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合成的小分子配体 R S L l 诱导的体外基因调节

相关实验:基于脱皮激素受体的被合成小分子配体导的高灵敏基因调节系统实验

最新修订时间:

材料与仪器

步骤

合成的小分子配体 R S L l 诱导的体外基因调节

材料

试剂
氨 苄 青 霉 素(100 mg/ml 水溶液)

小 牛 血 清(Invitrogen)

要转染的细胞

二甲 基 亚 讽(D M S O ; Sigma-Aldrich)

配体: R S L l (5mmol/L 在 DMSO 中,室温下稳定, MW 382. 5) ( New EnglandBioLabs)

脂质体 2000 (Invitrogen)

突光检测系统(Bright-Glo; Promega)

核酸

可诱导的表达载体: pNEBR-Xl (NewEnglandBioLabs)

标准质粒: pRL-CMV (最佳的,见 步 骤 2a) (Prom ega)

受体载体: pNEBR-Rl (NewEnglandBioLabs)

细 菌(XLl-Bkie 或者其他的)含有质粒,培养在 L B 培养基中,加 100ug/ml 的氨苄青霉素。用于转染的质粒去内毒素,柱 式 纯 化(如 来 自 QIAGEN 的质粒抽提小试剂盒)或 者 CsCl梯度方法是合适的。

Opti-MEMI 培 养 基(Invitrogen) 或 者 无 血 清 培 养 基

PLB 裂 解 液(Promega)

TRIZOL 试剂 (Invitrogen) 或 RNeasy Kit (QIAGEN)

仪器

细胞培养板(本例中为 48 孔板), 96 孔不透明检测板(VWR 或 Fisher Scientific)

微型离心管(1.7 ml)

微盘式冷光仪(Dynex Technologies, Inc.) 用于突光检测

平面振荡器

方法

转染

RheoSwitch系统与各种转染试剂是兼容的 ,包 括 脂 质 体 2000 (Invitrogen)、F u G E N E 6 (基因治疗系统) 、 SuperFect (Q I A G E N )、磷酸钙沉淀物。电穿孔和细胞核转 染 技 术(A m a x a B i o s y s t e m s) 能被使用。能 在 多 种 细 胞 培 养 板(96 孔板 、 48 孔 板 、24 孔板)上以较大的规模进行转染。在这里 ,脂 质 体 2000 用 来 在 48 孔板转染细胞,用 p N E B R -R l 作为受体载体, p N E B R -X l 含有虫萤光素酶作为可诱导的表达载体。程序可以根据使用情况修改。

1.如果使用贴壁细胞,在转染前一天接种细胞, 250M1 的培养液不加抗生素,这样在转染的时候细胞的汇合度为 80 % 〜90 % 。在含抗生素的培养基中使用 Lipofectamine 2000 会引起细胞毒性。

2 . 根据下面描述的方法准备 6 个孔的转染混合物,重复每个转染实验,统计学分析最后的结果。

a. 在 1.7ml 微 型 离 心 管 中 ,加 160ul 的 Opti-MEMI (或 者 无 血 清 培 养 基), 加500ng 受 体 载 体(pNEBR-R l) 和 1.5 Mg 可 诱 导 的 表 达 载 体(pNEBR-X l) , 稀释 RheoSwitch 系统质粒。

如果需要的话,可以加人由组成型启动子驱动对照报道基因,如海肾萤光素酶或者 lacZ,可以用于在孔之间校正转染效率和检测。加 人 50ng 校正质粒到微型离心管中。

