多糖多酚植物RNA快速提取
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操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)
提示:
第一次使用前请先在漂洗液RW瓶加入指定量无水乙醇!
操作前在裂解液RLT中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1 ml RLT 中加入10μl β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的RLT 4℃可放置一个月。
1. 直接研磨法(推荐):
a. 新鲜植物组织称重后取100mg迅速剪成小块放入研钵(冰冻保存或者液氮保存样品可直接称重后取100mg放入研钵), 加入10体积(1ml)RLT(请确定已加入β-巯基乙醇)和1体积(100μl) PLANTaid 室温下充分研磨成匀浆,注意应该迅速研磨让组织和裂解液RLT立刻充分接触以抑制RNA酶活性。
b. 将裂解物转入离心管,剧烈摇晃振荡15秒,13,000rpm离心5-10分钟,沉淀不能裂解的碎片和结合有多糖多酚的PLANTaid,取450μl裂解物上清转到一个新离心管。
c. 加入上清体积一半的无水乙醇(0.5体积),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
d. 立刻接操作步骤项下3。
2. 液氮研磨法:
a. 取500μl裂解液RLT(已经加入β-巯基乙醇),转入1.5ml离心管中,加入50μl PLANTaid混匀备用。
b. 液氮中研磨适量植物组织成细粉后,取50mg细粉转入上述装有RLT和PLANTaid的离心管, 立即用手剧烈振荡20秒,充分裂解。
在56℃温育1-3分钟有助于裂解植物,但是淀粉含量高的植物不能温育,因为提高的温度可能导致淀粉膨胀。
c. 用带钝针头的一次性 1 ml(配0.9mm针头) 注射器抽打裂解物 10 次或直到得到满意匀浆结果(或者电动匀浆30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高产量。
d. 将裂解物13,000rpm离心5-10分钟,沉淀不能裂解的碎片和结合有多糖多酚的PLANTaid, 将所有裂解物上清转到一个新离心管。
e. 较精确估计裂解物(上清)体积,加入0.5体积的无水乙醇,此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
f. 立刻接操作步骤项下3。
3. 将混合物(每次小于700μl,多可以分两次加入)加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm离心60秒,弃掉废液。
4. 加700μl 去蛋白液RW1,室温放置30秒,12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。
如果DNA残留明显,可在加入RW1后室温放置5分钟后再离心。
5. 加入500μl漂洗液RW(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。加入500μl漂洗液RW,重复一遍。
6. 将吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
7. 取出吸附柱RA,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50μl RNase free water(事先在 70-90℃水浴中加热效果更好), 室温放置1分钟,12,000 rpm 离心1分钟。
8. 如果预期RNA产量>30μg,加30-50μl RNase free water重复步骤7, 合并两次洗脱液,或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍(如果需要RNA浓度高)。
洗脱两遍的RNA洗脱液浓度高,分两次洗脱合并洗脱液的RNA产量比前者高15�30%,但是浓度要低,用户根据需要选择。