预合成的DNA阵列
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预合成的 DNA 阵列
将预合成的DNA探针(通常50~5000bp)固定到如玻璃或者尼龙滤膜等支持物的固相表面上的方法,早在25年前就由EdSouthern设想出来了。由斯坦福大学的PatrickO.Brown实验室所倡导的现代玻璃载片DNA阵列制造技术使得专门进行学术研究的实验室可以用得起DNA阵列。早在1996年,Brown实验室就在因特网上发表了一个建造由自动仪实现的DNA阵列制造方法的详细设想。从那时起产生了许多可实用的商业DNA阵列制造方法。除了商业生产的AffymetrixGeneChipsTM外,这种Brown型的玻璃载片DNA阵列是当今做基因表达谱实验用的最流行的芯片样式。
将DNA阵列印在玻璃载片上的Brown方法包括一个自动微量(纳升或皮升的水平)点样的过程,将DNA探针样品点到一块25mm×76mm×lmm大小的玻璃载片表面上。在玻璃载片的表面上事先覆盖了一层多聚赖氨酸或多胺,这样可以通过静电吸附作用将DNA探针固定在载片的表面上。根据点样针类型的不同和所用精确打印技术的不同,点样点的大小和数目有所不同。多达20 000或者更多的、大小在50~75/um的点可以被点在lcm2 的区域内。美国和其他国家许多的公共和私人研究机构都开发了核心的设施来内部生产玻璃载片DNA芯片,以满足自己的特殊需要。