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线立体DNA的快速制备

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 线立体DNA是染色体遗传物质,哺乳类动物的线立体DNA为共价闭合环的环状DNA。它变异快、结构相对简单,经母系遗传,对真核生物基因组的结构、复制、转录、调控机理等方面都起着重要作用。近年来被广泛用于近缘种间或种内种群间亲缘关系的研究。
线立体DNA最早是用氯化铯梯度离心方法获得,该法提取的线立体DNA纯度高,但所需 仪器 设备昂贵,实验周期长,限制其在群体遗传研究中的应用。继而出现了酚抽提加酶解、碱裂解加柱层析等方法。
操作方法:
  1. 取50mg新鲜小鼠肝组织,加1ml冷匀浆液,用玻璃匀浆器匀浆,随即以1,000g×3min, 4℃,离心。弃沉淀。
  2. 取上清,12,000g×10min,4℃,离心,沉淀即为粗线立体。
  3. 将沉淀溶于100ml(50mmol/L葡萄糖、10mmol/L Na 2 EDTA ,25mmol/L Tris -HCl pH8.0)溶液中,充分混匀。
  4. 加200ml新鲜配制的(1% SDS ,0.2N NaOH)溶液,轻轻摇匀,冰浴5min。
  5. 再加150ml(3M NaAc pH4.8)溶液,轻轻摇匀,冰浴5min。12,000g×10min,4℃,离心。
  6. 取上清加等体积(酚、氯仿、已戊醇之体积比为24:24:1)溶液,抽提2~4次,界面无白色物质。10,000g×5min离心。
  7. 取上清加2倍体积95%乙醇,室温静置15min,然后12,000g×10min离心。
  8. 弃上清,沉淀用75%乙醇洗涤1次,以12,000g×5min离心。
  9. 弃上清,取沉淀,真空干燥后即得线立体DNA。将其溶于适量的TE 缓冲液 中,-20℃保存。
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