜的柱状图吗，那么来看一看高大上的 before-after 图是如何做的吧！第一步：打开 Graphpad Prism5，选中 before-after 如下图标：第二步：输入 Data，也是其中最关键的一步，为此我奉上了最关键的数据，然后依照提示依次进行操作。选中 t 检验的统计方法。点击 OK 后在，小窗口内设置一下。点击 OK 后，然后在图标中选择 Graph，则可以出现目标的 Before-after 图。小朋友们，如果，你也在做小白鼠的实验，不妨采用这种技巧做成图，即清楚又清晰。2. 析因设计分析图形同学们，在做细胞实验的时候，通常会检测不同药物处理不同时间段的细胞活性值的分析，如果你不知从何下手，那我就来举个栗子，实地探讨一下。案例：用 6-ohda 处理 DA 能细

辛辛苦苦完成的论文，自己认为「不能增减一字」后，让导师修改。论文中必然带有文献标注，最常见的是 EndNote。不过导师电脑上没有你的 EndNote 库，那么他在修改时，只要有文献位置发生变化，EndNote 就会出现各种错误提示，会使你的导师修改兴致大减，或者直接把你的 EndNote 论文标注给删了，自己加个括号，叫你以后自己添加。如果你的文献数量在 30 篇以上，论文又有大改动，估计你会校对得发疯。What？你想叫导师在他的电脑上也装上你的 EndNote 库？图样图森破。先说福利：在丁香园旗下科研类公众号【生物学霸】对话框回复【0522】，可免费领取 endnote 直播课，手把手教你学会使用 endnote 哦。文献是一定要在论文中作标记的，但又不能带有 EndNote 格式，这个局怎么破？接着看下去。图 1 所示是常规带有 EndNote 格式的论文（随便插入了两个文献），此时如果把鼠标箭头放在文献序号上面，会有一个小方框提示，这个小序号其实有 EndNote 的一个小程序在里面，对应的是你 EndNote 里自己建立起来的库，如果标记在论文中的位置发生变化，里面的小程序

知识管理与科研协作系统，我们身边的小秘书。作为一名科研人员，每天除了做实验外，还有什么最重要啊？当然是文献阅读啦。文献阅读是我们科研生活中十分重要的一部分呢。当然，文献阅读也是讲究绩效与方法的，那么如何让自己的文献阅读更加有效呢？下面为大家推荐两款超级实在好用的文献管理软件～01 NoteFirst与常规的文献管理软件不同的是，这款软件除了对文献进行管理，还可以对文献进行追踪，还可以进行笔记、电子书的制作。此外，还可以通过在线的团队合作。既可以作为软件单独使用，也可以作为插件在 Word 中轻松使用。那么，就正式进入今天的主题之一 ——NoteFirst。首先进行软件的下载：http://www.notefirst.com/。官网上就提供了下载的通道。进入网站，点击下载；下载后，开始进行安装，解压；set up 双击；同意安装许可；下一步；下一步；选择需要安装的文件夹；选择好位置后，下一步；下一步；开始进行安装过程；如果有打开的 Word 需要关闭；结束安装过程；这时在此打开 Word，就可以看到安装的 NoteFirst 插件已经成功安装；点击 Word 中的 NoteFirst 插

今年 6 月，四川农业大学对陈学伟和李伟滔的研究团队进行了表彰，发出共计 1 350 万元的奖励和支持经费（其实奖金不多，只有 50 万是给团队的奖励）。随后，媒体对此进行报道，网络上也掀起了一篇《 Cell 》论文值不值 1 350 万的讨论。诚然，中国会给在顶级期刊发表文章的科学家一定的奖励，相信大家早已习以为常。然而，Science《新闻》在此前的报道显示，奖励顶级期刊发文的科研工作者不是中国的专利，其实很多国家或地区都会有相似的激励政策。图 1 Science《新闻》关于学术奖励的相关报道该调查机构搜集了各个国家或地区科研机构给予科学家奖金的官方文件、检索「publishing cash incentives」、「schemes cash publishing」等关键词，总结了各国在科研工作者发表顶级期刊时会给予的奖励金额（单位：美元）。图 2 各国科研工作者在发表顶级期刊时会得到的奖励金额不难看出，中国给顶级期刊第一作者的奖励最高，Nature、Science 的一作可以得到约 43 000 美元（约合 30 万人民币）的奖励（https://arxiv.org/ftp/ar

