免疫系统的个体发生与系统发生

免疫系统的个体发生和系统发生遵循从非特异性免疫到特异性免疫的规律。机体出生后即出现固有免疫，适应性免疫须待出生后接触抗原才能产生。免疫系统的进化中，最早出现的也是非特异性免疫，而淋巴细胞启动的适应性免疫，属免疫系统进化的高级形式。

吞噬细胞参与的固有免疫，在无脊椎动物的原虫和海绵中已经出现；NK细胞和淋巴细胞行使功能则在脊椎动物出现之后；MHC再要晚一点。免疫球蛋白(1e)在脊椎动物中的进化，则先有IgM,后有其他类别。同时注意到，淋巴结的发生最迟，虽始于鸟类，但到哺乳动物才算完备。显然，没有淋巴结就难以大量形成生发中心，没有生发中心也就没有Ig的亲和力成熟和类别转换，因而也就谈不上不同类别抗体的形成。重组激活基因(只AG)插入有颌类脊椎动物基因组之后出现适应性免疫。

从固有免疫向适应性免疫进化的一些关键性事件，不是发生在无脊椎动物和脊椎动物之间，而是出现在脊椎动物的无颌类(如圆口类的八日鳗)和有颌类(如软骨鱼类的鲨鱼)之间，时间大约在四亿五千万年前。期间发生了两件事，一是出现基因组的两次大范围重复；二是携带有重组激活基因(RAG)的转座子(transposon)插入到早期有颌类脊椎动物的基因组。后面将会提到，固有免疫与适应性免疫最重要的区别是：前者受体分子直接由胚系基因编码，多样性受限；后者受体分子经历过基因重排和体细胞高频突变(限于BCR)，由此可产生极具多样性的TCR库和BCR库。由RAG基因编码的重组酶，可以切割DNA的重组信号序列(RSS)，引起V(J)D基因重排。显然，进化上RAG基因的插入，就了淋巴细胞受体结构的多样性，由此产生了特异性免疫应答。可见系统发育中固有免疫与适应性免疫的分界线，在脊椎动物的无颌类和有颌类之间。