核糖核酸酶保护实验(Ribonuclease protection assay,RPA)是近十年发展起来的一种全新的mRNA定量分析方法。其基本原理是将标记的特异RNA探针(32P或生物素)与待测的RNA样品液相杂交,标记的特异RNA探针按碱基互补的原则与目的基因特异性结合,形成双链RNA;未结合的单链RNA经RNA酶A或RNA酶T1消化形成寡核糖核酸,而待测目的基因与特异RNA探针结合后形成双链RNA,免受RNA酶的消化,故该方法命名为RNA酶保护实验。对于32P标记的探针,杂交双链进行变性聚丙酰胺凝胶电泳,用放射自显影或磷屏成像系统检测被保护的探针的信号;对于生物素标记的探针,杂交双链经过变性聚丙酰胺凝胶电泳后电转移至尼龙膜,采用链霉亲和素-辣根过氧化物酶(Streptavidin-HRP)和化学发光底物与膜上biotin标记的探针结合,X射线胶片或化学发光图像分析仪检测杂交信号。
核酸酶保护
1. 在一个高压过的微量离心管中建立20 μl 的反应复合物如下:
(1)4 μl 5×转录缓冲液
(2)1 μl 200 mmol/的3NTP混合液
(3)10 μl [α-32P]CTP
(4)1 μl 胎盘核酸酶抑制剂
(5)1 μl 1 mg/ml 模板DNA
(6)1 μl 噬菌体RNA聚合酶
(7)SP6 RNA聚合酶反应时在40℃保温3