限制性内切酶对DNA消化的一般方案
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1. 限制性内切酶反应一般在灭菌的0.5ml离心管中进行。
2. 20μl体积反应体系如下:
DNA 0.2-1 μg
10×酶切buffer 2.0 μl
限制性内切酶 1-2 u(单位)
加ddH2O 至 20 μl
限制性内切酶最后加入,轻轻混匀,稍加离心,放置于最适温度水浴并按所需的时间温育,一般为37℃水浴消化1hr。
3. 用于回收酶切片段时,反应总体积可达50-200μl,各反应组分需相应增加。
4. 多种酶消化时若缓冲液条件相同,可同时加入;否则,先做低温或低盐的酶消化,再做高温或高盐的酶消化。
5. 酶切结束时,加入0.5M EDTA(pH 8.0)使终浓度达10mM,以终止反应。或将反应管在65℃水浴放置10min以灭活限制性内切酶活性。
6. 如消化反应体积过大,电泳时加样孔盛不下,可加以浓缩:终止反应后,加入0.6体积的5M乙酸铵(或1/10体积3M NaAc)和2倍体积无水乙醇,在冰上放置5min,然后于4℃离心12000g× 5min。倾去含大部分蛋白质的上清液。于室温晾干DNA沉淀后溶于适量TE中(pH 7.6)。
7. 如要纯化消化后的DNA,可用等体积酚/氯仿(1∶1)和氯仿各抽提一次,再用乙醇沉淀。