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如何在论文中画出漂亮的插图?

生物学霸

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经常看到别人论文中画出各种绚烂的插图,是用什么软件画出来的呢?分享一下我的绘画思路和常用软件。

1. 绘画思路
  • 论文插图终归是内容导向,数据少/逻辑简单很难画出炫酷的图。
  • 专业图尽量用对应的专业软件画。
  • 大力出奇迹,插图最终效果跟投入的时间成本(学习软件+绘制+调试)成正比,只要耐心好学多尝试,哪怕 Office 系列也不会让你失望。
  • 绘图最重要的是专业性,其次关注「矢量+配色+字体+布局」。
  • 有时瓶颈在于思路而非工具,做科研的多浏览 Nature 和 Science,有很多值得借鉴的绘图方案。
  • 有精力就再去学学 AI 和 PS ,后期如虎添翼。

2. 常用软件
1. gnuplot
刚完成的硕士论文主要用了 LaTeX+gnuplot,gnuplot 胜在免费、绘图效果清爽、专业认可,输出终端多样化,插值优化做得也不错。用下来感觉基本可替代 Matlab 系和 Origin,学习成本不低。
图 1:简单的 2D 图
图 2:简单的 2D 图

图3:简单的 2D 图

图4:复杂的 3D 图

2. PowerPoint
只有想不到,没有画不了。比起其他软件现成的模型模块,用 PowerPoint造轮子的优点在于细节由自己掌控。学习成本低,个人发挥空间大。
用简单的形状和线条拼接,自由度高,细节突出(恩,我就是不习惯用 Visio)。这张构图有参照对象,绘图时间控制在半小时左右。
图5:反应器示意图

PowerPoint 作图方式胜在可视化、直观、简便,可量产各种扁平化示意图。
图 6:原理示意图
Nature、Science 上的插图偏立体风,通过多图形多色块套用和「填充效果」中的「渐变」即可实现(参数怎么调很考究)。下面这张只花了十分钟,要进一步改进可细化 DNA 结构,再给通道中的截面加上多重线性渐变。
图7:DNA 结构图

如果需要用多色块表达内容,在协调颜色搭配时 Office 的优势尽显(用命令行和 RGB 代码调试)。
图 8:彩色信息图

下面这张幻灯片用 Origin 作图 + PowerPoint 拼装,内容不打码,论文已发 Metabolic Engineering。
图 9:多内容拼接

3. Circos
最近新上手的利器,为绘制全基因组特征圈图而生的信息图软件。可用来画各种圈状信息图,功能强大令人咋舌,配色美观耐看(开发者毕竟是专职摄影师)。不太方便的是需要安装 Perl 运行,学习成本中等,国内教程少。
图 10:基因组信息图

4. SnapGene
画质粒的软件用过不少,SimVector/Plasmid Processor/pDRAW32/Gene Construction Kit/Ape 等等。从功能集成和输出效果来看,还是 SnapGene更胜一筹,操作设计也做得很赞,学习成本低。
图 11:质粒谱图

5. 化学式绘图软件
按学习成本排优先级,依次是:ChemDraw > chemfig 包 > PowerPoint。下面第一张分子式是我组会报告上画的,键角键长不符合正式投稿的美国化学会(ACS)期刊的化学式统一格式—— ACS 1996 标准。使用 ChemDraw 的话直接在「file」或者「object」中选择「Apply object settings from」选项则可一键改成 ACS 1996 和其他一些杂志要求的标准格式。

图 12:分子式图

图 13:复杂分子式图

本文作者:@隐生宙,经其授权转载

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