2017 年 8 月 31 日，山东烟台毓璜顶医院呼吸内科邹慎春为第一作者和通讯作者 Yao Zhang 在《分子医学报告》（Molecular Medicine Reports）发表题为《Epicatechin induces apoptotic and autophagic cell death in NCI-H2172 non‑ small cell lung cancer cells along with concomitant mitochondrial membrane potential loss and cell cycle arrest》的论文。文章了评估 epicatechin 对 NCI-H2172 非小型细胞肺癌细胞的抗癌作用，重点观测其对自噬细胞死亡、线粒体膜电位 （m） 丧失和细胞周期阻滞的影响。图片来源于 Molecular Medicine Reports 官网然而，就在发表后的第二天，PubPeer 网站上的匿名网友指出，文章 Fig4 中的多个细胞为复制细胞。匿名网友指出，相同颜色圈出的细胞是相同的细胞。图片来源于 PubPeer 官网，相同圈中细胞

编者按：临床医生并非科研出身，论文上经常会出现多多少少的「小问题」。丁丁班主任今天带来一篇大盘点，指出临床医生论文中出现的常见错误。1 忽略了样本纳入量的计算和说明对于一个研究而言，一般而言先要计算样本纳入量，否则做出来的研究极有可能没意义。笔者曾经接到过一位麻醉学博士的求助电话，叙述他在预答辩环节，被问「为什么你的研究 A、B 两组选择这么多例老鼠」时，他答不上来的焦虑。而当这个问题被临床流行病学方面的专家问到时，基本上文章也就被判「死刑」了。这个文章就属于具有严重问题 —— 没有说明样本纳入量的问题。2 明显的造假行为科学研究一定要严谨，一定要杜绝学术造假。笔者曾看过一篇文章初稿写着：将患者通过中央随机系统分为 A、B、C 三组，A 组 30 例，B 组 30 例，C 组 65 例。当时这篇文章被怀疑涉嫌数据造假，因为很少随机分组能分出 3 组相差这么多的。随后怀疑被证实，我们要求作者解释为何会出现这种情况时，他送回来的修改稿将 A、B、C 三组的例数改成了 60,60,65 例。当然这篇稿子秒退，理由：高度怀疑数据造假。3 对「随机」概念理解有误对于某些基本的概念理解有误，最常见

又到了博士毕业的小伙伴们纠结人生该何去何从的时候了。对于一心想做科研的理工科生来说，申请一个好的高校的博士后，再从讲师或者副教授做起无疑是大部分人的选择。那么，国外 vs 国内，牛逼学校 vs 地方普通高校是怎么样一个情况呢？笔者按照国外牛校、清北、C9 高校、985 高校、211 高校和普通一本的顺序对博士后人才招聘（偏生物医学方向）做了一个基本整理，希望可以给大家提供参考。1、国外名校学校招聘要求待遇哈佛医学院五年以上实验室经历；有相关技能者优先。年薪 3～6.5 万美金；医疗和社会福利；儿童保育服务；老人照顾。英国牛津大学具有相关技能会成为优势。年薪 31076～38183 英镑；医疗和社会福利；儿童保育服务；保险折扣。耶鲁大学有相关技能者优先。年薪 50000 美金以上；舒适的工作环境；医疗福利保障；提供住宿。2、清华北大学校招聘要求待遇清华大学31；博新计划入选者，及近一年内在国内 985 高校获得本校或本省优秀博士毕业生称号。基本年薪约 10.5 万元；住房；子女入学；社会福利；户口。北京大学35；获得博士学位不超过 3 年。基本年薪 9 万元起（博雅博士后基本年薪 1

