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单聚及二聚核小体的纯化实验

最新修订时间:

材料与仪器

寡聚核小体 中等或大的寡聚核小体成分
CaCl2 MgCl2 微球菌核酸酶 EDTA 甘油梯度缓冲液
超速离心机 聚异质同晶管 梯度制备装置

步骤

1. 解冻约 1 ml 寡聚核小体(约 1~2 mg/ml 比较理想),预热到 30℃。



2. 加入 100 mmol/L CaCl2 至终浓度为 1.5 mmol/L, 1 mol/L MgCl2 至终浓度为 3.5 mmol/L。


3. 加入 50 U/ul 微球菌核酸酶至终浓度为 0.1 U/ug 多聚核小体,30℃ 消化 10 min。


4. 加入 0.5 mol/L EDTA 至终浓度为 15 mmol/L 终止反应。


5. 4℃,10 000 g 离心 30 S,沉淀不溶物质。


6. 在 0.5 in×2. 5 in 聚异质同晶超速离心管中铺制4. 7 ml 线性梯度,上层为 10% 甘油梯度缓冲液,下层为 30%。


7. 将 0.5 ml 消化反应液放置在梯度上,4℃,100 000 g 离心 18 h (如 Beckman SW55 转子 35 000 r/min)。


8. 收集梯度, 每 5 滴流出液回收一管,大约有 24 管。


9. 进行琼脂糖凝胶电泳分析各流出液。


10. 如有需要,将得到的单聚和二聚核小体组分进行浓缩,但最后用 10% 甘油梯度缓冲液进行透析)。4℃ 保存 1 个月以上,或在液氮或干冰上速冻,在 -80℃ 保存两年以上。

来源:丁香实验

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