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双氧水诱导肿瘤细胞凋亡的检测

1. 实验目的 通过实验了解细胞凋亡的一般过程和形态特征,了解诱导细胞凋亡的因素;学习和了解细胞凋亡检测的常规手段,掌握利用梯状DNA电泳法鉴定细胞凋亡的方法。 2.实验原理 细胞凋亡是多细胞生物体在发育过程中或在某些环境因子的作用下发生的受基因调控的主动的死亡方式。对于生物体的正常发育、自稳平衡及多种病理过程具有极其重要的意义。细胞凋亡(apoptosis)的概念最早由Kerr于1972年提出,当时用来描述某些类型的细胞在一定的生理或病理条件下,遵循自身的程序,主动地结束其生命,最终脱落离体或裂解为若干凋亡小体(apoptotic body)而被其细胞所吞噬的过程。细胞凋亡的主要特征包括:染色质凝集、质膜出芽、核裂解及凋亡小体的形成。DNA特异性降解成180~200bp或其整数倍片断,通过凝胶电泳形成梯状条带,称为DNA Ladder。由于DNA特异性降解而产生大量3'-OH末端,可被末端脱氧核糖核苷酸移换酶介导的dUTP缺口末端原位标记法(TUNEL)标记,从而产生亮绿色荧光等。1980年,Wyllie在研究糖皮质激素诱导胞腺细胞凋亡时发现内源性核酸内切酶活化及其引起的

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如何寻找转录起始位点

一、引物延伸分析(primer extension analysis) 引物延伸分析用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域,随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析cDNA。cDNA的长度为引物的标记的核苷酸到RNA-5`末端间的碱基数,所得cDNA的量和目的RNA的起始量成正比。理想的引物是ssDNA,长度为20-40个核苷酸,与要分析的转录产物的5`末端区域互补。延伸产物小于150个核苷酸,可得到最佳分离效果。引物延伸实验非常灵敏,可检测2 pg的转录产物,这相当于1个细胞中的1个RNA。引物延伸实验非常适合于对单个基因作定量和定性分析。 1. 引物延伸分析所用试剂:引物延伸实验需要模板RNA,可用总RNA或poly(A)+RNA。一个特异的末端标记的核苷酸或DNA片段作为引物,用反转录酶合成cDNA。除RNA模板和标记的引物,还需要反转录酶,AMV或MMLV反转录酶、反应溶液、脱氧核苷酸、聚丙烯酰胺凝胶试剂,和

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亲和素―生物素―过氧化物酶复合物法

亲和素―生物素―过氧化物酶复合物法亲和素―生物素―过氧化物酶复合物法(avidin-biotin-pcroxidase complex method,ABC法)的特点是将亲和素作为“桥"与生物素化的抗体和生物素结合的酶连接起来,使抗原与抗体反应信号放大,以增加敏感性。由于该法是以物质对某种组织成分具有高度亲和力为基础,一方面区别于古老的组织化学分解、置换、氧化和还原反应,另一方面本质上又是非抗原抗体反应,因此,Bayer(1976年)首次称之为亲和组织化学(affinity histochemistry)。 1.原理 生物素(biotin)为含硫的杂环单羧酸,分子量小,通过其羧基与蛋白质的氨基结合,从而可标记抗体和酶。亲和素(avidin)又称抗生物素蛋白,是一种糖蛋白,在鸡蛋白中被发现,分子量为68 000。生物素与亲和素有很高的亲和力,1个亲和素分子上有4个生物素结合位点。在ABC法中,不对特异性第一抗体进行标记,而用生物素标记第二抗体,染色前按一定比例将亲和素与牛物素标记的讨氧化物酶混合,制成ABC合物,并使亲和素分子上至少空出1个生物素结合位点。染色时,标本中的抗原先与