施一公教授曾说：作为一个科研工作者，在国际学术期刊上发表科研论文是与同行交流、取得国际影响的必经之路。有些国内的科学家，实验做得漂亮，但常常苦恼于论文的写作力不从心，成为国际交流的一大障碍。 我在不同的网络平台，不止一次看到过施一公教授总结的关于提高英文写作能力的经验分享，核心思想就是每天坚持读英文报纸，坚持数年，英文能力必然能够有非常大的提高。 但是，时间不等人，我们很多时候没法积累数年，等到英语水平达到大师级别才开始写作，多数情况下，迫于毕业的压力，导师的压力，工作的压力，各种压力，在有限的时间内，我们只能用自己糟糕的英语水平，硬着头皮写。那如何用这种渣渣的英语写出能够发表的科研论文呢？ 英国 Imperial College 的 Hilary Glasman-Deal 女士，为我们打开了一扇窗，凭借其 30 年从事科研写作培训的经验，为我们指明了方向。在她的书 Science Research Writing For Non-Native Speakers of English 中，她这样说到：「When your language sk

这是一篇临床 Meta 分析连续性变量资料的操作流程，由于临床研究生时间紧迫，在有限的时间里阅读了大量的文献，却没有时间写一份质量上乘又会得到关注的综述性文章。本操作流程旨在一步一步教会临床的研究生在最短的时间内了解 Meta 分析软件的运行，并且快速的根据课题需要写一份 SCI 综述。本文主要根据《Meta 分析软件应用与实例解析》，主编郑明华的操作流程说明和个人的实际操作情况。Meta 分析——Rveman 5.3 软件在连续性变量上的实例应用。一、Meta 分析软件的下载与安装以 RevMan 软件为例，RevMan 软件可提供下载 3 个版本——RevMan 4.2、RevMan 4.3 和 RevMan 5。适用于多种平台的计算机，目前我使用下载的电脑是 Windows。但是目前 Cochrane 协作网强制要求使用 RevMan 5，因此我顺利并且成功的安装了软件 RevMan 5.3。RevMan 5 官方指定下载地址：http://community.cochrane.org/tools/review-production-tools/revman-5/revman-5

大数据的时代，文章的受试者也开始成指数增长，动不动就是成千上万的样本。在遗传学研究中，genomAD 目前已经有超过一万五千个体的的全基因组测序数据和超过十二万人的全外显子测序数据。国际合作的大项目，如 GTEx 也有近千人死亡后捐献尸检组织的表达数据，包含了不同的组织。这对于想要做点有创意的临床研究的你来说是不是压力山大，这要积累多少年才能收那么多病人……今天给大家介绍另外一个出路，做少而精的长期随访研究，只要想法独到，CNS 都是小菜。本次分享的文章发表于 2015 年 nature communition 杂志，受试者只有一个，就是文章的一作，所以，你连受试者都不用找了（先偷笑一会）……研究意义脑功能的波动性的研究在秒 / 分钟等短时尺度和在年 / 十年的尺度上取得了十足的进展，而在几天到数周这种时间尺度的研究还寥寥无几，而很多精神疾病多是在周～月这样的时间尺度上波动，研究该时间尺度上正常人的脑功能波动对于增加对精神疾病的了解具有十足的意义。研究设计在 2012 年 9 月到 2014 年 3 月期间，对受试者进行了功能性核磁共振扫描，抽取外周血进行 RNA 测序，并详细记录每天

