【讨论】3‘侧翼区(3‘flanking region)的功能

3’侧翼区（3‘flanking region, 不是3'UTR）可能有哪些功能呢？大家讨论一下好吗？

这是个什么概念？？
一般说flanking 都要对应一个site吧？？

3' flanking region: A region of DNA which is not copied into the mature mRNA, but which is present adjacent to 3' end of the gene. It was originally thought that the 3' flanking DNA was not transcribed at all, but it was discovered to be transcribed into RNA, but quickly removed during processing of the primary transcript to form the mature mRNA. The 3' flanking region often contains sequences which affect the formation of the 3' end of the message. It may also contain enhancers or other sites to which proteins may bind.

谢谢版主解答。看了几篇文献，找了两个针对 “It may also contain enhancers or other sites to which proteins may bind.”的例子，增强与抑制各一例，供大家参考。
一个是EPO基因，在其polyA位点下游120bp处的一段150bp的片断具有增强子的作用，并且是位置和方向依赖性的，在缺氧的条件下，这一片段能够使EPO基因的表达升高15倍。（ JBC, Volumn 266: 15563-15566)
一个是人生长激素基因，在其3‘侧翼区（polyA下游大约100多bp处）存在一段起沉默作用的Alu重复片段，可抑制hGH的表达。(Molecular Endocrinology 20: 2559-2575)

想想也是，DNA在体内并不是一条直线，在三维结构下，3’端的结构影响基因的转录也是很正常的。不过还要多看些文献，总结一下一般在多远范围内，像是这两个例子距离基因末端其实很近的，不像有的5‘的增强子，甚至可以距离转录起始点几十kb。

3‘-utr有功能的，有做增强子鉴定的。还有一些是关于mirna作用靶点的研究更为热点。
promter和3'-utr之间功能有交互作用的，好像可以通过3c实验验证（这个是听师姐说过她要做的）。
如果以3'-utr为关键词，还是能搜索到很多文献的。
大家共同学习总结吧

3'UTR 与3‘flanking region是两个概念，不要搞混淆了。---版主