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双歧杆菌的分离、培养及鉴定

园友sakuyaandy:我们培养双歧杆菌是在厌氧培养箱中进行培养,如果没有的话,用厌氧瓶或厌氧缸都可以。培养基你用的是怎么改良的呢?我们是在MRS里面加入了L-半胱氨酸,不过这都是培养用的培养基,如果你需要区分菌落可以用X-GAL改良MRS可以起到鉴别做用,具体文献名称为园友jerrycs:厌氧微生物在自然界分布广泛,种类繁多,其生理作用日益受到人们的重视。双歧杆菌是专性厌氧菌,对氧气非常敏感,因此,双歧杆菌的分离、培养及活菌计数的关键是提供无氧和低氧化还原电势的培养环境。双歧杆菌的最适生长温度37℃~41℃,最低生长温度25℃~28℃,最高43℃~45℃。初始最适pH 6.5~7.0,在pH4.5~5.0或pH 8.0~8.5不生长。其细胞呈现多样形态,有短杆较规则形、纤细杆状具有尖细末端形、球形、长杆弯曲形、分枝或分叉形、棍棒状或匙形。单个或链状、V形、栅栏状排列,或聚集成星状。革兰氏阳性,不抗酸,不形成芽孢,不运动。双歧杆菌的菌落光滑、凸圆、边缘完整、乳脂至白色、闪光并具有柔软的质地。双歧杆菌是人体内的正常生理性细菌,定殖于肠道内,是肠道的优势菌群,占婴儿消化道菌丛的92%。该

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小动物活体成像技术

1、背景和原理1999年,美国哈佛大学Weissleder等人提出了分子影像学(molecular imaging)的概念——应用影像学方法,对活体状态下的生物过程进行细胞和分子水平的定性和定量研究。传统成像大多依赖于肉眼可见的身体、生理和代谢过程在疾病状态下的变化,而不是了解疾病的特异性分子事件。分子成像则是利用特异性分子探针追踪靶目标并成像。这种从非特异性成像到特异性成像的变化,为疾病生物学、疾病早期检测、定性、评估和治疗带来了重大的影响。分子成像技术使活体动物体内成像成为可能,它的出现,归功于分子生物学和细胞生物学的发展、转基因动物模型的使用、新的成像药物的运用、高特异性的探针、小动物成像设备的发展等诸多因素。目前,分子成像技术可用于研究观测特异性细胞、基因和分子的表达或互作过程,同时检测多种分子事件,追踪靶细胞,药物和基因治疗最优化,从分子和细胞水平对药物疗效进行成像,从分子病理水平评估疾病发展过程,对同一个动物或病人进行时间、环境、发展和治疗影响跟踪。2、分子成像的优点分子成像和传统的体外成像或细胞培养相比有着显著优点。首先,分子成像能够反映细胞或基因表达的空间和时间分布,从

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Western-Blot试剂配制

(一)母液 1. 1.0mol/L Tris·HCl Tris (MW121.14) 30.29g 蒸馏水 200ml 溶解后,用浓盐酸调pH至所需点(见下所示),最后用蒸馏水定容至250ml,高温灭菌后室温下保存。 PH HCl 7.4 约17ml 7.5 约16m 7.6 约15ml 8.0 约10ml 2. 1.74mg/ml (10mmol/L)PMSF PM

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人源化抗体(humanized antibody)技术

相关专题单克隆抗体 单克隆抗体问世以来,在临床诊断、治疗与预防等方面发挥了巨大的作用。但是常用的鼠源单克隆抗 体具有较强的免疫原性,在临床反复应用中会引起人抗鼠抗体(human anti -mouse antibody,HAMA)反应, 导致半衰期缩短,治疗效果减弱。鼠源抗体人源化是指利用DNA 重组技术和蛋白质工程技术,对抗体基 因进行重组,在保留鼠源抗体对抗原有效结合部位的同时,最大限度地降低非结合部位的鼠源性。这种通 过重组基因所表达的既有鼠源成分,又有人源成分的抗体称为人源化抗体(humanized antibody)。人源化 抗体是通过基因工程制备的,所以又可称为基因工程抗体(genetically engineered antibody)。人源化抗体 的优越性主要表现在于其不会激起快速的抗球蛋白反应。由于Fc 段来源于人,其能更有效的与人体免疫 系统协同发挥作用。 嵌合抗体 由于90%的HAMA 是针对抗体C 区的,设计从分泌鼠McAb 的杂交瘤细胞基因组中分离功能性IgV 区基因,然后与人C 区基因按一定方式拼接,克隆到表达载体中并

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如何选择实验抗体(一抗的选择原理及方法)?