说到中国风你会想到什么？青花瓷、水墨画、大熊猫、万里长城、太极 Kongfu、龙凤、鸟巢、哪吒、孙悟空...... 近些年来，它们陆续出现在各大顶级学术期刊的封面上，让世人新奇，让国人自豪！今天就来看下有哪些中国神兽已上线。01 青花瓷镶龙青花瓷镶龙，龙绕神舟，《Nature》聚焦中国科学专题，论中国科学的腾飞进步与发展。主页链接http://www.nature.com/news/science-in-china-1.2009402 双龙戏火珠喜庆的双龙戏火珠，源于先秦，代指两大蛋白复合物 Mediator 与 Spliceosome（双龙）调控 RNA（火珠）可变剪接。主页链接http://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(11)00998-103 画龙点睛还记得画龙点睛的神来之笔吗？动粒组装的关键（点睛）之处在于，组蛋白 H4 的 20 位赖氨酸的特定修饰 H4K20me1。主页链接http://www.cell.com/developmental-cell/fulltext/S1534-5807(14)00281-0

继上次我们推出初学者实验教程系列之后，很多站友发来私信，希望我们分享更多实验有关的内容。请大家继续关注我们的献给初学者栏目，会有更多大家常用的实验教程和大家见面。今天我们就来聊一聊细胞计数实验。实验用品0.4% 台盼蓝溶液、无水乙醇或 95% 乙醇溶液、脱脂棉、普通显微镜、试管、吸管、毛细吸管、细胞计数板、绸布。实验原理在细胞培养工作中，常需要了解细胞生活状态和鉴别细胞死活，确定细胞接种浓度和数量以及了解细胞存活率和增殖度，如用酶消化制备的细胞悬液中细胞活力的鉴别，冻存细胞复苏后的活力检测等。细胞悬液制备后，常用活体染料台盼蓝对细胞进行染色，进行细胞计数。台盼蓝不能透过活细胞正常完整的细胞膜，故活细胞不着色。而死亡细胞的细胞膜通透性增高，可使染料进入细胞内而使细胞着色（蓝色）。细胞计数一般用血细胞计数板，按白细胞计数方法进行计数，便于确定细胞的生活状况。实验内容与方法（一）制备动物细胞悬液将动物细胞用生物盐水制备成适当浓度的细胞悬液备用。（二）细胞计数计数板处理用无水乙醇或 95% 乙醇溶液擦拭计数板后，用绸布擦净，另擦净盖玻片一张，把盖片覆在计数板上面。染色用滴管吸取 0.4% 台盼

自 2015 年 3 月起，Springer、Elsevier 等国际出版集团的 4 批集中撤稿中，涉及中国作者的论文有近 200 余篇，其中 Springer 旗下的《肿瘤生物学》就撤稿超过 100 篇，撤销原因大多是论文在同行评审报告中造假。大部分作者委托第三方中介机构代为投稿，而恰恰是这些第三方机构通过冒用本领域专家的名字申请邮件地址，在专家不知情的情况下，用虚假邮箱向期刊提供正面夸赞论文的审稿意见。图 1 人民名义中关于高校科研领域存在的潜规则的一段对话买版面？买数据？对第三方来说，这都不是问题！「课题整体外包『一站式』解决」这种一条龙服务对第三方来说也只是小 case。第三方究竟是何方神圣呢？且听我细细道来......图 2 淘宝几家提供文章代发的店铺第三方机构一般是提供论文写作指导与论文发表服务的机构，国内外都有这类机构，笔者在期刊投稿的过程中，编辑就曾建议到期刊旗下的公司进行文章润色。不得不提，国外有非常规范的第三方机构，为英语非母语的作者提供语言润色，并建议作者可以投哪些期刊，但仅此而已，绝不会越过红线。相比与国外的三方机构，国内的第三方就集论文翻译、修改和投稿乃至于伪

最新一期（8 月 10 日）Nature 杂志根据 Nature 指数，高质量科学指标，以及 Lens 平台的数据，排列了全球具有创新力的 200 家研究机构和高校。调查了科研论文在第三方所持有的专利中的引用情况，为理解学术研究对创新的影响这一问题带来了新思路。评判标准除了 Lens 指数，还有论文的数量和质量，以及研究机构在 InCites 中的自然科学文章。根据 Lens 开发的指标，前十位排名显示如下，其中以色列的魏茨曼科学研究所（Weizmann Institute of Science），位列第六，是前十名中唯一的非美国学术机构。排名前十的科研院所根据 Lens 的指标，位居中国第一的机构是香港科技大学（第 118 位），排在其后的还有 13 家中国机构，均在前 200 位之列。他们分别是香港大学（第 168 位）、苏州大学（第 173 位）、复旦大学（第 180 位）、北京大学（第 182 位）、清华大学（第 183 位）、南开大学（第 187 位）、浙江大学（第 189 位）、中国科学院（第 190 位）、中山大学（第 191 位）、上海交通大学（第 194 位）、厦门大

