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抗体芯片技术

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蛋白质是一切生命活动的基础,受基因表达的调控,因而以检测样品中的mRNA为基础的cDNA芯片是当今研究中倍受关注的研究手段。但是,由于存在着转录后加工、翻译调控以及翻译后加工等多种调节机制,基因的表达,或者说mRNA的水平并不必然代表蛋白质产物的水平。因此,以微阵列技术对生物样品作整体蛋白质表达分析的蛋白芯片在后基因组时代越来越受重视。抗体芯片(Antibody Microarray,抗体微阵列),是蛋白质芯片的一种,是检测生物样品中蛋白表达模式的新方法。这种新技术使得研究人员可以在一次实验中比较生物样品中成百上千的蛋白质的相对丰度,将极大促进蛋白质组目前的研究状况——因为以现有的技术中对蛋白质进行这种复杂的分析是非常困难的。

Clontech公司第一代的抗体芯片Ab Microarray 380(Cat.No.K1847-1)包含固定在玻璃片基上的378种已知蛋白质的单克隆抗体,可以在一次简单实验中同时检测样品中的378种蛋白质的表达情况,并且可以在一张芯片上对两种样品的表达模式进行比较分析。这使得抗体芯片在毒性实验、疾病研究和药物开发上有广泛的应用前景。Ab Microarray 380芯片上每个抗体都是并列双点以增加结果的可靠性,抗体针对广泛的胞内蛋白和膜结合蛋白,已知参与信号传导、癌症、细胞周期调控、细胞结构、凋亡和神经生物学等广泛的生物功能,因而可以用于检测某一特定的生理或病理过程相关蛋白的表达模式。尽管抗原来自人,但很多抗体可以识别小鼠或大鼠的样品。详细的资料可以上网查询。

芯片上抗体的选择不但根据其特异性,也根据抗体的结合亲和力,在验证实验中特异性低、交叉反应高、或者信号强度低的抗体都被排除,另外所有抗体都经过检验保证得到的信号与抗原浓度有良好的线性相关,那些没有良好的线性剂量关系的抗体都被排除。因此抗体芯片能够检测到样品中很低的pg/ml浓度的抗原。

第一代的蛋白芯片和DNA芯片一样是作为一种定性分析的工具,可用于分析样品之间相关蛋白的相对表达丰度;还可以作为DNA芯片的补充,用于研究蛋白和基因表达之间的关系。

操作流程
抗体芯片并不要求特殊的技能,只要一般常规的操作就可以完成以往极为复杂耗时的工作。整个操作流程包括:从50—200mg组织或细胞、体液中进行蛋白质抽提——用Cy5和Cy3两种不同颜色的荧光分子分别标记两个样品——洗去多余的标记分子——与芯片杂交孵育——扫描分析结果。整个过程从样品制备到结果分析只要一天即可完成,你只要准备好样品、荧光染料、脱盐纯化柱(处理体液样品时用)和荧光扫描仪,其他的 试剂 全部由 试剂 盒提供。

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