检测任何目的靶蛋白都有不止一种抗体可供选择,在同一个抗体公司,可能会有好几种,甚至好几十种;在不同的抗体公司,那就更多了。那怎样在琳琅满目的抗体中,选择自己实验需要的抗体呢?主要考虑如下几种因素:分析自己实验应用的实验方法是哪种?分析自己实验中标本的种属是哪种动物或人的?分析样本中的蛋白质的结构性质,分析抗体的标记和检测,分析抗体的宿主来源种属等等。 1.分析自己实验应用的实验方法是哪种? 一般抗体说明书都列出该抗体经试验验证过适用于何种分析类型,如:可以应用于WB、IHC、ICC、ELISA、FCM分析等。 如果抗体说明书没有提及的应用类型,并不意味着该抗体不适用于此种分析应用类型,而仅是说明尚未经过此种分析试验验证。为了避免实验风险,当说明书中没有提及的应用方法时,可向商家申请测试装,进行测试后,再决定是否购买。 如果抗体不适用某些分析试验,则会在抗体说明书上标注出来不适于某分析试验。 2.分析自己实验中标本的种属是哪种动物或人的? 一般抗体说明书都列出该抗体经试验验证过适用于何种动物或人的标本,如:可以用于rat、mouse、human、pig、goat等动物的标

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光合作用基础知识讲座系列二:叶绿体和光合色素

一、叶绿体 叶片是光合作用的主要器官,而叶绿体(chloroplast,chlor)是光合作用最重要的细胞器。(一)叶绿体的发育、形态及分布1.发育 高等植物的叶绿体由前质体(proplastid)发育而来,前质体是近乎无色的质体,它存在于茎端分生组织中。当茎端分生组织形成叶原基时,前质体的双层膜中的内膜在若干处内折并伸入基质扩展增大,在光照下逐渐排列成片,并脱离内膜形成囊状结构的类囊体,同时合成叶绿素,使前质体发育成叶绿体。幼叶绿体能进行分裂。   2.形态 高等植物的叶绿体大多呈扁平椭圆形,每个细胞中叶绿体的大小与数目依植物种类、组织类型以及发育阶段而异。一个叶肉细胞中约有10至数百个叶绿体,其长3~7μm,厚2~3μm。   3.分布 叶肉细胞中的叶绿体较多分布在与空气接触的质膜旁,在与非绿色细胞(如表皮细胞和维管束细胞)相邻处,通常见不到叶绿体。这样的分布有利于叶绿体同外界进行气体交换。   4.运动 叶绿体在细胞中不仅可随原生质环流运动,而且可随光照的方向和强度而运动。在弱光下,叶绿体以扁平的一面向光以接受较多的光能;而在强光下,叶绿体的扁平面与光照方向平行,不致吸收过多强光

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WZZ-2型自动旋光仪的原理与使用

(一)仪器的用途 旋光仪是测定物质旋光度的仪器。通过对样品旋光度的测定,可以分析确定物质的浓度、含量及纯度等。WZZ-2自动旋光仪采用光电检测自动平衡原理,进行自动测量。测量结果由数字显示。它既保持了WZZ-1自动指示旋光仪稳定可靠的优点,又弥补了它的读数不方便的缺点,具有体积小,灵敏度高,没有人差,读数方便等特点。对目视旋光仪难以分析的低旋光度样品也能适应。因此广泛应用于医药、食品、有机化工等各个领域。农业:农用抗菌素、农用激素、微生物农药及农产品淀粉含量等成份分析。医药:抗菌素、维生素、葡萄糖等药物分析,中草药药理研究。食品:食糖、味精、酱油等生产过程的控制及成品检查,食品含糖量的测定。石油:矿物油之分析、石油发酵工艺的监视。香料:香精油之分析。卫生事业:医院临床糖尿病分析。(二)仪器的性能 (1)测定范围:±45º(2)准确度:±(0.01°+测量值X5/10000)(3)可测样品最低透过率:10%(对钠黄光而言)(4)读数重复性:≤0.01º(5)显示器自动数字显示最小示值:0.005º速度:1.30º/秒(6)单色光源:钠光灯加滤色片(589.3毫微米)(7)试管:200毫米