首先介绍一下我自己，不是超市里王婆卖瓜的油品促销员，是一个没什么成就的作物遗传育种专业研究僧，研究方向是高油育种。每天沉浸在无边无际的实验室日常中（实验做不出来）。为了做好学问，不是自夸，我在生活中那是处处留心。这不，妈妈拉上我（一个劳工）去超市买东西。当她把一辆购物车塞得满满登登的时候，因为早有心理准备，我内心充满了平静。推到结账区，很久不见，超市的布局还和我记忆中的一样，粮油米面等大件商品都放在门口附近，让人不至于推着大件走很远。这应该算是什么超市心理学吧，感觉还不错。直到我发现母亲的脚步往油类促销台一拐……「买两桶油。」她说。现实很残酷，需要拎回家的东西又增加了。但如果非要买，也不是不可以。正好是专业领域，什么大豆油、花生油、橄榄油、葵花籽油、玉米油，放着我来（选）！妈妈欣然同意。为了不耽误其他人选购，看四周无人，在货架边上偷偷转了一圈，我以最快的速度将每种油的重要信息照了下来，走到一边光明正大地开始研究。首先是加工方式，都是压榨的，这点没什么区别，可我还是有疑惑。大家都知道，在提取 DNA 或者 RNA 的时候，也是捣捣捣。如果用大豆胚，就压成了大豆粉；用玉米幼胚，就压成了玉米

在《如何查找核心文献（一）：知网高级检索》一文中，我们提到了如何在知网中查找核心文献，同样的，在万方中也能使用「被引」对检索的文献进行排序，这里就不详细介绍了（个人觉得万方没有知网做的好，万方没有计量可视化分析 —— 具体内容可以在《如何查找核心文献》中阅读）。接下来，我们就要进一步讨论：如何应用文献管理软件来筛选核心文献。一般而言，文献管理软件主要是应用于题录（包含全文）的整理，在我们写论文时方便自动插入参考文献，而不需要手动编写参考文献。而本文主要探讨文献管理软件进阶版的另一个功能：核心文献筛选。主要介绍基于国内外主流文献管理软件：NoteExpress、医学文献王，以及 EndNote。在开篇前，我们再来重温下核心文献这个概念。说起核心文献，我们不得不提起影响因子（Impact Factor，IF），汤森路透（Thomson Reuters）每年都会发表期刊引证报告（Journal Citation Reports，JCR），对各大期刊进行 IF 排序。哪本期刊上一年被引的次数越多，其 IF 值也就越高。要查阅一本期刊的影响因子方法有很多种，最正规的当然是直接在 JCR 官网上检

你是不是会有这样的经历：距离文献汇报只剩一周的时间了，但是实验累身，文献还没有开始看，一瞥到那密密麻麻的英文就心急如焚？又或者老板给你下达任务，这学期结束前必须完成一篇综述的初稿，要求阅读 80 篇以上的英文文献，英文不好的你正抓耳挠腮？别着急，接下来笔者介绍几个实用的方法，让你阅读英文文献的速度咻咻咻地提高。✎ CNKI 翻译助手CNKI 翻译助手，是「中国知网」开发制作的大型在线辅助翻译系统。用户不仅可以输入词汇还可以输入句子进行翻译检索。但是它提供的大部分都是直译，在考虑上下文语境、前后通顺和主谓宾顺序方面还有待改进。不过，在专业学术词汇检索方面，CNKI 翻译助手是很好用的。✎ Google 神经机器翻译系统（GNMT）前不久，谷歌将 AI 技术引入「谷歌翻译」，表示与之前相比，能降低 80% 的翻译错误率，并且十分接近人类译员的翻译水平。这里笔者简单介绍一下文献的网页翻译。➤ 1. 安装谷歌浏览器在百度中搜索「谷歌浏览器」（不要谷歌官网下载，否则无法修改搜素引擎），直接点击安装即可。待安装完成后点击设置。点击管理搜索引擎。将默认搜索引擎修改为百度或者其他（因防火墙限制，不要修

