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基本方案2 四重 PCR 的引物延伸法

相关实验:使用引物延伸荧光偏振探测法的高通量基因分型实验

最新修订时间:

材料与仪器

目的基因组DNA
10XPCR扩增缓冲液 Taq DNA 聚合酶 4dNTP 混合液 PCR 引物混合液 AcydoTerminator混合液
384孔透明 PCR 板和黑色 PCR 板 多管移液器或液体操作工作站 384孔 PCR 板封口垫 带加热盖的热循环仪 FP 读板设备

步骤

1•用多管移液器或液体操作工作站为384孔透明P C R 板每孔加8 M 0. 8叫/一的基因组 D N A 。孔板于室温下用benchtop离心机以500g短暂离心,接着室温下空气干燥过 夜。将孔板叠放并用塑料膜包裹保存于真空干燥器备用。 2 . 每 个 384孔板配制一份母液,包含: 45〇 4 IOX P C R 缓冲液; 630|ul 25mmol/L M g d ; 18Cyl 2. 5mmol/L 4 d N T P 混合液; 18jlJ 5U/jnl Platinum Tag D N A 聚合酶; 522“ H 20 。 含干燥的基因组D N A 的每孔加4^1母液。 3 . 加 7jul P C R 引物混合液到P C R 反应混合物。用封口垫封上孔板,室温下以500g短 暂离心。 用下面的热循环条件进行热启动P C R 。 1 个循环: 2min 95〇C (变性) 3 5个循环: IOs 92〇C (变性) 4 0 个循环: 20s 58〇C (复性) 30s 68〇C (延伸) 1 个循环: IOmin 68°C (最后延伸) 最终步骤: 无限 4°C (维持) 5 . 用 1 8 0 0 M 水稀释20(V 10 X Exo-SAP-IT P C R 纯化剂,力 W jlJ 这 种 I X 反应物到P C R 产物混合液。用封口垫封上孔板,室温下以500g短暂离心。 37°C温 育 lh。 8(TC加 热 15min灭活酶。反应混合物降温至4°C并维持至下一步骤。 6 . 在 一 个 3 8 4 孔 黑 色 P C R 板 中 每 孔 加 IOjlJ 〇 .Zjamol/L S N P 引物。将 3jul处理过的 P C R 产 物 ( 来自第5 步)移入孔板上的各孔。
7 . 准备一份含下列试剂的母液: 9004 10X反应缓冲液; 11. 25^1 AcycloPol D N A 聚合酶; 76. 5jul AcycloTerminator 混合液; 2162. 25/J H 2CX 每孔加7M 1到第6 步准备的孔板。用封口垫封上孔板,室温下以500g 短暂离心。 8. 用下面的热循环条件进行引物延伸反应。 1 个循环: 2min 95°C (变性) 2 0 个循环: 15s 95°C (孪性) 30s 55°C (延伸) 最终步骤: 无限 4°C (维持;避光) 9.依照相应生产商的指示,使 用 Victor2、 Analyst、 Ultra或 EnVision等 F P 读板设备

来源:丁香实验

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