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光合作用基础知识讲座系列六:影响光合作用的因素

植物的光合作用受内外因素的影响,而衡量内外因素对光合作用影响程度的常用指标是光合速率(photosynthetic rate)。一、光合速率及表示单位 光合速率通常是指单位时间、单位叶面积的CO2吸收量或O2的释放量,也可用单位时间、单位叶面积上的干物质积累量来表示。常用单位有:μmol CO2·m-2·s-1 (以前用mg·dm-2·h-1表示,1μmol·m-2·s-1=1.58mg·dm-2·h-1)、μmol O2·dm-2·h-1 和mgDW(干重)·dm-2·h-1。CO2吸收量用红外线CO2气体分析仪测定,O2释放量用氧电极测氧装置测定,干物质积累量可用改良半叶法等方法测定(请参照植物生理实验指导书)。有的测定光合速率的方法都没有把呼吸作用(光、暗呼吸)以及呼吸释放的CO2被光合作用再固定等因素考虑在内,因而所测结果实际上是表观光合速率(apparent photosynthetic rate)或净光合速率(net photosynthetic rate,Pn),如把表观光合速率加上光、暗呼吸速率,便得到总光合速率(gross photosyntheticrate)或真光

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小动物行为学仪器的种类和简介

大小鼠转棒仪该仪器用于研究药物对动作协调性和抗疲劳特性的影响,对相关药物筛选有重要价值。实验时将动物放置在滚筒上并避免滑落,转动滚筒后,如果动物滑落下来就会相应停止下面的传感平台进行结果记录,可以同时进行五个大鼠或小鼠实验,大鼠采用直径3.75英寸的滚筒,小鼠采用直径为1.25英寸的滚筒。仪器采用数字控制:  5个标准通道,测试时间可调;  启动速度可调,最终速度可调;  加速度可调,前进反转两种模式选择;  测量距离可记录,标准计算机打印口输出;  RS232 串口输出。大小鼠疲劳测试仪可从一通道扩充至五通道;  每通道配置震动栅格;  每通道可设置测试时间;  每通道可设置测试速度;  每通道可设置倾斜度,分五挡从0度至40度;  标准计算机打印口输出。记录大小鼠(个体或群体)自发性活动及随时间而发生的变化,用于研究毒理学、精神药理学、行为科学等方面,评估药物对动物行为的改变,药物对神经系统的作用,动物对不同环境的行为变化等。设备包括透明观察室,两组相对的红外线阵列记录水平方向的活动和垂直方向的活动(如站立)。通过选配的打印机打印结果或通过软件连接PC。

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流式细胞术中的几点注意事项

一、对照组的设置: 在流式细胞术中所测得的量都是相对值,不是绝对值。如需知道绝对值时必须设置对照组样品。对照组样品包括有阴性对照和阳性对照。1. 阴性对照的设置① 在实验过程中,如做间接标记法,可设置与一抗无关的实验,即在实验中不加一抗而只加上带有荧光标记的第二抗体作为阴性对照管,作为阴性对照。② 在实验过程中,假设做直接标记法,可设置理论上的阴性细胞作为阴性对照管, 实验过程及步骤与实验组务必相同。(做间接标时记法同样也可同时设置“阴性细胞”的阴性对照管作为阴性对照。③ 在实验过程中,假设做直接标记法,可将实验组细胞,取一管,加上与实验抗体所标记的荧光颜色相同的同型对照来作为阴性对照。2. 阳性对照的设置: 在实验过程中如涉及到表达缺失或减少的实验,应设置阳性对照组,其设置方法与阴性对照设置相同。二、几点建议:1. 在实验过程中,在保证实验的科学性和准确性的基础上,应尽量减少实验工序和过程。由于间接标记法的工序多,实验过程长,如再加之操作的不熟练,细胞更容易丢失和受损,而造成实验结果的误差。因此,在条件允许的范围内,建议尽量做直接标记法而不去做间接标记法,以保证实

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生物芯片入门(一):生物芯片及应用简介

一、简介生物芯片(biochip)是指采用光导原位合成或微量点样等方法,将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物(如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体)的表面,组成密集二维分子排列,然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交,通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描或电荷偶联摄影像机(CCD)对杂交信号的强度进行快速、并行、高效地检测分析,从而判断样品中靶分子的数量。由于常用玻片/硅片作为固相支持物,且在制备过程模拟计算机芯片的制备技术,所以称之为生物芯片技术。根据芯片上的固定的探针不同,生物芯片包括基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片、组织芯片,另外根据原理还有元件型微阵列芯片、通道型微阵列芯片、生物传感芯片等新型生物芯片。如果芯片上固定的是肽或蛋白,则称为肽芯片或蛋白芯片;如果芯片上固定的分子是寡核苷酸探针或DNA,就是DNA芯片。由于基因芯片(Genechip)这一专有名词已经被业界的领头羊Affymetrix公司注册专利,因而其他厂家的同类产品通常称为DNA微阵列(DNA Microarray)。这类产品是目前最重要的一种,有寡核苷酸芯片、c