实验步骤01 探针的标记如下设置探针标记的反应体系：体系为 10 微升待标记探针 （1.75 pmol / 微升） ：2 微升。T4 Polynucleotide Kinase Buffer （10×） ：1 微升。Nuclease-Free Water ：5 微升。[γ-32P] ATP（3 000 Ci/mmol at 10 mCi/ml） ：1 微升。T4 Polynucleotide Kinase （5-10 u / 微升） ：1 微升。依次加入各种试剂，加入同位素后混匀，再加入 T4 Polynucleotide Kinase，混匀。使用水浴或 PCR 仪，37 ℃ 反应 10 分钟。加入 1 微升探针标记终止液，混匀，终止探针标记反应。再加入 89 微升 TE，混匀。此时可以取少量探针用于检测标记的效率。通常标记的效率在 30% 以上，即总放射性的 30% 以上标 记到了探针上。为实验简便起见，通常不必测定探针的标记效率。标记好的探针最好立即使用，最长使用时间一般不宜超过 3 天。02 探针的纯化对于 100 微升标记好的探针，加入 1/4 体积即 25 微升的 5 M 醋

网民会通过各种方式存储各种格式的影片视频，现如今，生物学家也不例外。研究人员通过使用微生物免疫系统 CRISPR-Cas，已成功将电影片段编码存储到大肠杆菌的基因组中。该技术成果于 2017 年 7 月 12 日 在《Nature》率先发布。美国马萨诸塞州哈佛医学院的合成生物学家 Seth Shipman 提到，将编码数据存储进细菌 DNA，有助于存储记录一系列事件的发生发展。Shipman 在过往研究脑神经发育时，因缺乏记录捕捉脑神经细胞运作的技术而受阻。当然，这也激发了他日后探索研究细胞分子水平记录系统的热情。他说到，「细胞有收集各类信息的途径和能力，我想通过细胞来记录中枢神经系统发育过程中各种分子水平的信息」。CRISPR 基因编辑然而，将电影片段刻进活细菌的 DNA 看似容易，但其实为了研发这类系统，需要建立一种可以在单个细胞中记录数百个事件的体系。Shipman 及其同事，包括哈佛医学院遗传学家 George Church，已着手运用免疫系统 CRISPR-Cas，使得诸多科研工作者可以更加准确便利地编辑基因组。Shipman 团队利用 CRISPR-Cas 可捕获入侵病毒

我做 western 的时候，发现目前的资料都很老，网上的资料也大多互相传抄，说法各异，于是综合了目前网上所能找到的资料和个人实际经验，编辑了这份 western blot 操作步骤，内容包括主要操作步骤和所需要注意的有用的细节，并附上参考文献。我按下文的步骤操作已经做出来了稳定可重复的、背景干净的 western 条带了，屡试不爽，所以相信你也行。背景蛋白质印迹的发明者是斯坦福大学 George Stark。Neal Burnette 于 1981 年所著的 Analytical Biochemistry 中首次被称为 Western Blot。最开始做印迹的是一个叫 Southern 的科学家，但印迹的对象是 DNA 链，他把这种技术称为 Southern blot，后来出现了两个过程相似，但是对象不同的印迹方法，一个针对 RNA，一个对蛋白质，人们分别把这两种技术的称为 Northern 和 Western，与这两个技术的发明人没有关系了。一：蛋白质的样品制备由于这一步方法各异，具体步骤请参考试剂盒的说明书即可。蛋白质的样品制备是 Western Blotting 的第一步，样