b. 在另一个 1.7ml 微型离心管中加 6^1 的 Lipofectamine 2000 到 160ul 的 OptiMEMI (或者无血清培养基)中。

c. 室温下 5 min,合并稀释的 DNA 和稀释后的 Lipofectamine 2000,轻轻揽摔,静置 20min。

3 . 每个孔(共 6 个)加入 50jlJ 的转染混合物。

4 . 细胞板拿到培养箱中。

为优化转染效率,对不同的细胞株需要探索最佳的 DNA 的量以及 DNA 与 Lipofectamine2000 的比例。

配体诱导基因的表达。根据要得到的基因诱导水平,如下进行配体浓度试验,决定最佳的配体数量。

5. 5mmol/L R S L l (在 D M S O 中)储存液稀释成为不同的工作液。建议工作液浓度为0.8、4、20、100、 500umol/L 。

6.在细胞板孔培养液中每组工作液稀释 1000 倍(形成浓度为 0.8、4、20、100 和500nmol/L RSU ),混匀。准备要求体积的配体培养液。

7 . 在转染 4〜6 h 之后,从转染的细胞板孔移走培养基,加 250ul 的包含不同浓度配体培养液。

8 . 细胞板拿到培养箱。

目前的转染混合物不影响配体诱导基因的表达能力,并 且 ,在大多数情况下,没有必要从细胞板孔中移走含有转染混合物的培养液。当进行大量的转染检测时这是特别有用的。在这种情况下,上面的方案可做如下修改。

9 . 准 备 含 2 倍 希 望 浓 度 的 配 体 培 养 液(如 0.16nmol/L、 8nmol/L、 40nmol/L、200nmol/L、 lumol/L RSLl 配体)。

10. 重复转染见前面的步骤 1、 2。

11. 接种转染混合物形成 DNA-Lipofectamine 2000 复合物后,从细胞板孔中移走培养液,添加 75ul的新鲜培养液。

12. 每个细胞板孔分配 5 0ul的转染混合物,轻轻振荡细胞培养板(每孔共 125ul 的培养液)。

13. 加 125 ml步骤 9 准备的含 2 倍稀释浓度配体的培养液。

配体会被稀释到原始浓度的一半。不需要在步骤 12、 13 间培养细胞。
H . 轻轻振荡细胞培养板,拿到培养箱。

检测诱导的基因表达

在 mRNA 水平,基因的诱导表达能在配体处理后的几个小时内被检测,或者用一个高灵敏度的方法,如化学爱光或者绿色荧光蛋白(G F P ) , 在蛋白质水平检测。配体处 理 24 h 后 ,表达量足够大,在 48〜72 h ,表达量达到最大。没有必要更换培养液或添加更多的配体 (除非培养液被换掉)。

15.在 mRNA 7jC 平检测诱导基因,从细胞中分离总的 RN A 然后进行 N orthern 杂交,或者反转录 RN A 然后进行实时荧光定量 PCR。用于转染的板的格式根据 R N A 的分离方法选择。分离 RNA,使 用 TRIZOL 试剂或 RNeasy Kit。
16.根据蛋白质是细胞内表达还是分泌型的,能检测蛋白质表达和(或)计数完整的细 胞 ,细胞抽提物,或者细胞培养液,检测方法包括内在荧光蛋白(例如, G F P 和它 的功能蛋白,在完整细胞中诱导能被看到) ,化学发光、 W e s t e r n 杂交、 E L I S A (酶连免疫反应)和其他的功能检测。通过从细胞板孔中移去培养液准备细胞抽提 物,添加与要进行的溶酶产物检测不矛盾的裂解液。对于用在方案中的荧光表达载 体,如下检测诱导: a•通过添加IOOjLtl裂解液到细胞板孔溶解细胞,在平板振荡器上振荡i5min。 b. 移取20M 1溶酶产物到白色不透明96孔板中。 c•分配50fxl的荧光底物到培养板孔中,然后读取细胞板在微盘式冷光仪下。 样本检测的结果的萤火虫萤光素酶的报告如图4 。 80 000 - 70 000 - 厂s 60 000- ^ 50 000 - 燊 40 000 - 釤 30 000 - 毋 20 000 - 10 000 - 0 _ 图 4. 4 8 孔 板 中 的 NIH-3T 3 细胞在不同浓度的配体;R S L l作 用 48h 后 ,萤火虫萤光素酶报告。

来源:丁香实验

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