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光合作用基础知识讲座系列五:碳同化

植物利用光反应中形成的NADPH和ATP将CO2转化成稳定的碳水化合物的过程,称为CO2同化(CO2 assimilation)或碳同化。根据碳同化过程中最初产物所含碳原子的数目以及碳代谢的特点,将碳同化途径分为三类:C3途径(C3 pathway)、C4途径(C4 pathway)和CAM(景天科酸代谢,Crassulacean acid metabolism)途径。一、C3途径糖和淀粉等碳水化合物是光合作用的产物,这在100多年前就知道了,但其中的反应步骤和中间产物用一般的化学方法是难以测定的。因为植物体内原本就有很多种含碳化合物,无法辨认哪些是光合作用当时制造的,哪些是原来就有的。况且光合中间产物量很少,转化极快,难以捕捉。1946年,美国加州大学放射化学实验室的卡尔文(M.Calvin)和本森(A.Benson)等人采用了两项新技术:(1)14C同位素标记与测定技术(可排除原先存在于细胞里的物质干扰,凡被14C标记的物质都是处理后产生的);(2)双向纸层析技术(能把光合产物分开)。选用小球藻等单细胞的藻类作材料,藻类不仅在生化性质上与高等植物类似,且易于在均一条件下培养,还可在

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光合作用基础知识讲座系列四:电子传递和光合磷酸化

原初反应使光系统的反应中心发生电荷分离,产生的高能电子推动着光合膜上的电子传递。电子传递的结果,一方面引起水的裂解放氧以及NADP+的还原;另一方面建立了跨膜的质子动力势,启动了光合磷酸化,形成ATP。这样就把电能转化为活跃的化学能。一、电子和质子的传递(一)光合链(photosynthetic chain)所谓光合链是指定位在光合膜上的,由多个电子传递体组成的电子传递的总轨道。现在较为公认的是由希尔(1960)等人提出并经后人修正与补充的“Z”方案(“Z” scheme),即电子传递是在两个光系统串联配合下完成的,电子传递体按氧化还原电位高低排列,使电子传递链呈侧写的“Z”形。叶绿体中的电子传递模式可以看出:(1)电子传递链主要由光合膜上的PSⅡ、Cyt b6/f、PSⅠ三个复合体串联组成。(2)电子传递有二处是逆电势梯度,即P680至P680*,P700至P700*,这种逆电势梯度的“上坡”电子传递均由聚光色素复合体吸收光能后推动,而其余电子传递都是顺电势梯度进行的。(3)水的氧化与PSⅡ电子传递有关,NADP+的还原与PSⅠ电子传递有关。电子最终供体为水,水氧化时,向PSⅡ传交4

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王泛森院士:如果让我重做一次研究生

摘要:这是王泛森院士写的一篇文章,我觉得对即将读研的同学很有意义,到了研究生阶段,不能再用本科生的思维方式去学习,更应该具备学术研究素质,学会创新,学会主动学习,学会怎样与老师一起进入研究领域,又是人生中的一个新课题。 一、研究生与大学生的区别 首先跟大家说明一下研究生和大学生的区别。大学生基本上是来接受学问、接受知识的,然而不管是对于硕士时期或是博士时期的研究而言,都应该准备要开始制造新的知识,我们在美国得到博士学位时都会领到看不懂的毕业证书,在一个偶然的机会下,我问了一位懂拉丁文的人,上面的内容为何?他告诉我:“里头写的是恭喜你对人类的知识有所创新,因此授予你这个学位。”在中国原本并没有博硕士的学历,但是在西方他们原来的用意是,恭贺你已经对人类普遍的知识有所创新,这个创新或大或小,都是对于普遍的知识有所贡献。这个创新不会因为你做本土与否而有所不同,所以第一个我们必须要很用心、很深刻的思考,大学生和研究生是不同的。 (一)选择自己的问题取向,学会创新 你一旦是研究生,你就已经进入另一个阶段,不只是要完全乐在其中,更要从而接受各种有趣的知识,进入制造知识的阶段,也就是

