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用蛋白质组学方法对海洋环境中过氧 化物酶体增殖污染物进行风险评估实验

实验分类:

蛋白质实验

最新修订时间:

简介

由于海洋污染可影响人类和其他自然物种,因此海洋环境的污染越来越受到人们的关注。应用蛋白质组学方法对海洋污染进行监测是评估环境污染对生态影响的一种新方法。生活在岸边和河湾的水生生物特别容易接触到各种污染物,其中包括过氧化物酶体增殖污染物(peroxisome proliferating pollutant)。但是,特殊的过氧化物酶反应和普通的生物标记反应都会受到生物或非生物因素的影响。而利用蛋白质组学技术可以在二个实验中同时评估成百上千的蛋白质,从而克服这一缺陷。应用这一技术,我们通过双向 电 泳 技 术 分 析 了 贻 贝 功 .)消化腺过氧化物酶体的蛋白质组,并比较了受污染的样本和对照组的双向电泳图谱。上调和下调的蛋白质构成了与暴露于过氧化物酶体增殖污染物相关的蛋白质表达特征标签(protein expression signature, PES)。这一方法可得到高度重复的图谱,可适用于实验室或野外实验。
作者:马丁,本实验来自「环境基因组学实验指南」

来源:丁香实验

操作方法

用蛋白质组学方法对海洋环境中过氧 化物酶体增殖污染物进行风险评估实验

一、材料 1.动物 一 年 中 的 问 一 时 间 在 不 同 米 样 点 潮 落 时 采 集 贻 贝 Lmk,35〜45 mm 长)或者是贝壳长度为 5 cm 的 紫 贻 贝 edwfe)。其中一个采样点是有记录的清洁区域,在这里采集到的动物作为对照。 2. 富含过氧化物酶体组分的分离 在分离过程中所有缓冲液都需新鲜配制,并在冰浴中操作。

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