除 cDNA 微阵列外,基于尼龙膜支持物的 cDNA 宏阵列方法是又一被广泛应用的大规模基因表达数据的收集方法。从新基因的发现到基因表达谱的分析, cDNA 宏阵列被应用于分子生物学研究领域的各个方面。尽 管 cDNA 宏阵列的点阵密度低于微阵列,但由于应用灵敏度较高的同位素标记的 cDNA 探针,宏阵列仍适用于检测大规模基因表达。在 mRNA 表达差异较大的器官中,比如植物分生组织和动物脑部, cDNA 宏阵列是获得基因表达谱的适用方法。本章将介绍 cDNA 宏阵列杂交的应用方法,内容包括 :如何制备不同规模的宏阵列,如何分析实验结果,以及如何决定基因表达数据的统计学差异的显著性。
作者:马丁,本实验来自「环境基因组学实验指南」
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验##一、 cDNA 宏阵列的样品制备
培养基: I : 2 (V7 V ) Gamborg B5 培 养 基(GibcoBRL, Rockville, MD), I : 1000(V /V ) Hyponex肥 料(Hyponex 10 : 5 : 10; Hyponex Japan, Osaka, Japan), 1 % 鹿糖 ; pH调 至 5. 7。
##二、 cDNA宏阵列探针制备(见注