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中性聚丙烯酰胺凝胶电泳

相关实验:中性聚丙烯酰胺凝胶电泳

最新修订时间:

材料与仪器

DNA 样品
丙烯酰胺 亚甲双丙烯酰胺 过硫酸铵 乙醇 凝胶载样缓冲液 KOH 甲醇 硅化液 TBE 电泳缓冲液 TEMED
夹子或铁皮制纸夹 电泳装置 玻璃板 梳子和间隔片 凝胶密封带 凝胶测温条 微量移液器及拉长的塑料洗头 凡士林 注射器

步骤

一、材料

1. 缓冲液和溶液

丙烯酰胺:亚甲双丙烯酰胺(29:1) (%, m/V) 

过硫酸铵(10%,m/V)

乙醇

6X 凝胶载样缓冲液

KOH/甲醇

硅化液(如 Sigmacote 或 Acrylease)(可选或不选)

5X TBE 电泳缓冲液

TEMED

2. 核酸和寡核苷酸

DNA 样品

3. 专用设备

夹子或铁皮制纸夹(6~8 个,2 inch/5 cm 宽)

电泳装置,玻璃板,梳子和间隔片

凝胶密封带

凝胶测温条(可选或不选)

微量移液器及拉长的塑料洗头

凡士林

注射器(50 ml)

二、方法

安装电泳装置和配制凝胶溶液

1. 必要时可用 KOH/甲醇清洗玻璃板和间隔片。

2. 用温热的去污剂溶液洗涤玻璃板和间隔片,再充分漂洗,先用自来水,再用去离子水。应拿取玻璃板的边缘部分或戴手套操作,以免手上的油脂残留在玻璃板的工作面上。用乙醇冲洗玻璃板,并将其置于一边晾干。

3. (可做可不做)其中一块玻璃板的一面用硅化液处理(如 Sigmacote 或 Acrylease): 在化学通风橱内,将玻璃板放于一叠纸巾上,倒少量硅化液于其表面上,用 Kimwipes 纸巾涂抹均匀,然后用去离子水冲洗、纸巾擦干。

4. 安装玻璃与间隔片:

(1) 将较大的(不带凹口)玻璃板平放在实验台上,在玻璃板的两侧将间隔片平行置于其边缘放妥。

(2) 用凡士林轻涂以助于间隔片在后面的操作中保持原位。

(3) 将内板(带凹口的玻璃板)在间隔片上放妥。

(4) 用夹子或铁皮制纸夹将玻璃板夹在一起,将整块玻璃板的两边及底部用凝胶密封带封紧,形成不透水密封。

5. 根据玻璃板的大小和间隔片的厚度计算所需凝胶的体积。制备适宜浓度的凝胶溶液。

6. (可做可不做)将所需用量的聚丙烯酰胺:亚甲双丙烯酰溶液放于一干净的带侧臂的烧瓶中,加入磁力搅拌子,抽真空脱气。开始脱气应温和一些,并边脱气边旋转烧瓶直至不再有气泡溢出为止。

灌制凝胶

7. 下面的操作需要戴手套,在托盘上进行,以免溅出的丙烯酰胺:亚甲双丙烯酰胺溶液洒在实验台上。动作应迅速,于丙烯酰胺聚合前完成。

(1) 每 100 ml 丙烯酰胺:亚甲双丙烯酰胺溶液中加入 35 μl TEMED, 轻轻旋转混匀溶液。

(2) 用 50 ml 注射器吸取凝胶溶液,调转注射器,排净进入针管的空气。将注射器的针头插入两块玻璃板之间的空隙,注入丙烯酰胺溶液,几乎注满该空隙。

(3) 将玻璃板斜靠在试管架上,与实验台面成约 10° 角。

8. 立即将合适的梳子插入到凝胶中,小心勿使梳齿下留有气泡。梳子的顶端应略高于玻璃板的上沿。用铁皮制纸夹将梳子夹紧,使其就位。必要时,用剩余的丙烯酰胺溶液完全充满模具。确认无丙烯酰胺溶液从模具里漏出。

9. 丙烯酰胺于室温聚合 30~60 min。若凝胶回缩明显,应补加丙烯酰胺:亚甲双丙烯酰胺溶液。

10. 聚合完全后,用 1X TBE 浸润的纸巾包绕梳子和凝胶的顶部。然后用 Saran Wrap 膜密封整块凝胶,4℃ 保存,直至使用。

11. 当准备好进行电泳时,在梳子的周围及其顶部喷些 1X TBE 缓冲液,从聚合的凝胶中小心取出梳子。用注射器吸取 1X TBE 冲洗加样孔。用剃须刀或解剖刀除去凝胶底部的密封胶带。

上样与电泳

12. 将凝胶放入电泳槽中,用大号铁皮制夹子夹住其进缘或用装置本身的夹子固定。带凹口的玻璃板应面对缓冲液槽向里放置。

13. 用配制凝胶溶液同一批次的 5X TBE 配制电泳缓冲液灌满缓冲液槽。用一根弯头巴斯德吸管或注射器针头排除藏匿于凝胶底部的气泡。

14. 用巴斯德吸管或注射器再次吸取 1X TBE 冲洗加样孔。将 DNA 样品与适量 6X 凝胶载样缓冲液混合,用 Hamilton 注射器或带有拉长的塑料吸头的微量移液管加入加样孔。

15. 将电极与电源相连(正极接下槽),打开电源,进行电泳。

16. 电泳至标准参照染料迁移至所需位置。关闭电源,拔掉插头,弃去电泳槽中的电泳缓冲液。

17. 卸下玻璃板,用解剖刀或剃须刀片除去凝胶密封胶带。将玻璃板放在实验台上 (硅化的玻璃板在上面)。用间隔片或塑料楔将上面的玻璃板的一角撬起。检査一下凝胶仍应附着在下面的玻璃板上。将上面的玻璃板平稳的移开,去掉间隔片。

18. 检测聚丙烯酰胺凝胶中 DNA 条带的位置。

来源:丁香实验

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