5 年病毒包装经验总结
生物学霸
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在做病毒包装实验中,有科研工作者常遇到:用同样一个病毒载体系统进行病毒包装实验,为什么有人做的很好,次次成功。有人却是时常做不出来,稳定性很差,不是滴度低就是根本不出毒?
腺病毒 or 慢病毒?
慢病毒可以插入细胞基因组,稳定表达,持续时间长。 包装周期短(一般要两个月),感染效率相对于腺病毒要低很多。不能扩增,一次包装的病毒用完后如果再需要只能重新包装,成本高。一次包装所得到的的病毒滴度也相对较低(10 的 8 次方 pfu/ml),不大适合直接用于动物实验。
腺病毒感染效率高,很多细胞都能达到近 99%。纯化后的腺病毒可以直接进行动物活体注射。可以在体外扩增,每次使用完后,可以自己用包装细胞进行扩增,节约成本。一次包装所得到的滴度较高(纯化后为 10 的 11 次方 pfu/ml,未纯化的为 10 的 10 次方 pfu/ml)。不整合到基因组,无法稳定表达。
表达时间相对于慢病毒较短(两三周这样)。包装腺病毒的周期会比慢病毒长一些(一般要两个半月),因为腺病毒包装过程相对较繁琐。
总体来说,对于很多实验来说,选择腺病毒优势更大,并且很多情况下腺病毒是可以替代慢病毒来进行实验。
病毒包装的关键点
病毒包装的几个关键节点就是细胞因素、载体系统(尽量使用成熟的商业化载体系统)、构建重组的质粒正确与否、质粒抽提纯化情况、包装转染控制(24、48 小时的细胞及荧光状态判断)、目的基因对病毒包装影响 (基因大小、序列情况、蛋白功能毒性等都会影响到是否能包装成功)。
如何提高病毒感染效率
病毒感染效率主要和三方面有关,病毒本身的滴度,目的细胞种类以及个人操作问题。在这里我先把操作问题排除,你若想提高病毒感染效率,可以先提高病毒滴度,在感染的过程中适当的加大病毒感染量或者通过多次加入病毒提高感染率。其次,你也可以加一些辅助感染试剂来提高病毒感染率的,如 polybrene。另外,你要根据不同的目的细胞加入合适的病毒量,这样才能更精确的提高病毒感染效率。
293T 细胞有关
293T 细胞长的比较快,传代时也容易从壁上脱落,不需要怎么吹打,保险起见,在消化时还是要尽量吹打均匀。此外传代时吹打的细胞液,每个平皿里的细胞也要铺的均匀,并要及时换液传代。
293T 细胞包装慢病毒时,转染方法优先选择阳离子脂质体方法。氯化钙法转染效率相对低,出毒效率相对低。且对氯化钙法对 pH 值要求很苛刻,差一点都不行。阳离子脂质体法效果比较好,但常规使用的 Lipo2000 细胞毒性大,有钱的可以使用低毒性的 Fugene HD,钱少的可以选用其他公司的 Lipofiter 阳离子脂质体产品,效率和 Lipo2000 差不多,毒性基本没有。
病毒浓缩有关
病毒一般可以收两次,可以在 48 h 和 72 h 各收一次。如果你不想麻烦浓缩病毒的话,也可以不浓缩,直接将收集的病毒上清作为要感染的细胞的培养基,但是可能效果会不太好。并且一般收病毒时,培养基的营养已经损耗了很多,那样直接培养感染细胞会损害细胞,所以建议还是进行浓缩后再感染。
如何提高腺病毒的活性?
提高腺病毒的活性,关键应该是在病毒包装过程和扩增过程。纯化过程只是去掉有缺陷的病毒和细胞碎片等容易引起机体免疫反应的过程,如果扩增的病毒滴度高,那么纯化后就会更高的。
纯化后病毒如何保存?
纯化后的病毒用无血清的 DMEM 保存就可以了,一般放在 -80 度进行长久保存。如果收集的上清不想立即纯化可先放在 -80 度,等下次收集的一起纯化。目的蛋白在包装细胞中或者滴度测定细胞中会表达的,滴度测定就是根据目的蛋白表达情况来进行操作的。
本文作者:hanbio
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