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蛋白质结构分类数据库

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蛋白质结构分类 (SCOP)数据库详细描述了已知的蛋白质结构之间的关系。分类基于若干层次:家族,描述相近的进化关系;超家族,描述远源的进化关系;折叠子 (fold),描述空间几何结构的关系;折叠类,所有折叠子被归于全α、全β、α /β、α+β和多结构域等几个大类。 SCOP还提供一个非冗余的 ASTRAIL序列库,这个库通常被用来评估各种序列比对算法。此外, SCOP还提供一个 PDB-ISL中介序列库,通过与这个库中序列的两两比对,可以找到与未知结构序列远缘的已知结构序列。

 

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