请收好这款 SCI 必备文献检索神器
丁香园
科研生活中,总会充满多种烦恼,比如:
课题设计前,如何快速寻找确定研究热点,这从一开始便决定了我们科研层次以及发表文章的影响因子,比如单纯做 microRNA,也许五分已经不能再多了;而研究 microRNA 上游的 LncRNA 或者外泌体,只要机制深,30 分没问题。
课题确定后,首先要了解该领域的前期研究,那谁会是这个领域的研究专家呢?如何快速查找相关内容的文献呢?Pubmed 收录如此之多,筛选文献就如大海捞针,检索方式的高效与便捷显得尤为重要。
而当课题结束了,我该投什么样的杂志?一般很多杂志都会有自己喜好,摸清口味很重要。
不管什么样的问题总会有解决的办法,今天就为大家介绍一个神器的网站:GoPubMed。
GoPubMed 是德国 Transinsight 公司和德国德累斯顿大学合作开发的以基因本体 GO 以及医学主题词表(MeSH)作为检索词,以 Pubmed 为基础的二次文献分析工具,即通过输入检索词提交给 pubmed,然后利用生物信息学相关知识对搜索结果进行提炼、分析,使文献检索更快捷。
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近年来,lncRNA 研究比较火热,我们可以先通过检索相关的文献,了解相关领域的研究内容以及发展趋势。打开 GoPubMed 首页,输入关键词 [lncRNA],网站会自动进行识别并提供相关的检索词,以RNA,Long Noncoding [mesh] 形式进行检索。
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检索结果左侧栏,主要是文献的分类列表,按检索内容、杂志、出版日期、国家、地区、作者等进行分类。可以根据自己的检索目的进行勾选,缩小检索范围。
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在这里,我们重点强调一下检索内容一栏,网站设计了多级分类检索词进行限定,可以帮助我们快速的锁定检索结果。
1. 分类列表:点击下拉菜单后,网站会出现相关结果,如 LncRNA 相关生物学途径、信号通路、肿瘤、蛋白、分子功能等文章分类,比如点击 [Disease]-[with Disease] 或者 [without Disease] 进行限定,相当于布尔逻辑运算。
2. 不同肿瘤类型分类:点击 [Tree] 一栏可以发现网站进一步以不同肿瘤类型,如眼部疾病、神经系统疾病、内分泌疾病等进行进一步的筛选。
3. 或者通过 [statistics] 查看不同疾病相关研究案例统计。比如 LncRNA 相关的癌症发生文献约占 1387 篇,乳腺癌相关研究占 754 篇,通过这样的分类统计,我们可以进一步限定检索范围与领域。
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在网页的正中栏,可以查看检索后文献,点击显示摘要内容,有助于我们快速阅读内容,进行文献的查找。
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网站最大的功能应该是通过对检索结果数据进行统计分析。
1. 第一栏是发表文章时间、国家以及地区的统计,有助于我们快速了解研究课题近些年发表文章数量,哪个国家研究能力比较强等。
2. 第二栏式发表期刊、关键词以及作者姓名。此处划重点:通过期刊排名,我们可以了解什么样的杂志接受这方面的研究比较多、投稿接收的可能性会更大一点;通过主题词排名,可以帮助我们了解相关的热点研究;通过作者排名,我们可以发现该领域的研究前辈,既往发表过几篇论著,他们的研究技术已经相对成熟,在课题设计或者学习实验方法上就可以多参考、多学习。
3. 第三栏是不同年份文章的发表数目,我们发现自 2013 年起,文章发表数量迅速上升,说明大家逐渐关注到该领域,有助于我们更好的判断该该领域将来的发展趋势。
通过 GoPubMed 的分析,我们可以快速了解研究热点、研究创新点、研究趋势以及投稿适合杂志期刊,相比于 PubMed 更直观,更有条理,提供了一种全新的检索方式,方便科研人员高效检索。