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PCR扩增分离目的DNA片段实验原理、材料和步骤

一、目的了解多聚合酶链反应DNA 扩增技术的基本原理和实验应用,掌握PCR反应基本技术。二、原理PCR(Polymerase Chain Reaction)即聚合酶链式反应是1986 年由Kallis Mullis 发现。这项技术已广泛地应用于分子生物学各个领域,它不仅可用于基因分离克隆和核酸序列分析,还可用于突变体和重组体的构建,基因表达调控的研究,基因多态性的分析,遗传病和传染病诊断,肿瘤机制探查,法医鉴定等方面。 PCR技术已成为方法学上的一次革命,它必将大大推动分子生物学各学科的研究发展。PCR是一种利用两种与相反链杂交并附着于靶DNA两侧的寡核苷酸引物经酶促合成特异的DNA 片段的体外方法,由高温变性,低温退火和适温延伸等几步反应组成一个循环,然后反复进行,使目的的DNA 得以迅速扩增。置待扩增DNA 于高温下解链成为单链DNA 模板;人工合成的两个寡核苷酸引物在低温条件下分别与目的片段两侧的两条链互补结合;DNA聚合酶在72℃将单核苷酸从引物3'端开始掺入,沿模板5'— 3'方向延伸,合成DNA 新链。由于每一循环所产生的DNA均能成为下一次循环的模板,所以PCR 产物以指

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木瓜蛋白酶的配制

问:我现在正在做神经细胞的培养,听说木瓜蛋白酶的消化作用比较好,购买后发现,不是简单的用三蒸水配制,有哪位高手能告之一二,万分感谢!答:我也用的sigma的木瓜酶,用hepes缓冲液很好溶的,一直没发现溶解度低的问题。其实关于酶的选择,也不能简单的看消化作用如何,还要考虑到实验设计,比如说胰酶的消化效果总体尚可,特点是消化出的细胞电生理状态稳定,膜状态较好,但是胰酶对某些蛋白损伤很大,比如NMDA受体,如果楼主的实验设计是培养细胞后进行NMDA受体电流的记录,那么选胰酶就不是上策;而且从产量上来讲,胰酶并不是最好的。再说木瓜酶,此酶消化的细胞产量好,细胞形态也很好,如果做共聚焦等形态方面的实验,结果非常漂亮。但是此酶消化的细胞电生理特性相比之下不好,膜脆性很大,典型的封接容易吸破难,当然这里指的是神经元,心肌细胞,膀胱细胞等膜比较厚的细胞另论。还有链霉蛋白酶、锯齿肽酶、枯草杆菌蛋白酶、嗜热菌蛋白酶等,均可得到形态完好的神经元,这些神经元具有很长的突起,相差明亮,醋酸荧光素摄取能力强。这些细胞在进行膜片钳操作时极易形成吉欧姆封接,但是很难形成全细胞记录,因为这些神经元膜脆性高而且容易迅速

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基因表达谱聚类分析

对于基因表达谱数据的分析是生物信息学的研究热点和难点。转化为数学问题,分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构,结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题,所采用的方法包括通过可视化进行探索性数据分析( Exploratory Data Analysis )、描述建模 (descriptive modeling) 、分类、聚类、回归和机器学习等。 基因表达谱分析所采用的常用方法是聚类,其目的就是将基因分组。从数学的角度,聚类得到的基因分组,一般是组内各成员在数学特征上彼此相似,但与其它组中的成员不同。从生物学的角度,聚类分析方法所隐含的生物学意义或基本假设是,组内基因的表达谱相似,它们可能有相似的功能。然而,产物有相同功能的编码基因(例如对其它蛋白质有磷酸化作用),不一定共享相似的转录模式。相反,有不同功能的基因可能因为巧合或随机扰动而有相似的表达谱。尽管有许多意外的情况存在,大量功能相关的基因的确在相关的一组条件下有非常相似的表达谱,特别是被共同的转录因子共调控的基因,或者产物构成同一个蛋白复合体,或者参与相同

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