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【旧贴整理】启动子

丁香园

1307
本版有较多关于promoter的讨论,其中不乏精彩好贴,本人也受益较多,现试着总结归纳了如下,希望对大家有用:
  启动子是DNA分子可以与RNA聚合酶特异结合的部位,也就是使转录开始的部位。在基因表达的调控中,转录的起始是个关键。常常某个基因是否应当表达决定于在特定的启动子起始过程。
启动子一般可分为两类:
  (1)一类是RNA聚合酶可以直接识别的启动子。这类启动子应当总是能被转录。但实际上也不都如此,外来蛋白质可对其有影响,即该蛋白质可直接阻断启动子,也可间接作用于邻近的DNA结构,使聚合酶不能和启动子结合。(2)另一类启动子在和聚合酶结和时需要有蛋白质辅助因子的存在。这种蛋白质因子能够识别与该启动子顺序相邻或甚至重叠的DNA顺序。
  因此,RNA聚合酶能否与启动子相互作用是起始转录的关键问题,似乎是蛋白质分子如何能识别DNA链上特异序列。例如,RNA聚合酶分子上是否有一个活性中心能够识别出DNA双螺旋上某特异序列的化学结构?不同启动子对RNA聚合酶的亲和力各不同。这就可能对调控转录起始的频率,亦即对基因表达的程度有重要不同。DNA链上从启动子直到终止子为止的长度称为一个转录单位。一个转录单位可以包括一个基因,也可以包括几个基因。

核心启动子,基础启动子感念:
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/425976_0.html
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/577063_0.html

启动子预测概况:
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/1677171_0.html

预测启动子软件:
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=2969484&sty=3&keywords=%C6%F4%B6%AF%D7%D3+%D4%A4%B2%E2
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=2893516&sty=3&keywords=%C6%F4%B6%AF%D7%D3+%D4%A4%B2%E2
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=2877756&sty=3&keywords=%C6%F4%B6%AF%D7%D3+%D4%A4%B2%E2
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/1512034_0.html
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/961367_0.html
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/629920_0.html

启动子分析软件分类:
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=73&id=2288884&sty=3&keywords=%C6%F4%B6%AF%D7%D3+%D4%A4%B2%E2

启动子分析软件比较:
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/974257_0.html
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/974800_0.html

基因和启动子识别—PPT:
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/243964_0.html
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/243968_0.html

实例:
如何找到bcl-2的启动子序列:
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=3275623&sty=1
p16基因的启动子序列该查找:
http://www.dxy.cn/bbs/thread/2760774
CMV启动子与U6启动子:
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/858663_0.html
肝组织特异性启动子:
http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/551794_0.html
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